Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_00354 and BSU01845

See Amino acid alignment / Visit BSNT_00354 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:16:24
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_00354.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU01845___ybcC.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_00354-BSU01845___ybcC.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_00354-BSU01845___ybcC.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00354
# 2: BSU01845___ybcC
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2616
# Identity:    2568/2616 (98.2%)
# Similarity:  2568/2616 (98.2%)
# Gaps:           0/2616 ( 0.0%)
# Score: 12648.0
# 
#
#=======================================

BSNT_00354         1 ATGGGCATTACATCCGTATTAACGAAAGATAATGTAAAAAAGATAGATAC     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb      1 ATGGGCATTACATCCGTATTAACGAAAGATAATGTAAAAAAGATAGATAC     50

BSNT_00354        51 AGATATTGATGTTCAAGAAAGGGATCTTAACGTTTTCATTACATCTGCCA    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb     51 AGATATTGATGTTCAAGAAAGGGATCTTAACGTTTTCATTACATCTGCCA    100

BSNT_00354       101 GCCGAGTGATTGCGCCACTTTGGCCTATTTCTACATTTGCTGCACGTAAT    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    101 GCCGAGTGATTGCGCCACTTTGGCCTATTTCTACATTTGCTGCACGTAAT    150

BSNT_00354       151 CCGTGGATGGGACTTGAAAACCAACCTTTTGATCAGGTTGCAAGTTGGTT    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    151 CCGTGGATGGGACTTGAAAACCAACCTTTTGATCAGGTTGCAAGTTGGTT    200

BSNT_00354       201 GAAAAACACTCGCGATGTTGATATATACCCTAGTGCGTCTATGATCCGTT    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    201 GAAAAACACTCGCGATGTTGATATATACCCTAGTGCGTCTATGATCCGTT    250

BSNT_00354       251 CAGCAAAGAATAAAGGTGAGATTGATGAAGATTTTGTGGAAATGGGGCTG    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    251 CAGCAAAGAATAAAGGTGAGATTGATGAAGATTTTGTGGAAATGGGGCTG    300

BSNT_00354       301 CAGCGTTGGCTTGATTCACATTCTTATCACATCCCACGGGACGTGGCAGA    350
                     |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
BSU01845___yb    301 CAGCGTTGGCTTGATTCACATTCCTATCACATCCCACGGGACGTAGCAGA    350

BSNT_00354       351 GCGATTTTGTCATGCTGCATTAAAGTTAGATCCCCTGCCTTCCGACCTTT    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    351 GCGATTTTGTCATGCTGCATTAAAGTTAGATCCCCTGCCTTCCGACCTTT    400

BSNT_00354       401 TATCATCACATGAGCTGGAGAAATTAGTAGGTGAATGTAGTGGATTGGAT    450
                     |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    401 TATCATCACATGAGCTGGAGAAATTAGTAAGTGAATGTAGTGGATTGGAT    450

BSNT_00354       451 CATATCGAGAATGTGTTTATGCAGCCACTAAGTTCGTATATAGAGAATCA    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    451 CATATCGAGAATGTGTTTATGCAGCCACTAAGTTCGTATATAGAGAATCA    500

BSNT_00354       501 AGATGGTGAAAGGCTAGTCAATATACTAGATCATCATGTCATTAAGTGGA    550
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU01845___yb    501 AGATGGTGAAAGGCTAGTCAATATACTAGATCATCATGTCATTAAATGGA    550

BSNT_00354       551 GTAAATTATATCTTGATGACTCTCAAGCAGGCTGGACAATGCCTAATCGT    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
BSU01845___yb    551 GTAAATTATATCTTGATGACTCTCAAGCGGGTTGGACAATGCCTAATCGT    600

BSNT_00354       601 GAGGAAGGTTTCTATCGTGCTTGGCAGCATCTCATTCAATATGATCCAGC    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU01845___yb    601 GAGGAAGGTTTCTATCGTGCTTGGCAGCATCTTATTCAATATGATCCAGC    650

BSNT_00354       651 ACTTAGCAAAAAGCAGCGAGAAAGGGTAAAGGATTGGCCGAAAGAGGCAC    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||
BSU01845___yb    651 ACTTAGCAAAAAGCAGCGAGAAAGGGTAAAAGGTTGGCCGAAAGAGGCAC    700

BSNT_00354       701 ATTTGGCTTTACAGGAAGCCTTATTCGCACTAGAAATCCCAGAGTCAGAA    750
                     |||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    701 ATTTGGCTTTACAAGAAGCTTTATTCGCACTAGAAATCCCAGAGTCAGAA    750

BSNT_00354       751 ATCCAGACTTATCTTGAAGGTCATTTACTTTCATTACCTGGATGGGCAGG    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    751 ATCCAGACTTATCTTGAAGGTCATTTACTTTCATTACCTGGATGGGCAGG    800

BSNT_00354       801 GATGATGCTTTGGCGCTCCCAGCAATCGAGCCACGAACATGCACTCCTAA    850
                     |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
BSU01845___yb    801 GATGATGCTTTGGCGCTCCCAACAATCGAGCCACGAACATGCACTACTAA    850

