Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_00388 and BSU02200
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_00388 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:16:28
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_00388___ybfG.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU02200___ybfG.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_00388___ybfG-BSU02200___ybfG.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_00388___ybfG-BSU02200___ybfG.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00388___ybfG
# 2: BSU02200___ybfG
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2199
# Identity: 2185/2199 (99.4%)
# Similarity: 2185/2199 (99.4%)
# Gaps: 0/2199 ( 0.0%)
# Score: 10869.0
#
#
#=======================================
BSNT_00388___ 1 ATGGTTGATGAAATGGTCTTAATCACACAGCAATGGCTAAACGATACGTA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU02200___yb 1 ATGGTTGATGAAATGGTCTTAATCACACAGCAATGGCTGAACGATACGTA 50
BSNT_00388___ 51 CAGCGGCAAACATGGGTATAACCCAGTTGAAGAAAGCGGGAAAACTGGGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 51 CAGCGGCAAACATGGGTATAACCCAGTTGAAGAAAGCGGGAAAACTGGGT 100
BSNT_00388___ 101 GGGATACAATCTACGGTCTGACTCGGGCGCTTCAAATTGAATTGGGTATC 150
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 101 GGGATACGATCTACGGTCTGACTCGGGCGCTTCAAATTGAATTGGGTATC 150
BSNT_00388___ 151 TCAGAGCCAGCCGATAACTTCGGGCCGACAACACAGCGCTTATTTAAGCC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 151 TCAGAGCCAGCCGATAACTTCGGGCCGACAACACAGCGCTTATTTAAGCC 200
BSNT_00388___ 201 TCTTAAACGCCAAGCTCCAGATTCAAAACCAAGCAACATGAATTTTATTT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 201 TCTTAAACGCCAAGCTCCAGATTCAAAACCAAGCAACATGAATTTTATTT 250
BSNT_00388___ 251 TACAAGGGGCTTTATGGTGTAAAGGCTTTAATCCCGGCGGTTTTACAGGC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 251 TACAAGGGGCTTTATGGTGTAAAGGCTTTAATCCCGGCGGTTTTACAGGC 300
BSNT_00388___ 301 GTCTTTTACGAAAAAACAGAAAATGCGGTAAAAGAATTTCAAAAAGCTGC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 301 GTCTTTTACGAAAAAACAGAAAATGCGGTAAAAGAATTTCAAAAAGCTGC 350
BSNT_00388___ 351 CGGACTGACAACACAGGATGGGATTGTCACCACGTTAATTATGAAAGCCT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 351 CGGACTGACAACACAGGATGGGATTGTCACCACGTTAATTATGAAAGCCT 400
BSNT_00388___ 401 TATTAGACATGAGCGCTTTTAAGCTGGTGTCTGGGGGTGATTCAAGAATT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 401 TATTAGACATGAGCGCTTTTAAGCTGGTGTCTGGGGGTGATTCAAGAATT 450
BSNT_00388___ 451 CGCCAGATTCAACAAAACTTAAATCGAGACTACAATGACTATATCGGGTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 451 CGCCAGATTCAACAAAACTTAAATCGAGACTACAATGACTATATCGGGTT 500
BSNT_00388___ 501 AATGCCTTGTGACGGACTGTATGGCCGCGATACAAATAAAGCTCTTATTT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 501 AATGCCTTGTGACGGACTGTATGGCCGCGATACAAATAAAGCTCTTATTT 550
BSNT_00388___ 551 ATGCCCTGCAAAAAGAAGAAGGCATGAGCACAAGTGTTGCCAATGGATTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 551 ATGCCCTGCAAAAAGAAGAAGGCATGAGCACAAGTGTTGCCAATGGATTT 600
BSNT_00388___ 601 TTCGGAAACGGCACCACAAGTTTATGCCCTACTTTAACTCCCGGCGATTC 650
