Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_02256 and BSU13420
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_02256 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:19:51
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_02256___ykoW.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU13420___ykoW.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_02256___ykoW-BSU13420___ykoW.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_02256___ykoW-BSU13420___ykoW.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_02256___ykoW
# 2: BSU13420___ykoW
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2250
# Identity: 2222/2250 (98.8%)
# Similarity: 2222/2250 (98.8%)
# Gaps: 0/2250 ( 0.0%)
# Score: 10998.0
#
#
#=======================================
BSNT_02256___ 1 ATGGGATTCGGTATTTGGTCAATGCATTTTGTAGGGATGATGGCCGTCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1 ATGGGATTCGGTATTTGGTCAATGCATTTTGTAGGGATGATGGCCGTCCA 50
BSNT_02256___ 51 TATGGAAATGCCGATGACATATGAATTCATGCCTTTAATGGCAGCCATTG 100
||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 51 TATGGAAATGCCGATGGAATATGAATTCATGCCTTTAATGGCAGCCATTG 100
BSNT_02256___ 101 GCGCATCTGTTTCGGGATCATTTGTGTCATTATATTTTGTCAGCCGGAAC 150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU13420___yk 101 GCGCATCTGTTTCGGGATCATTTGTGTCATTATATTTTGTCAGCCGGCAC 150
BSNT_02256___ 151 ATTCTTACATATTACAGACTGCTTACCGGATCAGTTGTGCTTGGCGCATC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 151 ATTCTTACATATTACAGACTGCTTACCGGATCAGTTGTGCTTGGCGCATC 200
BSNT_02256___ 201 TATTGCTTCTATGCACTATATCGGAATGTCTGCCATTTCCCGGGTAATGA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 201 TATTGCTTCTATGCACTATATCGGAATGTCTGCCATTTCCCGGGTAATGA 250
BSNT_02256___ 251 TTATTTACGAACCGATTTTATTTACAGTTTCAATTATCATTGCGATTGCA 300
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 251 TTATTTACGAACCTATTTTATTTACAGTTTCAATTATCATTGCGATTGCA 300
BSNT_02256___ 301 GCCTCTTTCGTCTCGTTAAAAATATTCTTTGACTTGGCCGTAAAAAAACA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 301 GCCTCTTTCGTCTCGTTAAAAATATTCTTTGACTTGGCCGTAAAAAAACA 350
BSNT_02256___ 351 TTCTGAGCATCTTATATTCTATAAAGTCGTCAGTTCAATTGTAATGGGCA 400
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 351 TTCTGAGCATCTTATATTCTATAAAGGCGTCAGTTCAATTGTAATGGGCA 400
BSNT_02256___ 401 TTGGGATTTCGGGCATGCACTACACAGGGATGCTTGCGGCAACTTTCCAT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 401 TTGGGATTTCGGGCATGCACTACACAGGGATGCTTGCGGCAACTTTCCAT 450
BSNT_02256___ 451 AAGGACATGGCTCCGCCCGGAAGCCATATGGAGGTGCAAACGTTTCATTG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 451 AAGGACATGGCTCCGCCCGGAAGCCATATGGAGGTGCAAACGTTTCATTG 500
BSNT_02256___ 501 GTCAATTTTTGTTACTTTAATTATTTTTTGTATCCAAACGTTATTGTTAT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 501 GTCAATTTTTGTTACTTTAATTATTTTTTGTATCCAAACGTTATTGTTAT 550
BSNT_02256___ 551 TCAGTTCCCATGCAGATCGAAAGTTTATTAAACAGAGCGAACGCATAAAG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 551 TCAGTTCCCATGCAGATCGAAAGTTTATTAAACAGAGCGAACGCATAAAG 600
BSNT_02256___ 601 GATAACGAACAGCGATTTCAGTCTTTAATCGTCCACAATATTGATGCAAT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 601 GATAACGAACAGCGATTTCAGTCTTTAATCGTCCACAATATTGATGCAAT 650
