Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03619 and BSU24270
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03619 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:32
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03619___dxs.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU24270___dxs.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03619___dxs-BSU24270___dxs.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03619___dxs-BSU24270___dxs.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03619___dxs
# 2: BSU24270___dxs
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1902
# Identity: 1894/1902 (99.6%)
# Similarity: 1894/1902 (99.6%)
# Gaps: 0/1902 ( 0.0%)
# Score: 9438.0
#
#
#=======================================
BSNT_03619___ 1 TTGGATCTTTTATCAATACAGGACCCGTCGTTTTTAAAAAACATGTCCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1 TTGGATCTTTTATCAATACAGGACCCGTCGTTTTTAAAAAACATGTCCAT 50
BSNT_03619___ 51 TGATGAATTAGAGAAATTAAGTGATGAAATCCGTCAGTTTTTAATTACAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 51 TGATGAATTAGAGAAATTAAGTGATGAAATCCGTCAGTTTTTAATTACAA 100
BSNT_03619___ 101 GTTTATCCGCTTCCGGCGGCCACATCGGCCCAAACTTAGGTGTCGTAGAG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 101 GTTTATCCGCTTCCGGCGGCCACATCGGCCCAAACTTAGGTGTCGTAGAG 150
BSNT_03619___ 151 CTTACTGTTGCCCTGCATAAGGAATTTAACAGCCCGAAAGACAAATTTTT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 151 CTTACTGTTGCCCTGCATAAGGAATTTAACAGCCCGAAAGACAAATTTTT 200
BSNT_03619___ 201 ATGGGATGTAGGCCATCAGTCGTATGTCCATAAGCTGCTGACAGGACGCG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 201 ATGGGATGTAGGCCATCAGTCGTATGTCCATAAGCTGCTGACAGGACGCG 250
BSNT_03619___ 251 GAAAAGAATTTGCGACGCTTCGCCAGTACAAAGGGCTTTGCGGATTTCCA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 251 GAAAAGAATTTGCGACGCTTCGCCAGTACAAAGGGCTTTGCGGATTTCCA 300
BSNT_03619___ 301 AAGCGGAGTGAAAGCGAGCACGATGTTTGGGAAACCGGGCACAGCTCGAC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 301 AAGCGGAGTGAAAGCGAGCACGATGTTTGGGAAACCGGGCACAGCTCGAC 350
BSNT_03619___ 351 TTCTCTGTCAGGCGCGATGGGAATGGCAGCTGCCCGTGATATTAAAGGAA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 351 TTCTCTGTCAGGCGCGATGGGAATGGCAGCTGCCCGTGATATTAAAGGAA 400
BSNT_03619___ 401 CGGATGAATATATTATTCCGATCATTGGTGACGGCGCGCTGACCGGCGGT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 401 CGGATGAATATATTATTCCGATCATTGGTGACGGCGCGCTGACCGGCGGT 450
BSNT_03619___ 451 ATGGCGCTCGAAGCCCTTAACCACATCGGCGACGAGAAAAAAGACATGAT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 451 ATGGCGCTCGAAGCCCTTAACCACATCGGCGACGAGAAAAAAGACATGAT 500
BSNT_03619___ 501 TGTCATCCTTAATGATAATGAAATGAGTATTGCGCCAAACGTCGGTGCCA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 501 TGTCATCCTTAATGATAATGAAATGAGTATTGCGCCAAACGTCGGTGCCA 550
BSNT_03619___ 551 TTCACTCTATGCTCGGACGGCTCCGCACTGCGGGGAAATACCAGTGGGTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 551 TTCACTCTATGCTCGGACGGCTCCGCACTGCGGGGAAATACCAGTGGGTC 600
BSNT_03619___ 601 AAAGATGAGCTTGAATACTTATTTAAAAAGATTCCGGCAGTTGGGGGCAA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 601 AAAGATGAGCTTGAATACTTATTTAAAAAGATTCCGGCAGTTGGGGGCAA 650
BSNT_03619___ 651 GCTTGCCGCCACGGCGGAACGGGTCAAAGACAGCCTGAAATACATGCTCG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 651 GCTTGCCGCCACGGCGGAACGGGTCAAAGACAGCCTGAAATACATGCTCG 700
BSNT_03619___ 701 TCTCCGGAATGTTTTTCGAGGAGCTCGGTTTTACGTATTTGGGCCCAGTG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 701 TCTCCGGAATGTTTTTCGAGGAGCTCGGTTTTACGTATTTGGGCCCAGTG 750
BSNT_03619___ 751 GACGGACATTCTTATCATGAGCTGATTGAGAATCTTCAATACGCCAAAAA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 751 GACGGACATTCTTATCATGAGCTGATTGAGAATCTTCAATACGCCAAAAA 800
BSNT_03619___ 801 AACGAAAGGCCCTGTTCTTCTGCACGTCATTACGAAAAAAGGGAAGGGGT 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 801 AACGAAAGGCCCTGTTCTTCTGCACGTCATTACGAAAAAAGGGAAGGGGT 850
BSNT_03619___ 851 ACAAACCGGCTGAGACCGATACGATTGGGACATGGCATGGTACCGGACCA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 851 ACAAACCGGCTGAGACCGATACGATTGGGACATGGCATGGTACCGGACCA 900
