Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03325 and BSU22320
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03325 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:21:58
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03325___ponA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU22320___ponA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03325___ponA-BSU22320___ponA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03325___ponA-BSU22320___ponA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03325___ponA
# 2: BSU22320___ponA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2745
# Identity: 2728/2745 (99.4%)
# Similarity: 2728/2745 (99.4%)
# Gaps: 0/2745 ( 0.0%)
# Score: 13572.0
#
#
#=======================================
BSNT_03325___ 1 ATGTCAGATCAATTTAACAGCCGTGAAGCTCGACGAAAAGCGAACAGCAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1 ATGTCAGATCAATTTAACAGCCGTGAAGCTCGACGAAAAGCGAACAGCAA 50
BSNT_03325___ 51 GTCGAGCCCTTCACCGAAAAAAGGCAAGAAACGAAAAAAGGGCGGATTGT 100
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 51 ATCGAGTCCTTCACCGAAAAAAGGCAAGAAACGAAAAAAGGGCGGATTGT 100
BSNT_03325___ 101 TTAAAAAGACCCTTTTCACTTTACTCATTCTGTTTGTTTTAGGCGTAGTC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 101 TTAAAAAGACCCTTTTCACTTTACTCATTCTGTTTGTTTTAGGCGTAGTC 150
BSNT_03325___ 151 GGCGGCGCTGTTACATTTGCCGTTATGGTTTCAGATGCGCCGTCCCTTGA 200
|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
BSU22320___po 151 GGCGGTGCTGTTACATTTGCCGTCATGGTTTCTGATGCGCCGTCCCTTGA 200
BSNT_03325___ 201 TGAAAGCAAATTGAAGACGCCTTATTCATCAACGATTTATGATAAAAATG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 201 TGAAAGCAAATTGAAGACGCCTTATTCATCAACGATTTATGATAAAAATG 250
BSNT_03325___ 251 GAAAAGAGATCGCCGAAGTCGGCGCCGAAAAACGGACCTACGTCTCGATA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 251 GAAAAGAGATCGCCGAAGTCGGCGCCGAAAAACGGACCTACGTCTCGATA 300
BSNT_03325___ 301 GATGAAATTCCCGATGTTGTAAAAGAAGCCTTTATCGCGACAGAAGACGC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 301 GATGAAATTCCCGATGTTGTAAAAGAAGCCTTTATCGCGACAGAAGACGC 350
BSNT_03325___ 351 CCGTTTTTATGAGCACCACGGGATTGACCCTGTCCGTATCGGCGGTGCTT 400
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU22320___po 351 TCGTTTTTATGAGCACCACGGGATTGACCCTGTCCGTATCGGCGGTGCAT 400
BSNT_03325___ 401 TAGTTGCCAACTTTAAAGACGGCTTCGGGGCTGAAGGCGGAAGTACGATC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 401 TAGTTGCCAACTTTAAAGACGGCTTCGGGGCTGAAGGCGGAAGTACGATC 450
BSNT_03325___ 451 ACCCAGCAGGTCGTCAAAAACTCCCTTCTTTCACATCAGAAGACGTTGAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 451 ACCCAGCAGGTCGTCAAAAACTCCCTTCTTTCACATCAGAAGACGTTGAA 500
BSNT_03325___ 501 ACGGAAGGTCCAGGAAGTATGGCTTTCAATTCAGCTGGAGCGCAATTACT 550
|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 501 ACGGAAGGTGCAGGAAGTATGGCTTTCGATTCAGCTGGAGCGCAATTACT 550
