Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_02559 and BSU15520

See Amino acid alignment / Visit BSNT_02559 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:20:34
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_02559___carB.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU15520___pyrAB.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_02559___carB-BSU15520___pyrAB.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_02559___carB-BSU15520___pyrAB.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_02559___carB
# 2: BSU15520___pyrAB
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 3216
# Identity:    3163/3216 (98.4%)
# Similarity:  3163/3216 (98.4%)
# Gaps:           0/3216 ( 0.0%)
# Score: 15603.0
# 
#
#=======================================

BSNT_02559___      1 ATGCCAAAACGCGTAGACATTAACAAAATTTTAGTAATCGGATCTGGACC     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py      1 ATGCCAAAACGCGTAGACATTAACAAAATTTTAGTAATCGGATCTGGACC     50

BSNT_02559___     51 GATCATCATCGGCCAAGCAGCGGAATTTGACTATGCGGGAACACAAGCTT    100
                     |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
BSU15520___py     51 GATCATCATCGGCCAAGCAGCAGAATTTGACTATGCGGGAACACAAGCCT    100

BSNT_02559___    101 GTCTTGCTTTGAAAGAAGAAGGTTATGAAGTCATCCTTGTCAACTCAAAC    150
                     ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    101 GTCTTGCTTTGAAAGAAGAAGGCTATGAAGTCATCCTTGTCAACTCAAAC    150

BSNT_02559___    151 CCTGCCACGATCATGACAGATACAGAAATGGCTGACCGGGTTTACATCGA    200
                     |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    151 CCTGCAACGATCATGACAGATACAGAAATGGCTGACCGGGTTTACATCGA    200

BSNT_02559___    201 ACCGCTCACACCTGAATTCCTGACACGAATCATCAGAAAAGAGCGCCCGG    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    201 ACCGCTCACACCTGAATTCCTGACACGAATCATCAGAAAAGAGCGCCCGG    250

BSNT_02559___    251 ATGCCATTCTTCCTACACTCGGAGGTCAAACTGGTTTGAATCTTGCGGTT    300
                     |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
BSU15520___py    251 ATGCCATTCTTCCTACACTCGGAGGCCAAACCGGTTTGAATCTTGCGGTT    300

BSNT_02559___    301 GAGCTTTCTGAAAGAGGCGTTTTGGCAGAATGCGGCGTCGAAGTGCTTGG    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    301 GAGCTTTCTGAAAGAGGCGTTTTGGCAGAATGCGGCGTCGAAGTGCTTGG    350

BSNT_02559___    351 CACAAAACTGTCTGCGATTCAGCAAGCTGAAGACCGTGACTTGTTCAGAA    400
                     |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    351 CACGAAACTGTCTGCGATTCAGCAAGCTGAAGACCGTGACTTGTTCAGAA    400

BSNT_02559___    401 CATTAATGAATGAACTGAATGAACCGGTGCCTGAAAGTGAGATTATCCAC    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    401 CATTAATGAATGAACTGAATGAACCGGTGCCTGAAAGTGAGATTATCCAC    450

BSNT_02559___    451 TCCCTTGAAGAAGCAGAAAAATTCGTCAGTCAAATTGGATTCCCTGTCAT    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    451 TCCCTTGAAGAAGCAGAAAAATTCGTCAGTCAAATTGGATTCCCTGTCAT    500

BSNT_02559___    501 TGTCCGCCCGGCATATACATTAGGCGGAACAGGCGGAGGCATCTGCTCGA    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    501 TGTCCGCCCGGCATATACATTAGGCGGAACAGGCGGAGGCATCTGCTCGA    550

BSNT_02559___    551 ATGAGACAGAGTTAAAAGAAATCGTTGAGAACGGCTTGAAATTAAGCCCG    600
                     ||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    551 ATGAAACAGAGCTAAAAGAAATCGTTGAGAACGGCTTGAAATTAAGCCCG    600

BSNT_02559___    601 GTACACCAATGTCTGCTTGAAAAAAGCATCGCCGGCTATAAAGAAATCGA    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    601 GTACACCAATGTCTGCTTGAAAAAAGCATCGCCGGCTATAAAGAAATCGA    650

BSNT_02559___    651 GTATGAAGTCATGAGAGACAGCCAAGATCACGCCATTGTCGTTTGTAACA    700
                     ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    651 GTATGAAGTCATGAGAGACAGCCAGGATCACGCCATTGTCGTTTGTAACA    700

BSNT_02559___    701 TGGAAAACATTGATCCAGTTGGAATCCATACTGGAGACAGTATTGTTGTC    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    701 TGGAAAACATTGATCCAGTTGGAATCCATACTGGAGACAGTATTGTTGTC    750

