Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_05428 and BL03347

See Amino acid alignment / Visit BSNT_05428 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:27:34
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_05428___lytB.1.5803.seq
#    -bsequence dna-align/BL03347___lytB.2.5803.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_05428___lytB-BL03347___lytB.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05428___lytB-BL03347___lytB.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05428___lytB
# 2: BL03347___lytB
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2145
# Identity:    2014/2145 (93.9%)
# Similarity:  2014/2145 (93.9%)
# Gaps:           0/2145 ( 0.0%)
# Score: 9546.0
# 
#
#=======================================

BSNT_05428___      1 TTGAAAAAGATGAAGCTTCTGGTTCTGTCGTCAGTAACTGCTGCAGCTCT     50
                     |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||
BL03347___lyt      1 TTGAAAAAGATGAAGCTTCTGCTTCTGTCGTCAGTAACTGCCGCAGCTCT     50

BSNT_05428___     51 GATGTTTACGCAATCTGCCCAGGCTGCCGACAAAACAATTTCGGTAAAGT    100
                     |||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
BL03347___lyt     51 GATGTTTACACAATCTGCCCAGGCTGCCGACAAAACCATTTCGGTAAAGT    100

BSNT_05428___    101 TAAGTAATTATTTGGGCAATAAATCAAGTGTTGATATCGACATTACCGGC    150
                     ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
BL03347___lyt    101 TAAGCAATTATTTGGGCAATAAATCAAGCGTTGATGTCGACATTACCGGC    150

BSNT_05428___    151 TTATACGAAATTCCGGGCTCAGGAATCTCCGCGACAGAGCGGTACGGCGG    200
                     ..|||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt    151 GCATACGAAATCCCGGGCTCGGGAATCGCCGCGACAGAGCGGTACGGCGG    200

BSNT_05428___    201 GGCGACCCGCTTTGATGTGGCAAACAATGTCGCATCTGCCGGATGGACGA    250
                     ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt    201 GGCGACCCGCTTCGATGTGGCAAACAATGTCGCATCTGCCGGATGGACGA    250

BSNT_05428___    251 ACCCGAGCACAGTCGTGATTGTCAACCGAGACGCTTTTGCGGACGCGCTC    300
                     ||||||||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.
BL03347___lyt    251 ACCCGAGCACTGTCGTGGTTGTCAATCGGGACGCTTTTGCGGACGCGCTT    300

BSNT_05428___    301 TCTGCAACTCCGCTTGCAAAGAAGTACGATGCGCCGATTCTTTTAACAGA    350
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
BL03347___lyt    301 TCTGCAACTCCGCTTGCAAAGAAGTACGATGCGCCGATTCTATTAACGGA    350

BSNT_05428___    351 TGCGGGAACGCTGACGGCGAAAACCGAAACTCAAATTGCCAAGATGAAGC    400
                     ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt    351 TGCGGGTACGCTGACGGCGAAAACCGAAACTCAAATTGCCAAGATGAAGC    400

BSNT_05428___    401 CAGATAACATCTTAATTATCGGTGGAACAACGAGCGTTTCCAAAAATGTT    450
                     |.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt    401 CTGATAATATCTTAATTATCGGGGGAACAACGAGCGTTTCCAAAAATGTT    450

BSNT_05428___    451 GAAAACACGCTGAAAAAGTATGGGGCAATTGTCCGTATCGGCGGCGCCAA    500
                     |||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
BL03347___lyt    451 GAAAACACGCTGAAAAAGTATGGGGCAATTGACCGCATCGGCGGCGCCAA    500

BSNT_05428___    501 TCGATATGATGTGTCTAAAAATATTGCGAGCCGGATGGGGTCCTACAGCC    550
                     .||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt    501 CCGCTATGATGTGTCCAAAAACATCGCGAGCCGGATGGGGTCCTACAGCC    550

BSNT_05428___    551 AGGCGATTGTTGCCACCGGTTTGGTCTTCTCCGACGCTCTGTCGATCGCG    600
                     |.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||
BL03347___lyt    551 AAGCGATTGTTGCCACCGGCTTAGTCTTTTCCGACGCTCTGTCTATCGCG    600

BSNT_05428___    601 CCTTATGCGGCAATGAACGGTTATCCGATACTGCTCTCAGGGAATAATAC    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt    601 CCTTATGCGGCAATGAACGGTTATCCGATACTGCTCTCAGGGAATAATAC    650

BSNT_05428___    651 GATCCGAAGCGATTACAATATTCCGAGCAAAGTTACAATCGTCGGCGGTC    700
                     .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
BL03347___lyt    651 AATCCGAAGCGATTACAATATTCCGAGCAAGGTTACGATCGTCGGCGGTC    700