BSNT_03325___ 551 CTAAAGATGAAATTTTAGAAATGTATTTAAACCGGATTTATTTTTCTCCT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 551 CTAAAGATGAAATTTTAGAAATGTATTTAAACCGGATTTATTTTTCTCCT 600
BSNT_03325___ 601 AGAGCATACGGAATCGGAAAAGCGGCGGAAGAATTTTTCGGCGTTACAGA 650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU22320___po 601 AGAGCATACGGAATCGGAAAAGCGGCGGAAGAATTTTTCGGCGTTACTGA 650
BSNT_03325___ 651 TTTAAGCAAATTGACTGTCGAACAGGCTGCCACACTGGCAGGAATGCCGC 700
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
BSU22320___po 651 TTTAAGCAAATTGACTGTCGAACAGGCTGCGACGCTTGCAGGAATGCCGC 700
BSNT_03325___ 701 AGAGCCCGACAGCGTACAATCCCGTTAAAAACCCGGATAAAGCGGAAAAA 750
|||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 701 AGAGCCCAACAGCGTACAACCCGGTCAAAAACCCGGATAAAGCGGAAAAA 750
BSNT_03325___ 751 CGACGGAACATCGTACTCAGTCTGATGAAAAAGCAAGGATTTATTTCTGA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 751 CGACGGAACATCGTACTCAGTCTGATGAAAAAGCAAGGATTTATTTCTGA 800
BSNT_03325___ 801 TTCTCAATATAACAAAGCGAAAAAAGTGGCAGTGAAAGACGAAGGCGTCG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 801 TTCTCAATATAACAAAGCGAAAAAAGTGGCAGTGAAAGACGAAGGCGTCG 850
BSNT_03325___ 851 TGTCACAGAAGGAATATGAAAAAGCAAGTACAAACAAATACAGCGCATTT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 851 TGTCACAGAAGGAATATGAAAAAGCAAGTACAAACAAATACAGCGCATTT 900
BSNT_03325___ 901 GTTGAAGAGGTTATGAAGGAAATTGATGAAAAATCTGATGTCGATCCATC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 901 GTTGAAGAGGTTATGAAGGAAATTGATGAAAAATCTGATGTCGATCCATC 950
BSNT_03325___ 951 TGCTGACGGATTAAAGATCTATACGACATTAGATACAAAAGCACAAGATA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 951 TGCTGACGGATTAAAGATCTATACGACATTAGATACAAAAGCACAAGATA 1000
BSNT_03325___ 1001 AACTAGATGAATTAATGGACGGAGACACCGTCGGATTTACTGAAGGCATG 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1001 AACTAGATGAATTAATGGACGGAGACACCGTCGGATTTACTGAAGGCATG 1050
BSNT_03325___ 1051 CAGGGCGGTGTGACGCTTCTCGATACCAAAAACGGAGAAGTCCGAGCGAT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1051 CAGGGCGGTGTGACGCTTCTCGATACCAAAAACGGAGAAGTCCGAGCGAT 1100
BSNT_03325___ 1101 TGGTGCGGGACGCAATCAGCCTGTCGGAGGCTTTAACTATGCTACTCAAA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1101 TGGTGCGGGACGCAATCAGCCTGTCGGAGGCTTTAACTATGCTACTCAAA 1150
BSNT_03325___ 1151 CTAAGGCACAGCCTGGTTCGACCATAAAACCGATTTTGGACTACGGACCA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1151 CTAAGGCACAGCCTGGTTCGACCATAAAACCGATTTTGGACTACGGACCA 1200
BSNT_03325___ 1201 GTTATTGAAAATAAGAAATGGTCCACATACGAACAAATTGATGACTCAGC 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1201 GTTATTGAAAATAAGAAATGGTCCACATACGAACAAATTGATGACTCAGC 1250
BSNT_03325___ 1251 TTATACGTATTCTAACGGAAAACCGATTCGTGATTGGGACCGCAAATATC 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1251 TTATACGTATTCTAACGGAAAACCGATTCGTGATTGGGACCGCAAATATC 1300