BSNT_02559___    751 GCGCCGAGCCAAACGCTCAGCGATCGCGAATATCAGCTCTTGCGGAATGT    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    751 GCGCCGAGCCAAACGCTCAGCGATCGCGAATATCAGCTCTTGCGGAATGT    800

BSNT_02559___    801 ATCGTTAAAACTGATTCGCGCACTTGGGATCGAAGGCGGATGTAACGTCC    850
                     |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
BSU15520___py    801 ATCGTTAAAACTGATTCGCGCGCTTGGGATCGAAGGCGGATGTAATGTCC    850

BSNT_02559___    851 AGCTCGCCTTAGATCCGGACAGCTTCCAATATTACATTATTGAAGTAAAT    900
                     ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    851 AGCTCGCCTTAGATCCAGACAGCTTCCAATATTACATTATTGAAGTAAAT    900

BSNT_02559___    901 CCGCGTGTCAGCCGTTCATCTGCCCTTGCATCAAAAGCAACGGGGTACCC    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    901 CCGCGTGTCAGCCGTTCATCTGCCCTTGCATCAAAAGCAACGGGGTACCC    950

BSNT_02559___    951 GATAGCAAAGCTCGCCGCTAAAATTGCAGTCGGACTTTCATTAGATGAAA   1000
                     |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py    951 GATTGCAAAGCTCGCTGCTAAAATTGCAGTCGGACTTTCATTAGATGAAA   1000

BSNT_02559___   1001 TGATGAACCCGGTGACAGGAAAAACATATGCAGCATTTGAACCAGCTCTT   1050
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU15520___py   1001 TGATGAACCCGGTGACAGGAAAAACATATGCAGCATTTGAACCTGCTCTT   1050

BSNT_02559___   1051 GACTATGTCGTATCCAAAATTCCGCGCTGGCCGTTTGATAAGTTTGAATC   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1051 GACTATGTCGTATCCAAAATTCCGCGCTGGCCGTTTGATAAGTTTGAATC   1100

BSNT_02559___   1101 AGCAAACAGAAAGCTTGGCACGCAAATGAAAGCGACAGGTGAGGTCATGG   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1101 AGCAAACAGAAAGCTTGGCACGCAAATGAAAGCGACAGGTGAGGTCATGG   1150

BSNT_02559___   1151 CAATCGGCCGCACACTTGAAGAGTCATTGCTGAAGGCAGTGAGATCACTG   1200
                     |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU15520___py   1151 CAATCGGCCGCACGCTTGAAGAGTCATTGCTGAAGGCAGTGCGATCACTG   1200

BSNT_02559___   1201 GAAGCGGATGTGTATCATCTTGAATTGAAGGACGCCGCTGACATTTCAGA   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1201 GAAGCGGATGTGTATCATCTTGAATTGAAGGACGCCGCTGACATTTCAGA   1250

BSNT_02559___   1251 TGAGCTTCTTGAAAAGCGAATTAAAAAGGCCGGTGATGAACGCTTATTCT   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1251 TGAGCTTCTTGAAAAGCGAATTAAAAAGGCCGGTGATGAACGCTTATTCT   1300

BSNT_02559___   1301 ACTTAGCTGAAGCGTACAGAAGAGGCTACACGGTAGAAGACCTCCATGAA   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1301 ACTTAGCTGAAGCGTACAGAAGAGGCTACACGGTAGAAGACCTCCATGAA   1350

BSNT_02559___   1351 TTTTCCGCTATCGATGTCTTCTTCTTGCATAAGCTGTTCGGAATCGTACA   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1351 TTTTCCGCTATCGATGTCTTCTTCTTGCATAAGCTGTTCGGAATCGTACA   1400

BSNT_02559___   1401 GTTTGAAAAAGAATTGAAGGCCAATGCGGGCAATACGGATGTGCTGAGAC   1450
                     |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
BSU15520___py   1401 GTTTGAAAAAGAATTGAAGGCCAATGCGGGCGATACAGATGTGCTGAGAC   1450

BSNT_02559___   1451 GGGCAAAAGAACTCGGCTTCTCTGATCAGTACATTAGCCGCGAGTGGAAA   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
BSU15520___py   1451 GGGCAAAAGAACTCGGCTTCTCTGATCAGTACATCAGCCGTGAATGGAAA   1500

BSNT_02559___   1501 ATGAAAGAATCTGAGCTTTACAGCTTGAGAAAACAAGCGGGGATTGAGCC   1550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU15520___py   1501 ATGAAAGAATCTGAGCTTTACAGCTTGAGAAAACAAGCGGGGATTGCGCC   1550

BSNT_02559___   1551 GGTATTCAAAATGGTAGATACGTGCGCGGCGGAATTCGAGTCAGAAACGC   1600
                     |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
BSU15520___py   1551 GGTATTCAAAATGGTAGATACATGCGCGGCGGAATTTGAGTCAGAAACGC   1600

