Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_02802 and BSU17460
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_02802 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:21:11
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_02802___glnA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU17460___glnA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_02802___glnA-BSU17460___glnA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_02802___glnA-BSU17460___glnA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_02802___glnA
# 2: BSU17460___glnA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1335
# Identity: 1315/1335 (98.5%)
# Similarity: 1315/1335 (98.5%)
# Gaps: 0/1335 ( 0.0%)
# Score: 6495.0
#
#
#=======================================
BSNT_02802___ 1 ATGGCAAATTACACTAGAGAAGATATCGAAACATTAGTAAAAGAAGAAAA 50
||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU17460___gl 1 ATGGCAAAGTACACTAGAGAAGATATCGAAAAATTAGTAAAAGAAGAAAA 50
BSNT_02802___ 51 CGTGAAGTATATCCGCCTTCAATTTACTGACATTCTTGGAACAATCAAGA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 51 CGTGAAGTATATCCGCCTTCAATTTACTGACATTCTTGGAACAATCAAGA 100
BSNT_02802___ 101 ATGTTGAGATTCCTGTAAGCCAGCTTGGAAAAGCGCTTGATAATAAAGTC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 101 ATGTTGAGATTCCTGTAAGCCAGCTTGGAAAAGCGCTTGATAATAAAGTC 150
BSNT_02802___ 151 ATGTTTGACGGTTCTTCTATTGAGGGATTCGTTCGTATCGAAGAGTCAGA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 151 ATGTTTGACGGTTCTTCTATTGAGGGATTCGTTCGTATCGAAGAGTCAGA 200
BSNT_02802___ 201 CATGTACCTGTATCCAGATCTAAATACATTTGTTATCTTCCCATGGACAG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 201 CATGTACCTGTATCCAGATCTAAATACATTTGTTATCTTCCCATGGACAG 250
BSNT_02802___ 251 CTGAAAAAGGTAAAGTAGCACGTTTCATCTGTGATATTTATAATCCGGAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU17460___gl 251 CTGAAAAAGGTAAAGTAGCACGTTTCATCTGTGATATTTACAATCCGGAT 300
BSNT_02802___ 301 GGCACACCTTTCGAAGGTGACCCGCGAAACAACTTAAAACGGATTCTGAA 350
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 301 GGCACACCTTTTGAAGGTGACCCGCGAAACAACTTAAAACGGATTCTGAA 350
BSNT_02802___ 351 AGAAATGGAAGACCTCGGCTTCAGTGATTTTAACCTTGGACCTGAGCCTG 400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU17460___gl 351 AGAAATGGAAGACCTCGGCTTCAGTGATTTTAACCTTGGGCCTGAGCCTG 400
BSNT_02802___ 401 AATTCTTCTTATTCAAATTGGACGAAAAAGGCGAGCCAACGCTTGAACTA 450
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU17460___gl 401 AATTCTTCTTATTCAAATTGGACGAAAAAGGCGAGCCGACGCTTGAACTA 450
BSNT_02802___ 451 AACGACAAAGGCGGATATTTCGACTTAGCGCCAACTGATTTAGGAGAAAA 500
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 451 AACGACAAAGGCGGATATTTCGACTTAGCTCCAACTGATTTAGGAGAAAA 500
BSNT_02802___ 501 CTGCCGCCGCGATATCGTGCTTGAGCTTGAAGAGATGGGCTTTGAAATCG 550
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 501 CTGCCGCCGCGATATCGTACTTGAGCTTGAAGAGATGGGCTTTGAAATCG 550
BSNT_02802___ 551 AAGCGTCTCACCACGAAGTAGCACCTGGTCAACACGAAATCGACTTTAAA 600
