Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_03506 and BSU23560

See Amino acid alignment / Visit BSNT_03506 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:22:19
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_03506___mleN.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU23560___mleN.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_03506___mleN-BSU23560___mleN.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03506___mleN-BSU23560___mleN.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03506___mleN
# 2: BSU23560___mleN
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1407
# Identity:    1395/1407 (99.1%)
# Similarity:  1395/1407 (99.1%)
# Gaps:           0/1407 ( 0.0%)
# Score: 6927.0
# 
#
#=======================================

BSNT_03506___      1 TTGAAGGATGTAAGATTGCCAACACTATTTGAAATTATTATTGTACTAGG     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml      1 TTGAAGGATGTAAGATTGCCAACACTATTTGAAATTATTATTGTACTAGG     50

BSNT_03506___     51 AGTATTTTTAGCACTTGTTCTATCGTTTACAGTCTTTCTCGACTTGCCGA    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml     51 AGTATTTTTAGCACTTGTTCTATCGTTTACAGTCTTTCTCGACTTGCCGA    100

BSNT_03506___    101 TACAGCTGGCGCTTTTTGTTTCATGGTTTATTGCAATGCTTTTAGGTATA    150
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU23560___ml    101 TACAGCTGGCGCTTTTTGTTTCATGGTTTATTGCAATGCTTTTAGGTATT    150

BSNT_03506___    151 AGACTCGGTTATTCTTATAAAGATTTACAAAATGCGATTGTACATGGAAT    200
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU23560___ml    151 AGACTCGGTTATTCTTATAAAGATTTACAAAATGCGATTGTACATGGGAT    200

BSNT_03506___    201 ATCAAATGGCCTTGAAGCCGTACTGATTCTCGTTTCAGTTGGGGCGCTCA    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    201 ATCAAATGGCCTTGAAGCCGTACTGATTCTCGTTTCAGTTGGGGCGCTCA    250

BSNT_03506___    251 TCGGAACATGGATTGCCGGAGGCGTTGTGCCGACTTTGATTTATTACGGA    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    251 TCGGAACATGGATTGCCGGAGGCGTTGTGCCGACTTTGATTTATTACGGA    300

BSNT_03506___    301 CTGGAATTTATTCACCCAAGTATCTTTTTACTGGCAACGTTAATTATTTG    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    301 CTGGAATTTATTCACCCAAGTATCTTTTTACTGGCAACGTTAATTATTTG    350

BSNT_03506___    351 TTCCATTATGTCTGTGGCAACAGGAACGTCATGGGGAACAGTCGGAACTG    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    351 TTCCATTATGTCTGTGGCAACAGGAACGTCATGGGGAACAGTCGGAACTG    400

BSNT_03506___    401 CCGGCATTGCCATGATCGCAATTGGAGAGGGTTTAGGCATTCCGCTTCCT    450
                     |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU23560___ml    401 CCGGCATTGCCATGATCGCAATTGGAGAGGGGTTAGGCATTCCGCTTCCT    450

BSNT_03506___    451 CTAGTAGCGGGAGCTATTCTTTCAGGTGCTTATTTCGGGGACAAGCTGTC    500
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU23560___ml    451 CTAGTAGCGGGAGCTATTCTTTCAGGTGCTTATTTTGGGGACAAGCTGTC    500

BSNT_03506___    501 TCCGCTGTCTGACAGTACAGTTCTAGCTTCTTCACTATCAAAAGTCGATG    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    501 TCCGCTGTCTGACAGTACAGTTCTAGCTTCTTCACTATCAAAAGTCGATG    550

BSNT_03506___    551 TATTGGCTCACGTGAGAGCAATGCTTTATTTATCAATACCTGCTTATGTC    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    551 TATTGGCTCACGTGAGAGCAATGCTTTATTTATCAATACCTGCTTATGTC    600

BSNT_03506___    601 ATTACAGCTATACTCTTTACAGTTGTTGGATTTATGTACGGCGGGAAAAA    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    601 ATTACAGCTATACTCTTTACAGTTGTTGGATTTATGTACGGCGGGAAAAA    650

BSNT_03506___    651 TATTGATCTTGATAAAGTTGAATTCTTAAAATCATCTTTGCAAAACACGT    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    651 TATTGATCTTGATAAAGTTGAATTCTTAAAATCATCTTTGCAAAACACGT    700