BSNT_02559___   1601 CATACTTCTATAGCACATACGAAGAAGAAAATGAATCTGTCGTTACAGAT   1650
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1601 CATACTTCTATAGCACATATGAAGAAGAAAATGAATCTGTCGTTACAGAT   1650

BSNT_02559___   1651 AAGAAAAGTGTGATGGTGCTTGGTTCGGGGCCGATTCGAATCGGTCAGGG   1700
                     |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1651 AAGAAAAGTGTGATGGTGCTTGGTTCGGGTCCGATTCGAATCGGTCAGGG   1700

BSNT_02559___   1701 TGTCGAGTTCGACTATGCGACGGTTCACTCTGTATGGGCAATTAAACAAG   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1701 TGTCGAGTTCGACTATGCGACGGTTCACTCTGTATGGGCAATTAAACAAG   1750

BSNT_02559___   1751 CAGGCTATGAAGCCATTATTGTCAACAACAACCCGGAAACCGTTTCAACA   1800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1751 CAGGCTATGAAGCCATTATTGTCAACAACAACCCGGAAACCGTTTCAACA   1800

BSNT_02559___   1801 GACTTCAGCATCTCAGACAAGCTGTATTTTGAACCGCTTACGATTGAAGA   1850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   1801 GACTTCAGCATCTCAGACAAGCTGTATTTTGAACCGCTTACGATTGAAGA   1850

BSNT_02559___   1851 TGTTATGCACATCATTGACCTCGAACAGCCAATAGGCGTTGTCGTACAGT   1900
                     |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
BSU15520___py   1851 TGTCATGCACATCATTGACCTCGAACAGCCAATGGGCGTTGTCGTACAAT   1900

BSNT_02559___   1901 TCGGCGGACAAACTGCGATTAACCTTGCTGACGAGCTTTCTGCGCGCGGA   1950
                     |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU15520___py   1901 TTGGCGGACAAACTGCGATTAACCTTGCTGACGAGCTTTCTGCACGCGGA   1950

BSNT_02559___   1951 GTGAAAATCCTTGGAACTTCATTAGAAGATTTAGACCGTGCAGAAGACCG   2000
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU15520___py   1951 GTGAAAATCCTTGGAACTTCATTAGAAGATTTAGACCGTGCCGAAGACCG   2000

BSNT_02559___   2001 GGATAAATTTGAACAAGCGCTTGGAGAACTTGGTGTTCCGCAGCCGCTTG   2050
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU15520___py   2001 GGATAAATTTGAACAAGCGCTTGGAGAACTTGGTGTTCCTCAGCCGCTTG   2050

BSNT_02559___   2051 GCAAAACAGCCACATCAGTTGATCAGGCGGTAAGCATCGCGAGTGATATC   2100
                     ||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
BSU15520___py   2051 GCAAAACAGCGACATCAGTTAATCAGGCGGTAAGCATCGCAAGTGATATC   2100

BSNT_02559___   2101 GGTTATCCGGTACTGGTACGCCCTTCCTATGTACTTGGCGGCCGGGCAAT   2150
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU15520___py   2101 GGTTATCCGGTACTGGTACGCCCTTCCTATGTACTTGGCGGCCGGGCGAT   2150

BSNT_02559___   2151 GGAGATTGTGTATCATGAAGAAGAGCTGCTTCATTACATGAAAAACGCAG   2200
                     |||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
BSU15520___py   2151 GGAGATTGTTTACCATGAAGAGGAACTGCTTCATTACATGAAAAATGCAG   2200

BSNT_02559___   2201 TTAAAATCAATCCGCAGCACCCTGTATTAATTGATAGATACTTGACCGGA   2250
                     |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2201 TCAAAATCAATCCACAGCACCCTGTATTAATTGATAGATACTTGACCGGA   2250

BSNT_02559___   2251 AAAGAAATTGAAGTCGATGCAGTATCCGACGGTGAAACAGTCGTCATTCC   2300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2251 AAAGAAATTGAAGTCGATGCAGTATCCGACGGTGAAACAGTCGTCATTCC   2300

BSNT_02559___   2301 GGGAATTATGGAGCACATTGAACGTGCGGGCGTTCACTCCGGAGACTCGA   2350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU15520___py   2301 GGGAATTATGGAGCACATTGAACGTGCGGGCGTTCACTCCGGAGACTCAA   2350

BSNT_02559___   2351 TCGCTGTTTATCCGCCTCAGTCTCTCACAGAGGACATTAAGAAAAAAATT   2400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2351 TCGCTGTTTATCCGCCTCAGTCTCTCACAGAGGACATTAAGAAAAAAATT   2400