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 601 TTCGGAAACGGCACCACAAGTTTGTGCCCTACTTTAACTCCCGGCGATTC 650
BSNT_00388___ 651 AAGAACAGGATTTGTCTTAATTGTTCAGTACGCCCTCTATTGTAACGGAA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 651 AAGAACAGGATTTGTCTTAATTGTTCAGTACGCCCTCTATTGTAACGGAA 700
BSNT_00388___ 701 AATCGTTCGATCCTGGTGAGTTTGACGGCAAATATGGTGTGGGTGTTGTT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 701 AATCGTTCGATCCTGGTGAGTTTGACGGCAAATATGGTGTGGGTGTTGTT 750
BSNT_00388___ 751 TCAGCTGTTAAAGCATTTCAAGAGTTCATGCGCCTGCCGCAAACAGGTTA 800
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU02200___yb 751 TCAGCTGTTAAAGCATTTCAAGAGTTCATGTGCCTGCCGCAAACAGGTTA 800
BSNT_00388___ 801 TGCAGATATGCCAACCATTAAAGCTTTATTATCAAGCTCAGGAGACACAA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 801 TGCAGATATGCCAACCATTAAAGCTTTATTATCAAGCTCAGGAGACACAA 850
BSNT_00388___ 851 CTCGCGCCGCTTCTGCTTGTGACACTGCTACAATTATAACCGCAGAAAAA 900
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 851 CTCGCACCGCTTCTGCTTGTGACACTGCTACAATTATAACCGCAGAAAAA 900
BSNT_00388___ 901 GCTCAAACACTGCGGAATAACGGTTATAAAACGGTTGGCAGATATTTGAC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 901 GCTCAAACACTGCGGAATAACGGTTATAAAACGGTTGGCAGATATTTGAC 950
BSNT_00388___ 951 CGGAAATGTGCGGACAAGCAGCGGCCTCACATCAAAAGCCCTGACATCTA 1000
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU02200___yb 951 CGGAAATGTGCGGACAAGCAGCGGCCTCACATCTAAAGCCCTGACATCTA 1000
BSNT_00388___ 1001 AAGAGCTTGCAGTTATTCTTGATGCCGGATTGAAGGTTTTCCCAATTTAT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1001 AAGAGCTTGCAGTTATTCTTGATGCCGGATTGAAGGTTTTCCCAATTTAT 1050
BSNT_00388___ 1051 CAAGACGGCGGCTATGAATCTTCTTATTTTGTCAAAGACCAAGGCACAAG 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1051 CAAGACGGCGGCTATGAATCTTCTTATTTTGTCAAAGACCAAGGCACAAG 1100
BSNT_00388___ 1101 AGATGCATATAGTGCCGCTTCTGCTGCTAGAAGATTAGGTTTTCCGTCAG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1101 AGATGCATATAGTGCCGCTTCTGCTGCTAGAAGATTAGGTTTTCCGTCAG 1150
BSNT_00388___ 1151 GCACGACCATTTATTTCGCTGTCGATTTTGATGCATACGATTATGAAGTG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1151 GCACGACCATTTATTTCGCTGTCGATTTTGATGCATACGATTATGAAGTG 1200
BSNT_00388___ 1201 ACCGATAAAATCATTCCTTATTTCCAAGAGATTAAGTCAGCATTTACAAA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1201 ACCGATAAAATCATTCCTTATTTCCAAGAGATTAAGTCAGCATTTACAAA 1250
BSNT_00388___ 1251 AATGCAGACATTTTCAACCGCACCTAAGTATGAAATAGGGGTTTACGGAC 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1251 AATGCAGACATTTTCAACCGCACCTAAGTATGAAATAGGGGTTTACGGAC 1300
BSNT_00388___ 1301 CAAGAAACATTTGTATCCGTACATCAGAAGCAGGAATGACAAAGTATAGT 1350
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||
BSU02200___yb 1301 CAAGAAACATTTGTATCCGTACATCTGAAGCAGGACTGACAAAGTATAGT 1350
BSNT_00388___ 1351 TTTGTGGCAAATATGTCAACAGGATTTAGCGGCAATCTCGGCTATCCGAT 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1351 TTTGTGGCAAATATGTCAACAGGATTTAGCGGCAATCTCGGCTATCCGAT 1400
BSNT_00388___ 1401 GCCAAACAATTGGGCCTTTGATCAATTTTATGAAGGAACCATCGGAAGCG 1450