BSNT_03619___ 901 TATAAAATTAATACCGGTGACTTTGTAAAGCCGAAAGCCGCAGCTCCTTC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 901 TATAAAATTAATACCGGTGACTTTGTAAAGCCGAAAGCCGCAGCTCCTTC 950
BSNT_03619___ 951 GTGGAGCGGTCTTGTCAGCGGAACTGTGCAGCGAATGGCGCGCGAGGACG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 951 GTGGAGCGGTCTTGTCAGCGGAACTGTGCAGCGAATGGCGCGCGAGGACG 1000
BSNT_03619___ 1001 GACGCATTGTAGCCATTACGCCGGCTATGCCTGTCGGTTCAAAGCTTGAA 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1001 GACGCATTGTAGCCATTACGCCGGCTATGCCTGTCGGTTCAAAGCTTGAA 1050
BSNT_03619___ 1051 GGCTTCGCAAAGGAATTCCCTGACCGGATGTTCGACGTAGGAATCGCAGA 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1051 GGCTTCGCAAAGGAATTCCCTGACCGGATGTTCGACGTAGGAATCGCAGA 1100
BSNT_03619___ 1101 ACAGCATGCCGCAACAATGGCTGCAGCTATGGCAATGCAGGGTATGAAGC 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1101 ACAGCATGCCGCAACAATGGCTGCAGCTATGGCAATGCAGGGTATGAAGC 1150
BSNT_03619___ 1151 CGTTTTTGGCGATTTACTCAACCTTCCTGCAAAGGGCATATGACCAAGTT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1151 CGTTTTTGGCGATTTACTCAACCTTCCTGCAAAGGGCATATGACCAAGTT 1200
BSNT_03619___ 1201 GTTCATGACATCTGCCGCCAAAACGCTAATGTGTTTATTGGAATTGACCG 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1201 GTTCATGACATCTGCCGCCAAAACGCTAATGTGTTTATTGGAATTGACCG 1250
BSNT_03619___ 1251 TGCAGGACTCGTTGGCGCTGATGGAGAGACACATCAAGGCGTGTTTGATA 1300
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1251 TGCTGGACTCGTTGGCGCTGATGGAGAGACACATCAAGGCGTGTTTGATA 1300
BSNT_03619___ 1301 TTGCGTTTATGCGCCACATTCCAAACATGGTCTTAATGATGCCGAAAGAC 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1301 TTGCGTTTATGCGCCACATTCCAAACATGGTCTTAATGATGCCGAAAGAC 1350
BSNT_03619___ 1351 GAAAATGAAGGCCAGCACATGGTTCATACAGCACTTAGCTATGACGAAGG 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1351 GAAAATGAAGGCCAGCACATGGTTCATACAGCACTTAGCTATGACGAAGG 1400
BSNT_03619___ 1401 CCCGATAGCAATGCGTTTTCCGCGCGGAAACGGACTCGGCGTAAAAATGG 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1401 CCCGATAGCAATGCGTTTTCCGCGCGGAAACGGACTCGGCGTAAAAATGG 1450
BSNT_03619___ 1451 ATGAACAGTTGAAAACGATTCCGATCGGTACGTGGGAGGTGTTGCGTCCA 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU24270___dx 1451 ATGAACAGTTGAAAACGATTCCGATCGGTACGTGGGAGGTGCTGCGTCCA 1500
BSNT_03619___ 1501 GGGAACGATGCTGTCATCTTAACATTCGGCACAACAATCGAAATGGCGAT 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1501 GGGAACGATGCTGTCATCTTAACATTCGGCACAACAATCGAAATGGCGAT 1550
BSNT_03619___ 1551 TGAAGCAGCCGAAGAGCTGCAGAAAGAAGGCCTTTCCGTGCGCGTTGTGA 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1551 TGAAGCAGCCGAAGAGCTGCAGAAAGAAGGCCTTTCCGTGCGCGTTGTGA 1600
BSNT_03619___ 1601 ATGCGCGTTTTATTAAGCCGATTGATGAAAAGATGATGAAGAGTATCCTA 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1601 ATGCGCGTTTTATTAAGCCGATTGATGAAAAGATGATGAAGAGTATCCTA 1650
BSNT_03619___ 1651 AAAGAAGGCTTGCCAATTTTAACAATTGAAGAAGCGGTCTTAGAAGGCGG 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1651 AAAGAAGGCTTGCCAATTTTAACAATTGAAGAAGCGGTCTTAGAAGGCGG 1700
BSNT_03619___ 1701 TTTCGGAAGCTCGATTTTAGAATTCGCTCATGATCAAGGTGAATATCATA 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1701 TTTCGGAAGCTCGATTTTAGAATTCGCTCATGATCAAGGTGAATATCATA 1750
BSNT_03619___ 1751 CTCCGATCGACAGAATGGGTATACCTGATCGGTTTATTGAACACGGAAGC 1800
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU24270___dx 1751 CTCCGATTGACAGAATGGGTATACCTGATCGGTTTATTGAACACGGAAGT 1800
BSNT_03619___ 1801 GTAACGGCGCTTCTTAAGGAAATTGGACTGACAAAACAGCAGGTGGCAAA 1850
|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1801 GTAACAGCGCTTCTTGAGGAAATTGGACTGACAAAACAGCAGGTGGCAAA 1850
BSNT_03619___ 1851 TCGTATTAGATTACTGATGCCGTCAAAGACACACAAAGGAATTGGATCAT 1900
|||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||
BSU24270___dx 1851 TCGTATTAGATTACTGATGCCACCAAAGACACACAAAGGAATTGGATCAT 1900
BSNT_03619___ 1901 GA 1902
||
BSU24270___dx 1901 GA 1902
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.