BSNT_05428___    701 CGTTGAGTGTCAGCACAAGTGTTGAAAACACATTAAAGAAAAAAGCGGCT    750
                     |||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt    701 CGTTGAGTGTCAGCACAGGCGTTGAAAACACATTAAAGAAAAAAGCGGCT    750

BSNT_05428___    751 GTTACCCGCATCGGCGGTGCGAACAGATATGAAGTGTCTGCGAATATTGT    800
                     |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||
BL03347___lyt    751 GTTACCCGCATCGGCGGAGCGAACAGATACGAAGTGTCAGCGAACATTGT    800

BSNT_05428___    801 TAACGCGCTTAACATGAACGCATCAAAGGTTTTCATGTCTAACGGAATGA    850
                     .|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||
BL03347___lyt    801 CAACACGCTTAACATGAACGCATCAAAGGTTTTCATGTCTAATGGAACGA    850

BSNT_05428___    851 CTTTTGCAGATGCACTGGCCGGTTCCGTCCTTGCAGCCAAACAAAAGCAT    900
                     |||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BL03347___lyt    851 CTTTTGCGGATGCGCTGGCCGGTTCCGTCCTTGCTGCCAAACAAAAGCAT    900

BSNT_05428___    901 CCTTTGCTACTTGTCCAATCGGGCAGTTTGCCGCCTCCTGTCGCAGATGT    950
                     ||||||||.|||||||||.|||||||..|||||.|||||||.||||||||
BL03347___lyt    901 CCTTTGCTGCTTGTCCAAGCGGGCAGCCTGCCGACTCCTGTTGCAGATGT    950

BSNT_05428___    951 AGTCGCCAAAAAAGGAACACAGTCTTTTGCTTTGCTTGGAGGGACCGCCT   1000
                     ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
BL03347___lyt    951 AGTCGCGAAAAAAGGAACACAGTCTTTTGCTTTGCTTGGGGGGACCACCT   1000

BSNT_05428___   1001 CGATCACGGATTCGTTGAAAAACAGCCTGGCAGATATGATTACCGGGAAC   1050
                     |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||..||
BL03347___lyt   1001 CGATCACGGATTCATTGAAAAATAGCCTGGCAGATATGTTTACCGGAGAC   1050

BSNT_05428___   1051 GGATACTCTGTTAATCTATCGGGCGGAAAGCTTGTGCTCAACAAAAATAA   1100
                     ||||||||||||||..|.|||.|||||||||||||||||.|.||||||||
BL03347___lyt   1051 GGATACTCTGTTAACGTGTCGAGCGGAAAGCTTGTGCTCTATAAAAATAA   1100

BSNT_05428___   1101 TAAAGCTGTCAAAACGTTTGAAACTTCATTTACGGCATCACCTAAAAAAT   1150
                     ||.|||.|||||||||.|||.|||.|||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt   1101 TAGAGCCGTCAAAACGCTTGGAACGTCATTTACGGCATCACCTAAAAAAT   1150

BSNT_05428___   1151 ATTCGACTTCAAATTCCATCAGCATCAACGGAAGGCCTTATTTAGGCAAT   1200
                     |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BL03347___lyt   1151 ATTCGACGTCAAATTCCATCAGCATCAACGGAAGGCCTTATTTAGGCAAG   1200

BSNT_05428___   1201 ATGAAGTTTACGATTGAATCAAGCAAATATATTCGACCGATAAACGAAAA   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
BL03347___lyt   1201 ATGAAGTTTACGATTGAATCAAGCAAATATGTTCGGCCGATAAACGAAAA   1250

BSNT_05428___   1251 CATTCCGTTTGAAGATTATCTAAAAGGTGTTGTGCCGCACGAAATGCCGG   1300
                     |||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt   1251 CATTCCGTTCGAAGATTATTTAAAAGGTGTTGTGCCGCACGAAATGCCGG   1300

BSNT_05428___   1301 CAAGTTGGCAGACTGAAGCTTTAAAAGCCCAAGCGGTGGCAGCGAGAACA   1350
                     ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
BL03347___lyt   1301 CAAGCTGGCAGACGGAAGCGTTAAAAGCCCAAGCGGTGGCGGCGAGAACT   1350

BSNT_05428___   1351 TATTCGGTCGGTTCCGCAGGAAAAGTAGTGGCTGATACGCAATCGTTTCA   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||
BL03347___lyt   1351 TATTCGGTCGGTTCCGCAGGAAAAGTAGTGGCCGATACGCAGGCGTTTCA   1400