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU17460___gl 551 AAGCGTCTCACCACGAAGTAGCACCTGGTCAGCACGAAATCGACTTTAAA 600
BSNT_02802___ 601 TATGCTGGAGCAGTCCGCTCTTGTGATGACATCCAAACTTTTAAACTAGT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU17460___gl 601 TATGCTGGAGCAGTCCGCTCTTGTGATGACATCCAAACATTTAAACTAGT 650
BSNT_02802___ 651 TGTCAAAACAATTGCCCGCAAACACGGCCTGCATGCGACATTTATGCCAA 700
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 651 TGTCAAAACAATTGCCCGTAAACACGGCCTGCATGCGACATTTATGCCAA 700
BSNT_02802___ 701 AACCATTGTTCGGTGTGAACGGTTCAGGTATGCACTGCAATCTATCACTC 750
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 701 AACCATTGTTCGGTGTAAACGGTTCAGGTATGCACTGCAATCTATCACTC 750
BSNT_02802___ 751 TTCAAAAATGGTGTTAACGCATTCTTTGACGAAAACGCAGATCTTCAGTT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 751 TTCAAAAATGGTGTTAACGCATTCTTTGACGAAAACGCAGATCTTCAGTT 800
BSNT_02802___ 801 AAGTGAAACAGCGAAACACTTCATTGCAGGTATCGTGAAGCACGCAACAA 850
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 801 AAGTGAAACAGCGAAGCACTTCATTGCAGGTATCGTGAAGCACGCAACAA 850
BSNT_02802___ 851 GCTTTACAGCAGTAACAAACCCGACAGTAAACTCTTACAAACGTCTTGTT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 851 GCTTTACAGCAGTAACAAACCCGACAGTAAACTCTTACAAACGTCTTGTT 900
BSNT_02802___ 901 CCTGGCTATGAAGCACCTTGCTATGTAGCATGGAGCGCGCAAAACAGAAG 950
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 901 CCTGGCTATGAAGCACCTTGTTATGTAGCATGGAGCGCGCAAAACAGAAG 950
BSNT_02802___ 951 CCCGCTTATCCGTATCCCGGCTTCTCGCGGCATCAGCACACGTGTTGAAG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 951 CCCGCTTATCCGTATCCCGGCTTCTCGCGGCATCAGCACACGTGTTGAAG 1000
BSNT_02802___ 1001 TACGCAGCGTAGACCCAGCTGCAAACCCATACCTTGCACTTAGCGTATTG 1050
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 1001 TACGCAGTGTAGACCCAGCTGCAAACCCATACCTTGCACTTAGCGTATTG 1050
BSNT_02802___ 1051 CTTGCTGCAGGTTTAGACGGTATCAAAAACAAACTGGAAGCGCCGGCTCC 1100
|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 1051 CTTGCTGCAGGATTAGACGGAATCAAAAACAAACTGGAAGCGCCGGCTCC 1100
BSNT_02802___ 1101 AATCGACCGCAACATCTATGTGATGAGCAAAGAAGAGCGCATGGAAAACG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 1101 AATCGACCGCAACATCTATGTGATGAGCAAAGAAGAGCGCATGGAAAACG 1150
BSNT_02802___ 1151 GAATCGTTGACCTTCCAGCAACACTTGCGGAAGCACTAGAAGAATTCAAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 1151 GAATCGTTGACCTTCCAGCAACACTTGCGGAAGCACTAGAAGAATTCAAA 1200
BSNT_02802___ 1201 TCAAACGAAGTCATGGTCAAAGCGCTGGGCGAGCACCTATTCGAACACTT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 1201 TCAAACGAAGTCATGGTCAAAGCGCTGGGCGAGCACCTATTCGAACACTT 1250
BSNT_02802___ 1251 CATCGAAGCAAAAGAAATCGAATGGGATATGTTCCGCACGCAAGTTCACC 1300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
BSU17460___gl 1251 CATCGAAGCAAAAGAAATCGAATGGGATATGTTCCGCACGCAAGTACATC 1300
BSNT_02802___ 1301 CTTGGGAACACGAACAGTATATGTCTCAGTATTAA 1335
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU17460___gl 1301 CTTGGGAACGCGAACAGTATATGTCTCAGTATTAA 1335
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.