BSNT_03506___    701 TTGACATTCATATTTGGATGCTGATCCCGGCAGTTGTCGTCATAGTCTTA    750
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU23560___ml    701 TTGACATTCATATTTGGATGCTGATCCCGGCAGTTCTCGTCATAGTCTTA    750

BSNT_03506___    751 TTGGCGATGAAAAAGCCATCTATGCCGGTTATCGTAATTGGCGCTTTACT    800
                     ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    751 TTGGCGATGAAAAAGCCATCTATGCCAGTTATCGTAATTGGCGCTTTACT    800

BSNT_03506___    801 CGGTGCAATCTGGGCTGTTGTTTTCCAAGGAATGGATATTGCCCATGCGA    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    801 CGGTGCAATCTGGGCTGTTGTTTTCCAAGGAATGGATATTGCCCATGCGA    850

BSNT_03506___    851 TTGCAACTGCTTACAACGGTTTCTCTATTAAAACTGATGTTGAATTTTTG    900
                     ||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU23560___ml    851 TTGCAACTGCGTACAACGGCTTCTCTATTAAAACGGATGTTGAATTTTTG    900

BSNT_03506___    901 AACGGCTTGTTAAACCGCGGTGGAATTGTCGGTATGCTTGATTCTCTCGT    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    901 AACGGCTTGTTAAACCGCGGTGGAATTGTCGGTATGCTTGATTCTCTCGT    950

BSNT_03506___    951 CGTCATCATCTTTGGCCTTGGTTTTGGCGGTCTGCTTGAGAAACTCGGCG   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml    951 CGTCATCATCTTTGGCCTTGGTTTTGGCGGTCTGCTTGAGAAACTCGGCG   1000

BSNT_03506___   1001 TGTTAAAAGTCATTGTTTCAACGTTTGAAAAGAAATTAACTTCAGCCGGC   1050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml   1001 TGTTAAAAGTCATTGTTTCAACGTTTGAAAAGAAATTAACTTCAGCCGGC   1050

BSNT_03506___   1051 AATGTCACATTGTCTACACTGATCGTAGCGTTTTTAGCGAACATCTTCGG   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU23560___ml   1051 AATGTCACATTGTCTACACTGATCGTAGCGTTTTTAGCAAACATCTTCGG   1100

BSNT_03506___   1101 CTGTGCGATGTATGTATCTCTTATTTTGACTCCGAAAATTATGGAAGACA   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml   1101 CTGTGCGATGTATGTATCTCTTATTTTGACTCCGAAAATTATGGAAGACA   1150

BSNT_03506___   1151 GCTATGATCGCTTGCATCTGGACAGAAGAGTGTTATCACGTAACTCAGAG   1200
                     |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml   1151 GCTATGATCGCTTACATCTGGACAGAAGAGTGTTATCACGTAACTCAGAG   1200

BSNT_03506___   1201 GTCGGGGGAACATTGACTTCGGGGATGGTACCTTGGTCTGATAATGGGAT   1250
                     |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU23560___ml   1201 GTCGGGGGAACATTGACTTCGGGGATGGTTCCTTGGTCTGATAATGGGAT   1250

BSNT_03506___   1251 TTACATGGCTGGTATTTTAGGTGTTTCTACCTTCTCTTATCTGCCGTTTA   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml   1251 TTACATGGCTGGTATTTTAGGTGTTTCTACCTTCTCTTATCTGCCGTTTA   1300

BSNT_03506___   1301 TGTGGCTCAGTTTTGTAGCAATAGGTCTTGCAATTATCTATGGTTATACA   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml   1301 TGTGGCTCAGTTTTGTAGCAATAGGTCTTGCAATTATCTATGGTTATACA   1350

BSNT_03506___   1351 GGAAAATTTATATGGTATACGAAAAACAATACAGTTAAAGCCGAAAAACT   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml   1351 GGAAAATTTATATGGTATACGAAAAACAATACAGTTAAAGCCGAAAAACT   1400

BSNT_03506___   1401 AGGCTAA   1407
                     |||||||
BSU23560___ml   1401 AGGCTAA   1407


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.