BSNT_02256___ 651 TTTTATTTTATCATTAGAAGGAGACATAATATCTTCCAATCACGCTGGTG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 651 TTTTATTTTATCATTAGAAGGAGACATAATATCTTCCAATCACGCTGGTG 700
BSNT_02256___ 701 AGGAAATGATCAGCAAATTTGGCTTCAGCATGCATGACTGGAGGAATTAC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 701 AGGAAATGATCAGCAAATTTGGCTTCAGCATGCATGACTGGAGGAATTAC 750
BSNT_02256___ 751 ACATCACTGAAGGTTAAGCGCCTTTTTGAGCAAGTTAAAAAAGATAAACA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 751 ACATCACTGAAGGTTAAGCGCCTTTTTGAGCAAGTTAAAAAAGATAAACA 800
BSNT_02256___ 801 AGCGATGAACAGCGATAGCGATCTTATCACTGAAAAAGGCCAGTTTCACT 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 801 AGCGATGAACAGCGATAGCGATCTTATCACTGAAAAAGGCCAGTTTCACT 850
BSNT_02256___ 851 TAAATATTACGCTTATACCTGTTGAGGTCAATCAGGAACTAGACAGCATT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 851 TAAATATTACGCTTATACCTGTTGAGGTCAATCAGGAACTAGACAGCATT 900
BSNT_02256___ 901 TATGTCATTTGTAAAGACATGACGAAGCAGTACAAAGCAGAAAAAGAAAT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 901 TATGTCATTTGTAAAGACATGACGAAGCAGTACAAAGCAGAAAAAGAAAT 950
BSNT_02256___ 951 CCATAGAATGGCTCATTATGATTCGCTTACAGACTTACCTAACAGAAGGC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 951 CCATAGAATGGCTCATTATGATTCGCTTACAGACTTACCTAACAGAAGGC 1000
BSNT_02256___ 1001 ATGCCATCTCTCATCTAACAAAGGTGCTGAATCGCGAGCATTCCTTGCAT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1001 ATGCCATCTCTCATCTAACAAAGGTGCTGAATCGCGAGCATTCCTTGCAT 1050
BSNT_02256___ 1051 TATAACACTGTTGTATTCTTTCTTGACTTAAACCGGTTTAAAGTGATTAA 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1051 TATAACACTGTTGTATTCTTTCTTGACTTAAACCGGTTTAAAGTGATTAA 1100
BSNT_02256___ 1101 CGATGCATTAGGGCATAATGTCGGTGATCAATTGCTTCAGTTTGCGGCTA 1150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU13420___yk 1101 CGATGCATTAGGGCATAATGTCGGTGATCAATTGCTTCAGTTTGCAGCTA 1150
BSNT_02256___ 1151 AACGTTTGTCATCTGTAGTCCCTGATAACGGATTTATCGCCCGTCTTGGC 1200
||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1151 AACGCCTGTCATCTGTAGTCCCTGATAACGGATTTATCGCCCGTCTTGGC 1200
BSNT_02256___ 1201 GGTGATGAATTTATTATTATATTAACAGACGCCAATACAGGAACAGGCGA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1201 GGTGATGAATTTATTATTATATTAACAGACGCCAATACAGGAACAGGCGA 1250
BSNT_02256___ 1251 AGCAGATGTTTTAGCAAGAAAAATTATCCAAAAATTCAAAAAACCTTTCA 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1251 AGCAGATGTTTTAGCAAGAAAAATTATCCAAAAATTCAAAAAACCTTTCA 1300
BSNT_02256___ 1301 AGATTCAAGATCACACCCTTGTCACATCTGTCAGTATCGGGATTGCGATA 1350
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1301 AAATTCAAGATCACACCCTTGTCACATCTGTCAGTATCGGGATTGCGATA 1350
BSNT_02256___ 1351 TCTCCAAAAGACGGGACTGATGGCCTTGAATTGATGAAAAAGGCTGATAT 1400
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1351 TCTCCAAAAGACGGGACGGATGGCCTTGAATTGATGAAAAAGGCTGATAT 1400
BSNT_02256___ 1401 GGCGATGTATGCGGCTAAAGAACGAAACAAAAGCAAATACAGATACTATT 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1401 GGCGATGTATGCGGCTAAAGAACGAAACAAAAGCAAATACAGATACTATT 1450