BSNT_00354       851 CAGAATATTTAGCGGTTCGAATATCCATGGAGTGGGCTCTTATAAAGCCA    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    851 CAGAATATTTAGCGGTTCGAATATCCATGGAGTGGGCTCTTATAAAGCCA    900

BSNT_00354       901 TACTTACCTTTGACTAATGAACGATCTAAGAAAAAAATTTCAATTGCTCC    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU01845___yb    901 TACTTACCTTTGACTAATGAACGATCTAAGAAAACAATTTCAATTGCTCC    950

BSNT_00354       951 CCTTATAGCAGCTTGGATTCATTGGGGTGGGCTTACATTAGAAGAATGGT   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb    951 CCTTATAGCAGCTTGGATTCATTGGGGTGGGCTTACATTAGAAGAATGGT   1000

BSNT_00354      1001 CACAGATGACGGCCATTGAACAAAACGAATATTTATCATTTGCCTACAGC   1050
                     |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1001 CACAGATGACGGCCAGTGAACAAAACGAATATTTATCATTTGCCTACAGC   1050

BSNT_00354      1051 TTTGATGAGAAACTTCGCAAGAAACTTTGGTTAGAAGCTTGGGAGCAAAC   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU01845___yb   1051 TTTGATGAGAAACTTCGCAAGAAACTTTGGTTAGAAGCTTGGGAACAAAC   1100

BSNT_00354      1101 GTACACTGATCGATTAAGCCAGAAGATCATCTCGAAACAACGTGAAACCG   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1101 GTACACTGATCGATTAAGCCAGAAGATCATCTCGAAACAACGTGAAACCG   1150

BSNT_00354      1151 GCGGTAAAAAATCTGCATTAGCTCAAATAGCATTCTGCATCGATGTACGA   1200
                     ||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1151 GCCGTGAAAAATCTGCATTAGCTCAATTAGCATTCTGCATCGATGTACGA   1200

BSNT_00354      1201 TCAGAACCTTTTCGTCGTCAACTAGAAAAAGAAGGCCCGTTTGAAACGAT   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1201 TCAGAACCTTTTCGTCGTCAACTAGAAAAAGAAGGCCCGTTTGAAACGAT   1250

BSNT_00354      1251 TGGTATTGCTGGTTTCTTCGGGGTGCCGATTGCAACTTGTGAACTTGGCA   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1251 TGGTATTGCTGGTTTCTTCGGGGTGCCGATTGCAACTTGTGAACTTGGCA   1300

BSNT_00354      1301 GTAAACACAGTCATGCTTCCTTACCGATCATACAAAAACCGCAAAATAAA   1350
                     ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1301 GTAAACACAGTCATGCTTCCTTGCCGATCATACAAAAACCGCAAAATAAA   1350

BSNT_00354      1351 ATAAAAGAGTTCGCAGATGAGGATGTATTCAAAAAATACAATCAACGGAA   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1351 ATAAAAGAGTTCGCAGATGAGGATGTATTCAAAAAATACAATCAACGGAA   1400

BSNT_00354      1401 GCAAGCAATTCATTCTTTAAGCCATACCTTTAAAACGATGAAGCAGAATG   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1401 GCAAGCAATTCATTCTTTAAGCCATACCTTTAAAACGATGAAGCAGAATG   1450

BSNT_00354      1451 CGCTTTCGAGCTTACTACTGCCTGAGCTAAGTGGACCTTGGCTTACTCTG   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1451 CGCTTTCGAGCTTACTACTGCCTGAGCTAAGTGGACCTTGGCTTACTCTG   1500

BSNT_00354      1501 CAAATGGCAGCCCGTAGCTTTGTGCCAAGAAAGGCGGGGCGTTTCATTCG   1550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU01845___yb   1501 CAAATGGCAGCCCGTAGCTTTGTGCCAAGAAAGGCGGGTCGTTTCATTCG   1550

BSNT_00354      1551 TAATCTCCGTGAGGCTTGGTTGCGCAAACCTGATACAAAACTCTCGCTTC   1600
                     |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1551 TAATCTCCGTGAGGCTTGGTTACGCAAACCTGATACAAAACTCTCGCTTC   1600

BSNT_00354      1601 ATCATGATGCTACAGAGGCGGAAATACCTGTGGGTTTTACTGATGAAGAA   1650
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1601 ATCATGATGCTACAGAGGCAGAAATACCTGTGGGTTTTACTGATGAAGAA   1650

BSNT_00354      1651 AAAGTGAACTATGCTCGCCAAGCATTAAAAATGATGGGGTTAACAGAGAA   1700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1651 AAAGTGAACTATGCTCGCCAAGCATTAAAAATGATGGGGTTAACAGAGAA   1700

BSNT_00354      1701 TATCGCACCATTGGTTGTGATATGCGGGCACGGCAGTCAAAGTACCAATA   1750
                     .||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||
BSU01845___yb   1701 CATCGCACCATTGGTCGTGATTTGTGGGCATGGCAGTCAAAGTACTAATA   1750

