Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_00072 and BSU00380

See Amino acid alignment / Visit BSNT_00072 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:15:55
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_00072___metG.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU00380___metS.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_00072___metG-BSU00380___metS.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_00072___metG-BSU00380___metS.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00072___metG
# 2: BSU00380___metS
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1995
# Identity:    1977/1995 (99.1%)
# Similarity:  1977/1995 (99.1%)
# Gaps:           0/1995 ( 0.0%)
# Score: 9813.0
# 
#
#=======================================

BSNT_00072___      1 ATGCCGCAAGAAAACAATACATTTTACATTACAACACCGATTTATTATCC     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me      1 ATGCCGCAAGAAAACAATACATTTTACATTACAACACCGATTTATTATCC     50

BSNT_00072___     51 GAGCGGAAAATTACATATCGGCCATGCATATACGACAGTCGCGGGAGATG    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU00380___me     51 GAGCGGAAAATTACATATCGGCCATGCATATACGACAGTCGCAGGAGATG    100

BSNT_00072___    101 CAATGGCACGTTACAAAAGACTAAAAGGGTTCGATGTTCGCTATTTAACG    150
                     ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    101 CAATGGCACGTTACAAAAGATTAAAAGGGTTCGATGTTCGCTATTTAACG    150

BSNT_00072___    151 GGAACGGACGAGCATGGACAAAAGATCCAGCAAAAAGCTGAACAGGAAAA    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    151 GGAACGGACGAGCATGGACAAAAGATCCAGCAAAAAGCTGAACAGGAAAA    200

BSNT_00072___    201 CATTACACCTCAGGAGTATGTGGATCGCGCAGCGGCAGATATTCAAAAAC    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    201 CATTACACCTCAGGAGTATGTGGATCGCGCAGCGGCAGATATTCAAAAAC    250

BSNT_00072___    251 TGTGGAAGCAGCTTGAAATCTCAAACGACGACTTTATCCGCACGACAGAA    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    251 TGTGGAAGCAGCTTGAAATCTCAAACGACGACTTTATCCGCACGACAGAA    300

BSNT_00072___    301 AAACGGCATAAAGTTGTCATTGAAAAAGTGTTTCAAAAGCTTCTTGATAA    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    301 AAACGGCATAAAGTTGTCATTGAAAAAGTGTTTCAAAAGCTTCTTGATAA    350

BSNT_00072___    351 CGGGGACATCTATCTTGATGAGTATGAAGGCTGGTACAGCATCCCTGATG    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    351 CGGGGACATCTATCTTGATGAGTATGAAGGCTGGTACAGCATCCCTGATG    400

BSNT_00072___    401 AAACGTTCTACACGGAAACTCAGCTCGTTGATATTGAGCGGAATGAAAAG    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    401 AAACGTTCTACACGGAAACTCAGCTCGTTGATATTGAGCGGAATGAAAAG    450

BSNT_00072___    451 GGAGAGGTCATCGGCGGAAAAAGCCCTGACAGCGGTCACCCAGTTGAATT    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    451 GGAGAGGTCATCGGCGGAAAAAGCCCTGACAGCGGTCACCCAGTTGAATT    500

BSNT_00072___    501 GATCAAAGAGGAATCTTATTTCTTCCGCATGGGGAAATACGCGGATCGTC    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    501 GATCAAAGAGGAATCTTATTTCTTCCGCATGGGGAAATACGCGGATCGTC    550

BSNT_00072___    551 TTCTGAAATACTATGAAGAAAACCCGACATTCATTCAGCCAGAATCACGC    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    551 TTCTGAAATACTATGAAGAAAACCCGACATTCATTCAGCCAGAATCACGC    600

BSNT_00072___    601 AAAAACGAAATGATTAATAACTTTATCAAACCTGGACTTGAGGATTTGGC    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    601 AAAAACGAAATGATTAATAACTTTATCAAACCTGGACTTGAGGATTTGGC    650

BSNT_00072___    651 AGTATCACGTACCACTTTTGATTGGGGCGTGAAGGTGCCGGAAAATCCAA    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    651 AGTATCACGTACCACTTTTGATTGGGGCGTGAAGGTGCCGGAAAATCCAA    700

BSNT_00072___    701 AGCATGTTGTATATGTTTGGATTGACGCACTATTTAACTATTTAACGGCA    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    701 AGCATGTTGTATATGTTTGGATTGACGCACTATTTAACTATTTAACGGCA    750

BSNT_00072___    751 CTCGGTTATGATACAGAAAATGATGAGCTTTATCAAAAATATTGGCCTGC    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    751 CTCGGTTATGATACAGAAAATGATGAGCTTTATCAAAAATATTGGCCTGC    800

BSNT_00072___    801 CGATGTTCATTTAGTCGGTAAGGAGATTGTACGATTCCATACTATTTACT    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    801 CGATGTTCATTTAGTCGGTAAGGAGATTGTACGATTCCATACTATTTACT    850

BSNT_00072___    851 GGCCAATTATGCTGATGGCGCTGGATCTTCCGCTGCCAAAGCAAGTATTC    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    851 GGCCAATTATGCTGATGGCGCTGGATCTTCCGCTGCCAAAGCAAGTATTC    900

BSNT_00072___    901 GCGCATGGCTGGCTTTTGATGAAAGACGGAAAAATGTCGAAATCAAAAGG    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me    901 GCGCATGGCTGGCTTTTGATGAAAGACGGAAAAATGTCGAAATCAAAAGG    950

BSNT_00072___    951 AAACGTTGTAGATCCGGTTACATTAATTGAGCGCTATGGTTTAGACGAGC   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
BSU00380___me    951 AAACGTTGTAGATCCGGTTACATTAATTGAACGCTATGGTTTAGACGAAC   1000