BSNT_03325___ 1301 TAGGGCCTATCTCAATGCGTTACGCTCTGGCCCAATCAAGAAATATACCT 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1301 TAGGGCCTATCTCAATGCGTTACGCTCTGGCCCAATCAAGAAATATACCT 1350
BSNT_03325___ 1351 GCTTTAAAAGCATTCCAGGCAGTCGGTAAAGATACTGCTGTAGACTTTGC 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1351 GCTTTAAAAGCATTCCAGGCAGTCGGTAAAGATACTGCTGTAGACTTTGC 1400
BSNT_03325___ 1401 AAATGGACTCGGGCTTGGTTTAACAAAAGATAATGTAACAGAGGCCTATT 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1401 AAATGGACTCGGGCTTGGTTTAACAAAAGATAATGTAACAGAGGCCTATT 1450
BSNT_03325___ 1451 CTATTGGCGGTTTCGGTGGGAACGATGGTGTTTCTCCTCTGACAATGGCA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1451 CTATTGGCGGTTTCGGTGGGAACGATGGTGTTTCTCCTCTGACAATGGCA 1500
BSNT_03325___ 1501 GGTGCATACAGCGCGTTTGGAAATAACGGAACGTATAATGAACCGCATTT 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1501 GGTGCATACAGCGCGTTTGGAAATAACGGAACGTATAATGAACCGCATTT 1550
BSNT_03325___ 1551 TGTAAAATCTATCGAATTTAACGATGGCACGAAGCTTGACTTAACACCAA 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1551 TGTAAAATCTATCGAATTTAACGATGGCACGAAGCTTGACTTAACACCAA 1600
BSNT_03325___ 1601 AATCAAAATCAGCCATGAGTGATTATACTGCGTTTATGATTACAGATATG 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1601 AATCAAAATCAGCCATGAGTGATTATACTGCGTTTATGATTACAGATATG 1650
BSNT_03325___ 1651 CTGAAAACAGCTGTGAAGACAGGTACTGGACAGCTTGCACAAGTACCTGG 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1651 CTGAAAACAGCTGTGAAGACAGGTACTGGACAGCTTGCACAAGTACCTGG 1700
BSNT_03325___ 1701 TGTAGAAGTTGCAGGAAAAACAGGAACGACTAACTTTGATGATAATGAAG 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1701 TGTAGAAGTTGCAGGAAAAACAGGAACGACTAACTTTGATGATAATGAAG 1750
BSNT_03325___ 1751 TCAAAAGGTACAATATCGCTAGCGGTGGCGCCCGAGATTCTTGGTTCGTT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1751 TCAAAAGGTACAATATCGCTAGCGGTGGCGCCCGAGATTCTTGGTTCGTT 1800
BSNT_03325___ 1801 GGCTACACACCGCAATATACAGCTGCCGTCTGGACGGGAATGGGAGAAAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1801 GGCTACACACCGCAATATACAGCTGCCGTCTGGACGGGAATGGGAGAAAA 1850
BSNT_03325___ 1851 CGAGGCTGGAAAGAAATCACTTTCAGCTGAAGAGCAAAAAGTTGCAAAGC 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1851 CGAGGCTGGAAAGAAATCACTTTCAGCTGAAGAGCAAAAAGTTGCAAAGC 1900
BSNT_03325___ 1901 GCATCTTCGCCCAGCTCATCGCCGATGTCGATGACGGAAGCGGATCATTT 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1901 GCATCTTCGCCCAGCTCATCGCCGATGTCGATGACGGAAGCGGATCATTT 1950
BSNT_03325___ 1951 GAGAAGCCTGACAGCGTAGTGGAAGCCACCGTAGAAAAAGGTTCTAATCC 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 1951 GAGAAGCCTGACAGCGTAGTGGAAGCCACCGTAGAAAAAGGTTCTAATCC 2000