BSNT_02559___   2401 GAACAATACACGATCGCATTGGCTAAAGGGCTGAATATTGTCGGTTTGCT   2450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2401 GAACAATACACGATCGCATTGGCTAAAGGGCTGAATATTGTCGGTTTGCT   2450

BSNT_02559___   2451 CAATATTCAATTCGTCTTGTCGCAATGCGAGGTGTACGTGCTAGAAGTGA   2500
                     |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2451 CAATATTCAATTCGTCTTGTCGCAAGGCGAGGTGTACGTGCTAGAAGTGA   2500

BSNT_02559___   2501 ATCCGAGATCAAGCAGAACCGTACCGTTTTTAAGCAAAATTACGGGTATC   2550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2501 ATCCGAGATCAAGCAGAACCGTACCGTTTTTAAGCAAAATTACGGGTATC   2550

BSNT_02559___   2551 CCAATGGCGAATCTCGCAACAAAAATCATTCTTGGTCAAAAGCTGGCTGC   2600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2551 CCAATGGCGAATCTCGCAACAAAAATCATTCTTGGTCAAAAGCTGGCTGC   2600

BSNT_02559___   2601 GTTTGGCTATACAGAGGGCCTTCAGCCTGAACAGCAAGGTGTATTTGTAA   2650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2601 GTTTGGCTATACAGAGGGCCTTCAGCCTGAACAGCAAGGTGTATTTGTAA   2650

BSNT_02559___   2651 AAGCGCCGGTCTTCTCCTTTGCCAAGCTGAGAAGAGTGGACATTACGTTA   2700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU15520___py   2651 AAGCGCCGGTCTTCTCCTTTGCCAAGCTGAGAAGAGTGGATATTACGTTA   2700

BSNT_02559___   2701 GGGCCTGAAATGAAATCAACCGGTGAAGTCATGGGGAAAGATTCGACACT   2750
                     ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2701 GGGCCTGAAATGAAATCAACAGGTGAAGTCATGGGGAAAGATTCGACACT   2750

BSNT_02559___   2751 TGAAAAGGCGCTCTACAAAGCCTTGATTGCTTCAGGTATTCAAATCCCGA   2800
                     |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2751 TGAAAAGGCGCTCTACAAAGCCTTGATCGCTTCAGGTATTCAAATCCCGA   2800

BSNT_02559___   2801 ACTACGGTTCCGTGCTTTTAACAGTAGCTGATAAGGACAAAGAAGAAGGG   2850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2801 ACTACGGTTCCGTGCTTTTAACAGTAGCTGATAAGGACAAAGAAGAAGGG   2850

BSNT_02559___   2851 CTTGCCATTGCTAAGCGGTTCCACGCGATCGGCTACAACATTTTAGCGAC   2900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2851 CTTGCCATTGCTAAGCGGTTCCACGCGATCGGCTACAACATTTTAGCGAC   2900

BSNT_02559___   2901 GGAAGGAACGGCAGGCTACTTGAAAGAAGCTTCCATTCCAGCGAAGGTCG   2950
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   2901 GGAAGGAACGGCAGGCTACCTGAAAGAAGCTTCCATTCCAGCGAAGGTCG   2950

BSNT_02559___   2951 TCGGAAAAATCGGTCAGGATGGCCCGAACTTGCTTGACGTCATCAGAAAC   3000
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU15520___py   2951 TCGGAAAAATCGGTCAGGATGGCCCGAACTTGCTTGATGTCATCAGAAAC   3000

BSNT_02559___   3001 GGAGAAGCGCAGTTTGTCATCAATACGCTGACAAAAGGAAAGCAGCCGGC   3050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   3001 GGAGAAGCGCAGTTTGTCATCAATACGCTGACAAAAGGAAAGCAGCCGGC   3050

BSNT_02559___   3051 AAGAGACGGTTTTAGAATCAGACGTGAATCAGTAGAAAATGGTGTTGCCT   3100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   3051 AAGAGACGGTTTTAGAATCAGACGTGAATCAGTAGAAAATGGTGTTGCCT   3100

BSNT_02559___   3101 GCCTAACATCTTTAGATACGGCAGAGGCGATATTGCGAGTGCTGGAAAGC   3150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   3101 GCCTAACATCTTTAGATACGGCAGAGGCGATATTGCGAGTGCTGGAAAGC   3150

BSNT_02559___   3151 ATGACATTCCGTGCTGATCAAATGCCGGCAGTCAACACAAATCAGGAGGC   3200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py   3151 ATGACATTCCGTGCTGATCAAATGCCGGCAGTCAACACAAATCAGGAGGC   3200

BSNT_02559___   3201 GGCAGTCACTATATGA   3216
                     ||||||||||||||||
BSU15520___py   3201 GGCAGTCACTATATGA   3216


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.