BSNT_00072___   1001 TTCGCTATTACCTGCTTCGCGAAGTGCCGTTCGGATCTGACGGTGTTTTC   1050
                     |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU00380___me   1001 TTCGCTATTACTTGCTTCGCGAAGTGCCGTTCGGATCAGACGGTGTTTTC   1050

BSNT_00072___   1051 ACGCCGGAAGGATTTGTTGAGCGAATCAACTATGATTTAGCGAATGATTT   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1051 ACGCCGGAAGGATTTGTTGAGCGAATCAACTATGATTTAGCGAATGATTT   1100

BSNT_00072___   1101 AGGAAATCTATTGAATCGTACTGTTGCGATGATCAATAAGTATTTTGACG   1150
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU00380___me   1101 AGGAAATCTATTGAATCGTACTGTTGCGATGATTAATAAGTATTTTGACG   1150

BSNT_00072___   1151 GACAAATTGGTTCTTACAAAGGTGCTGTTACGGAATTTGACCAAACGCTC   1200
                     |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU00380___me   1151 GACAAATCGGTTCTTACAAAGGTGCTGTTACGGAATTTGACCATACGCTC   1200

BSNT_00072___   1201 ACTTCTGTTGCTGAAGAAACAGTGAAAGCTTATGAGAAAGCAATGGAAAA   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1201 ACTTCTGTTGCTGAAGAAACAGTGAAAGCTTATGAGAAAGCAATGGAAAA   1250

BSNT_00072___   1251 TATGGAGTTCTCGGTAGCACTTTCGACTTTATGGCAGCTCATCAGCCGCA   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1251 TATGGAGTTCTCGGTAGCACTTTCGACTTTATGGCAGCTCATCAGCCGCA   1300

BSNT_00072___   1301 CAAACAAATACATTGATGAGACAGCTCCATGGGTGCTTGCGAAAGATCCG   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1301 CAAACAAATACATTGATGAGACAGCTCCATGGGTGCTTGCGAAAGATCCG   1350

BSNT_00072___   1351 GCAAAAGAAGAAGAATTGCGATCAGTTATGTATCATCTCGCTGAATCATT   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1351 GCAAAAGAAGAAGAATTGCGATCAGTTATGTATCATCTCGCTGAATCATT   1400

BSNT_00072___   1401 GCGTATTTCAGCGGTACTGCTTCAGCCATTCTTAACAAAAACACCTGAAA   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1401 GCGTATTTCAGCGGTACTGCTTCAGCCATTCTTAACAAAAACACCTGAAA   1450

BSNT_00072___   1451 AAATGTTCGAGCAGCTAGGCATTACTGATGACTCTCTAAAAGCTTGGGAC   1500
                     ||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||
BSU00380___me   1451 AAATGTTCGAGCAGCTGGGCATTACTGATGAATCTTTAAAAGCTTGGGAC   1500

BSNT_00072___   1501 AGCATTACAGCTTTCGGCCAGCTGAAAGATACAAAAGTACAAAAAGGCGA   1550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1501 AGCATTACAGCTTTCGGCCAGCTGAAAGATACAAAAGTACAAAAAGGCGA   1550

BSNT_00072___   1551 GCCGTTGTTCCCTCGTTTAGAGGCAGAAGAAGAAATTGCTTACATCAAAG   1600
                     |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1551 GCCATTGTTCCCTCGTTTAGAGGCAGAAGAAGAAATTGCTTACATCAAAG   1600

BSNT_00072___   1601 GGAAAATGCAAGGTTCGGCACCAGCGAAAGAAGAAACAAGAGAAGAAGAG   1650
                     ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU00380___me   1601 GGAAAATGCAAGGTTCAGCACCAGCGAAAGAAGAAACAAAAGAAGAAGAG   1650

BSNT_00072___   1651 CCGCAAGAGGTCGATCGTTTACCTGAAATTACGATTGATCAATTCATGGA   1700
                     ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU00380___me   1651 CCTCAAGAGGTCGATCGTTTACCTGAAATTACGATTGATCAATTTATGGA   1700

BSNT_00072___   1701 TGTAGAGCTTCGCGTAGCTGAGGTCATTGAGGCAGAGCCAGTGAAAAAAG   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1701 TGTAGAGCTTCGCGTAGCTGAGGTCATTGAGGCAGAGCCAGTGAAAAAAG   1750

BSNT_00072___   1751 CAGACCGTTTATTGAAGCTGCAGCTTGATCTTGGTTTTGAAAAGCGCCAA   1800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1751 CAGACCGTTTATTGAAGCTGCAGCTTGATCTTGGTTTTGAAAAGCGCCAA   1800

BSNT_00072___   1801 GTGGTATCCGGCATTGCGAAGCATTATACGCCTGAAGAGCTTGTTGGAAA   1850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1801 GTGGTATCCGGCATTGCGAAGCATTATACGCCTGAAGAGCTTGTTGGAAA   1850

BSNT_00072___   1851 AAAACTCGTTTGTGTAACAAATCTAAAACCGGTTAAACTCAGAGGAGAGC   1900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1851 AAAACTCGTTTGTGTAACAAATCTAAAACCGGTTAAACTCAGAGGAGAGC   1900

BSNT_00072___   1901 TTTCTCAAGGTATGATCCTTGCAGGAGAAGCAGACGGCGTTTTAAAGGTC   1950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1901 TTTCTCAAGGTATGATCCTTGCAGGAGAAGCAGACGGCGTTTTAAAGGTC   1950

BSNT_00072___   1951 GTGTCTATCGATCAGTCGTTACCAAAAGGCACAAGAATTAAATAA   1995
                     ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00380___me   1951 GTATCTATCGATCAGTCGTTACCAAAAGGCACAAGAATTAAATAA   1995


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.