BSNT_00354      1751 ATCCTTATTCCGCAGCACTTGACTGTGGCGCCTGCGGTGGAGCGGCCGGT   1800
                     ||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||
BSU01845___yb   1751 ATCCTTATTCTGCAGCCCTTGATTGTGGTGCCTGTGGTGGAGCGGCCGGT   1800

BSNT_00354      1801 GGATTCAATGCAAGAGTTTTAGCTGCTTTATGTAATCTATCAGAGGTACG   1850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1801 GGATTCAATGCAAGAGTTTTAGCTGCTTTATGTAATCTATCAGAGGTACG   1850

BSNT_00354      1851 AGAAGCTCTTTTAACTGAAGGAATTAAAATCCCTGAGGATACGGTTTTTG   1900
                     |||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
BSU01845___yb   1851 AGAAGCTCTTTTAGCTGAAGGAATTAAAATTCCTGAGGATACAGTTTTTG   1900

BSNT_00354      1901 CGGCAGCTGAACATAATACAACGGTGGATGAATTACATTGGCTTTATGTA   1950
                     |.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1901 CAGCAGCTGAACATAATACAACAGTAGATGAATTACATTGGCTTTATGTA   1950

BSNT_00354      1951 CCAGAGCTTTCCGAAGCTGCACAAGAAGCATTTGAACAAATTGAAGCCGT   2000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   1951 CCAGAGCTTTCCGAAGCTGCACAAGAAGCATTTGAACAAATTGAAGCCGT   2000

BSNT_00354      2001 GATGCCGAAAGTGAGACATCATGTAAACGCAGAACGTCTAGCCCAATTAC   2050
                     .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2001 TATGCCGAAAGTGAGACATCATGTAAACGCAGAACGTCTAGCCCAATTAC   2050

BSNT_00354      2051 CGAATTTCCAATCGAAGCTAAAAAATCCGAAGGCTGAGGCAAACCGATTT   2100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2051 CGAATTTCCAATCGAAGCTAAAAAATCCGAAGGCTGAGGCAAACCGATTT   2100

BSNT_00354      2101 GCGGAAGATTGGAGTGAGATACGTCCGGAATGGGGACTGGCTCGTAATGC   2150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2101 GCGGAAGATTGGAGTGAGATACGTCCGGAATGGGGACTGGCTCGTAATGC   2150

BSNT_00354      2151 CGCTTTTATTATCGGTAAACGTGAACTAACTCAGGATTGTGATTTGGAAG   2200
                     |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2151 CGCTTTTATTATCGGTAAACGTGAATTAACTCAGGATTGTGATTTGGAAG   2200

BSNT_00354      2201 GCAGAGCCTTTCTCCATAATTATGATTGGAAGCAGGATGAAAGCGGTGAA   2250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2201 GCAGAGCCTTTCTCCATAATTATGATTGGAAGCAGGATGAAAGCGGTGAA   2250

BSNT_00354      2251 CTCCTAGCAAATATTATTGCAGGACCTGGAACTGTAGCCCAATGGATTAA   2300
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2251 CTCCTAGCAAATATTATTGTAGGACCTGGAACTGTAGCCCAATGGATTAA   2300

BSNT_00354      2301 TTTACAATATTACGCATCAACGGTAGCACCTCATTATTATGGCAGCGGAA   2350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2301 TTTACAATATTACGCATCAACGGTAGCACCTCATTATTATGGCAGCGGAA   2350

BSNT_00354      2351 ATAAAGCAACTCAAACCGTTACTTCAGGTCTCGGCGTTATGCAGGGGAAT   2400
                     |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2351 ATAAAGCAACTCAAACCGTTACTGCAGGTCTCGGCGTTATGCAGGGGAAT   2400

BSNT_00354      2401 GCAAGCGACTTGTTAGCCGGACTGCCTTGGCAATCCGTCATGGAATCAGA   2450
                     ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2401 GCAAGCGATTTGTTAGCCGGACTGCCTTGGCAATCCGTCATGGAATCAGA   2450

BSNT_00354      2451 TCACGAGGCCTATCATTCTCCTCTTCGTTTATTGATACTCATCCAAGCAC   2500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01845___yb   2451 TCACGAGGCCTATCATTCTCCTCTTCGTTTATTGATACTCATCCAAGCAC   2500

BSNT_00354      2501 CTAGAGAATATGTAGAACGGTTATTAAATCATGACTCAGCATTTCTGCAA   2550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU01845___yb   2501 CTAGAGAATATGTAGAACGGTTATTAAATCATGATTCAGCATTTCTGCAA   2550

BSNT_00354      2551 AAAGTTCAAAATGGATGGGTCCGACTGGCTAATATTGATCCAGAAGGATG   2600
                     |||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
BSU01845___yb   2551 AAAGTTCAAAATGGATGGGTCCGACTGGCTAGTCTTGATCCAGAAGGATG   2600

BSNT_00354      2601 TTGGGAAAGCTGGTAA   2616
                     ||||||||||||||||
BSU01845___yb   2601 TTGGGAAAGCTGGTAA   2616


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.