BSNT_02256___ 1451 CTTTTTCAATTGGCAACAAAGAAACCGTCAAGCTTAACCAAGAGATGGTA 1500
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1451 CTTTTTCAATCGGCAACAAAGAAACCGTTAAGCTTAACCAAGAGATGGTA 1500
BSNT_02256___ 1501 CTCAGAGAAGCAATCGAAAACGATAGATTTGTCTTGCATTATCAGCCGCA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1501 CTCAGAGAAGCAATCGAAAACGATAGATTTGTCTTGCATTATCAGCCGCA 1550
BSNT_02256___ 1551 ATTCAGTGTAAAAAAACAAAAAATGACAGGAGCAGAAGCACTGATACGCC 1600
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1551 ATTCAGTGTGAAAAAACAAAAAATGACAGGAGCAGAAGCACTGATACGCC 1600
BSNT_02256___ 1601 TTGTGACACCAGACGGGCAACTGCGTCCGCCCGGAGAATTTATCGGTGTC 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
BSU13420___yk 1601 TTGTGACACCAGACGGGCAACTGCGTCCGCCCGGAGAATTCATCGGTGTT 1650
BSNT_02256___ 1651 GCAGAAGAAACGGGACTTATTATTGATATCGGAAAGTGGATTATAGATGA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1651 GCAGAAGAAACGGGACTTATTATTGATATCGGAAAGTGGATTATAGATGA 1700
BSNT_02256___ 1701 AGCATGCAAGCAGGCAAGGATTTGGCACAATAAAGGCTATGATCTTTCTG 1750
|||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1701 AGCATGCAAGCAGGCAAGGATTTGGCATGACAAAGGCTATGATCTTTCTG 1750
BSNT_02256___ 1751 TCGCCATTAATATTTCCGCCAGACAGTTCCAATCCGAAGATCTGATTCCC 1800
||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||||||
BSU13420___yk 1751 TCGCCATTAATATTTCCGCCAGACAGTTTCAATCTAAAGATCTGATTCCC 1800
BSNT_02256___ 1801 CTCATCAAGGATACGCTTAATAAATACCAGCTTCCTCCGCAGCTTCTTGA 1850
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1801 CTCATCAAGGATACGCTTAATAAGTACCAGCTTCCTCCGCAGCTTCTTGA 1850
BSNT_02256___ 1851 AGTGGAGGTGACGGAAAGCATGACAATGGACAATCTCGATCACTCCAAAA 1900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU13420___yk 1851 AGTGGAGGTGACGGAAAGCATGACAATGGACAATCTCAATCACTCCAAAA 1900
BSNT_02256___ 1901 AGGTTTTGTCATCCCTTAAAGAATTAGGAATCAGAATCAGTATTGACGAT 1950
||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1901 AGGTTTTGTCATCCCTAACAGAATTAGGAATCAGAATCAGTATTGACGAT 1950
BSNT_02256___ 1951 TTCGGTACTGGTCACAGCTCCCTTAGCTATTTGAAGGACTTCCCGATTCA 2000
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 1951 TTCGGTACTGGTCACAGCTCTCTTAGCTATTTGAAGGACTTCCCGATTCA 2000
BSNT_02256___ 2001 CAGGCTGAAGATTGACAAATCATTTATTGACGATATTCAGACCCATCCTA 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 2001 CAGGCTGAAGATTGACAAATCATTTATTGACGATATTCAGACCCATCCTA 2050
BSNT_02256___ 2051 AATCAGAGCAAATTACCGGAGCTATTATTGCCATGGGGCATCAGCTGTCT 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 2051 AATCAGAGCAAATTACCGGAGCTATTATTGCCATGGGGCATCAGCTGTCT 2100
BSNT_02256___ 2101 TTGCAGGTGATTGCCGAAGGTGTGGAAAATGCAGCTCAAAAGCAGCTTCT 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 2101 TTGCAGGTGATTGCCGAAGGTGTGGAAAATGCAGCTCAAAAGCAGCTTCT 2150
BSNT_02256___ 2151 ATATGAAAAAGGCTGCGACCATTTGCAGGGCTTCTTTTTCAGCAGGCCAA 2200
.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 2151 TTTTGAAAAAGGCTGCGACCATTTGCAGGGCTTCTTTTTCAGCAGGCCAA 2200
BSNT_02256___ 2201 TACCTCCGGAACAATTCGAACAATTCATTATTGAACAGCCGTCGCAATAA 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13420___yk 2201 TACCTCCGGAACAATTCGAACAATTCATTATTGAACAGCCGTCGCAATAA 2250
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.