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1401 GCCAAACAACTGGGCCTTTGATCAATTTTATGAAGGAACCATCGGAAGCG 1450
BSNT_00388___ 1451 GCTCTGGAAGCATCGGGATTGATAAAGACGGATTTTCAGGAAGAGACTCA 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
BSU02200___yb 1451 GCTCTGGAAGCATCGGGATTGATAAAGACGGGTATTCAGGAAGAGACTCA 1500
BSNT_00388___ 1501 GGTGCAAGCAATGTAAATCCGCCGTCTGATCCGGTATATGATGCAAGGCT 1550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU02200___yb 1501 GGTGCAAGCAATGTAAATCCGCCGTCTGATCCGGTATATGATGCAAGACT 1550
BSNT_00388___ 1551 GCGTACACTGACAGACATTTTATCTACCATTCCGGCTTTAGAAAATCTAA 1600
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU02200___yb 1551 GCGTACACTGACAGACATTTTATCTACCATTCCAGCTTTAGAAAATCTAA 1600
BSNT_00388___ 1601 CAAGTTTGGCAAACGCGATGTTTGAATTTGATACGACAGAAACCATTTTC 1650
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1601 CAAGTCTGGCAAACGCGATGTTTGAATTTGATACGACAGAAACCATTTTC 1650
BSNT_00388___ 1651 ACATCACCTGAGTTGGATATTATTCTATCAACTTCACTTCTGGCAACCAT 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1651 ACATCACCTGAGTTGGATATTATTCTATCAACTTCACTTCTGGCAACCAT 1700
BSNT_00388___ 1701 ACCAAGTGAAGGTTCACCAAACACAATTACCATTACAAATGGTAAACCAG 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1701 ACCAAGTGAAGGTTCACCAAACACAATTACCATTACAAATGGTAAACCAG 1750
BSNT_00388___ 1751 GTGCCTATATCACGGGTTTATTGGGCGACACTCAAACGTCTCTCACTGCG 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1751 GTGCCTATATCACGGGTTTATTGGGCGACACTCAAACGTCTCTCACTGCG 1800
BSNT_00388___ 1801 TCACAAATCGACTCTTATCAAAACCTTTTAAATAGTCTGAGCTTATCAGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1801 TCACAAATCGACTCTTATCAAAACCTTTTAAATAGTCTGAGCTTATCAGT 1850
BSNT_00388___ 1851 ACGCAACGGTTATTTGGAGGTTTATGTAAATCCAACAGCTGAATCTTTAA 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1851 ACGCAACGGTTATTTGGAGGTTTATGTAAATCCAACAGCTGAATCTTTAA 1900
BSNT_00388___ 1901 ACATTCAAATTAAAATCTATACACCTGATATTCCAGTCGGTGACAATGTC 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1901 ACATTCAAATTAAAATCTATACACCTGATATTCCAGTCGGTGACAATGTC 1950
BSNT_00388___ 1951 ACAACTGGACTAACGACTACGATTACGTTTAAAATAAAGACGTACAAGGG 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 1951 ACAACTGGACTAACGACTACGATTACGTTTAAAATAAAGACGTACAAGGG 2000
BSNT_00388___ 2001 AGTACCAGTTACGTCTCCCGAGAGTGAATTAGCGTTAGATTGGCCGTCTT 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 2001 AGTACCAGTTACGTCTCCCGAGAGTGAATTAGCGTTAGATTGGCCGTCTT 2050
BSNT_00388___ 2051 ATGATCAATATTTATTCCCTGTTGTAGGTGTTGCTGCACTTTTACTAATT 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 2051 ATGATCAATATTTATTCCCTGTTGTAGGTGTTGCTGCACTTTTACTAATT 2100
BSNT_00388___ 2101 GGGAATATGGGCAGTGATTTAACGAACAATAAAGGAGTCAAAGTCGCTAC 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 2101 GGGAATATGGGCAGTGATTTAACGAACAATAAAGGAGTCAAAGTCGCTAC 2150
BSNT_00388___ 2151 CGCATTATCTGCTATGTTACTGGCCATTTTTGCTTATTATACTAGCTAA 2199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU02200___yb 2151 CGCATTATCTGCTATGTTACTGGCCATTTTTGCTTATTATACTAGCTAA 2199
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.