BSNT_03325___ 2001 GGCAAAACTGGCAGGGCCAAATACGCCAAGCGATAAGAAGCTCACAGAGT 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2001 GGCAAAACTGGCAGGGCCAAATACGCCAAGCGATAAGAAGCTCACAGAGT 2050
BSNT_03325___ 2051 ACTTTGTTAAAGGCACAGCTCCTTCTACTGTTTCTAAAACATATGAGAAA 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2051 ACTTTGTTAAAGGCACAGCTCCTTCTACTGTTTCTAAAACATATGAGAAA 2100
BSNT_03325___ 2101 GAAGAAAAAGAGGAAACAGCTAAACTGTCTGGTTTAAACGTGAAATACGA 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2101 GAAGAAAAAGAGGAAACAGCTAAACTGTCTGGTTTAAACGTGAAATACGA 2150
BSNT_03325___ 2151 TAAAGACAATCAATCTTTAACGTTAAGCTGGAATTACGACGGAGATGCGA 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2151 TAAAGACAATCAATCTTTAACGTTAAGCTGGAATTACGACGGAGATGCGA 2200
BSNT_03325___ 2201 CCTTTGCTGTTAAGCAATCTGTTGACGGCGGCAGCTACTCGGAAATTCAA 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2201 CCTTTGCTGTTAAGCAATCTGTTGACGGCGGCAGCTACTCGGAAATTCAA 2250
BSNT_03325___ 2251 AACAGCTCTGCAAAAGAGGCAGTTATTTCGGGTGTGCAGCCAGGATCTGT 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2251 AACAGCTCTGCAAAAGAGGCAGTTATTTCGGGTGTGCAGCCAGGATCTGT 2300
BSNT_03325___ 2301 ATACAAATTCGAAGTAACAGCCGTCAGTGATGATGGCAAAAGTACAGCTT 2350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2301 ATACAAATTCGAAGTAACAGCCGTCAGTGATGATGGCAAAAGTACAGCTT 2350
BSNT_03325___ 2351 CCACATCTTATGAGGTGCCAAAAGCTGAAGACGATGAAGATAAAAAAGAC 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2351 CCACATCTTATGAGGTGCCAAAAGCTGAAGACGATGAAGATAAAAAAGAC 2400
BSNT_03325___ 2401 CAGCAACAAACGGATGATGAAAAACAAGATGATGAGAAGACTCAGGATGA 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2401 CAGCAACAAACGGATGATGAAAAACAAGATGATGAGAAGACTCAGGATGA 2450
BSNT_03325___ 2451 TACACAAACTGATGATTCTCAAAAAGATGACGGTCAGACGGATCAAGATC 2500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2451 TACACAAACTGATGATTCTCAAAAAGATGACGGTCAGACGGATCAAGATC 2500
BSNT_03325___ 2501 AGACAGATGATTCAACAAACGATCAAGACAAAAAACAAGACAATACGAAC 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2501 AGACAGATGATTCAACAAACGATCAAGACAAAAAACAAGACAATACGAAC 2550
BSNT_03325___ 2551 ACCAATCCGTCCGACAACAATAACCAAGACCAATCAAACGATAATGATAA 2600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2551 ACCAATCCGTCCGACAACAATAACCAAGACCAATCAAACGATAATGATAA 2600
BSNT_03325___ 2601 CGACAACAGTAACAACCAGGATACGTCGGATGGTGATTCGAACTCTGGTA 2650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2601 CGACAACAGTAACAACCAGGATACGTCGGATGGTGATTCGAACTCTGGTA 2650
BSNT_03325___ 2651 AGAATGATTCAACAGGTTCTGACACGAATAAAAATAAAACAGACACATCT 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2651 AGAATGATTCAACAGGTTCTGACACGAATAAAAATAAAACAGACACATCT 2700
BSNT_03325___ 2701 AATAAAACACAAACAAACTCATCATCCATTGAAAAAACAAATTAA 2745
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22320___po 2701 AATAAAACACAAACAAACTCATCATCCATTGAAAAAACAAATTAA 2745
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.