BSNT_05428___   1401 GGTTTACGGCGGATATGACTGGAATTCGAAGACATCCAGCGTTGTAAATT   1450
                     .||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.
BL03347___lyt   1401 AGTATACGGAGGATACGACTGGAATTCGAAGACATCCAGCGTTGTAAATG   1450

BSNT_05428___   1451 CCACAAAAGGACAAGTTTTAAAATATAACGGCAATTTGATTTCGGCCGTT   1500
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BL03347___lyt   1451 CCACAAAAGGACAAGTTTTAAAATATAACGGCAATTTGATTTCAGCCGTT   1500

BSNT_05428___   1501 TACTCATCAAGCAACGGGGGATATACGGAAGCAAGCGCAGAGGTATGGGG   1550
                     |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt   1501 TACTCGTCAAGCAACGGGGGATATACGGAAGCAAGCGCAGAGGTATGGGG   1550

BSNT_05428___   1551 CGGCAATGTTCCATATTTAATCGCCAAAGCGGATACATATGACCCGAAAA   1600
                     |||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||
BL03347___lyt   1551 CGGCAGTGTGCCATATTTAATTGCCAAAGCGGATACATATGACCCGCAAA   1600

BSNT_05428___   1601 CCAGCTGGTCGATATCTTTGAATAAAACGCAGATCAACACCAGCGGCTTA   1650
                     .||||||||||||.||.|||||||..|||||||||||.||||||||||||
BL03347___lyt   1601 ACAGCTGGTCGATTTCCTTGAATAGGACGCAGATCAATACCAGCGGCTTA   1650

BSNT_05428___   1651 AATCTGAGCAGCCCTAGCACTTGGTGGAATTCGACTAATGAAACGAACTC   1700
                     ||.||||||||||||.||||.|||||||||.||||.||||||||||||||
BL03347___lyt   1651 AACCTGAGCAGCCCTGGCACATGGTGGAATACGACAAATGAAACGAACTC   1700

BSNT_05428___   1701 CGCCTATTTATCGGGACTGAAAAGCTGGTTTATGACCAATAAATATCCTA   1750
                     |||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BL03347___lyt   1701 CGCCTATTTGTCTGGACTGAAAAGCTGGTTTATTACCAATAAATATCCTA   1750

BSNT_05428___   1751 GTGCGGAATCTATTAAGATCACGAAAATCTCAAGCCTGAGCCTGAGCAGT   1800
                     ||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||.
BL03347___lyt   1751 GTGCAGAATCTATTAAGATTACGAAAATCTCAAGCCTGACCCTGAGCAGC   1800

BSNT_05428___   1801 GCAAAAACTGCCGGTCAGCGGCCGAAAACAGCAGAGGTGAAGTTTTCTTA   1850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt   1801 GCAAAAACTGCCGGTCAGCGGCCGAAAACAGCAGAGGTGAAGTTTTCTTA   1850

BSNT_05428___   1851 CTTTGTCAAAGAAAAATCAAATGGCTATGTTCTGTCAAACGGAAAACTTT   1900
                     ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BL03347___lyt   1851 CTTTGTTAAAGAAAAATCAAATGGCTATGTTCTATCAAACGGAAAACTTT   1900

BSNT_05428___   1901 CAGAAAAAACAGCGACGATTTCCGTGACGACGACTCAATTAAGATCGATG   1950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt   1901 CAGAAAAAACAGCGACGATTTCCGTGACGACGACTCAATTAAGATCGATG   1950

BSNT_05428___   1951 TTGGGCGGCATGAATATGAAGAGCACGTATGCTTCTTTATCAAACAATAC   2000
                     .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||
BL03347___lyt   1951 CTGGGCGGCATGAATATGAAGAGCACGTATGCTTCTGTATCCAGCAATAC   2000

BSNT_05428___   2001 GAACGCTTTTATTCTCAGCGGTAAAGGATTCGGCCACGGAATCGGCATGA   2050
                     |||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
BL03347___lyt   2001 GAACGCTTTTACTCTCAGCGGTAAAGGATTCGGACACGGCATCGGCATGA   2050

BSNT_05428___   2051 GTCAGTATGGAGCAAATGCCAGAGCTGCTGCCGGGCACGATTACAAGAAG   2100
                     |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt   2051 GTCAGTACGGAGCAAATGCCAGAGCTGCTGCCGGGCACGATTACAAGAAG   2100

BSNT_05428___   2101 ATTTTAAGTTTCTATTATCCAAATACGACTCTATCAAGCTATTAA   2145
                     ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt   2101 ATTTTAAGTTTCTACTATCCAAATACGACTCTATCAAGCTATTAA   2145


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.