Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03872 and BSU26630
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03872 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:57
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03872___yrdQ.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU26630___yrdQ.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03872___yrdQ-BSU26630___yrdQ.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03872___yrdQ-BSU26630___yrdQ.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03872___yrdQ
# 2: BSU26630___yrdQ
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 867
# Identity: 857/867 (98.8%)
# Similarity: 857/867 (98.8%)
# Gaps: 0/867 ( 0.0%)
# Score: 4245.0
#
#
#=======================================
BSNT_03872___ 1 ATGGAACTGCGAGACTTACAAATTTTCAAATGCGTAGCCCATCACAAGAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 1 ATGGAACTGCGAGACTTACAAATTTTCAAATGCGTAGCCCATCACAAGAG 50
BSNT_03872___ 51 TATTACCGGTGCTGCAAAAGAGTTAAATTATGTACAATCTAATGTAACTG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 51 TATTACCGGTGCTGCAAAAGAGTTAAATTATGTACAATCTAATGTAACTG 100
BSNT_03872___ 101 CGCGGATTAAGCAATTAGAGAATGAGCTCAAAACACCTCTTTTCAATCGC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 101 CGCGGATTAAGCAATTAGAGAATGAGCTCAAAACACCTCTTTTCAATCGC 150
BSNT_03872___ 151 CATAAAAAAGGGGTTTCACTAAGCCCAGAGGGCCGAAAAATGATTGAATA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 151 CATAAAAAAGGGGTTTCACTAAGCCCAGAGGGCCGAAAAATGATTGAATA 200
BSNT_03872___ 201 CGTTAACAAAATTTTGAAAGATGTTGAAGAACTGGAGCAGGTCTTTCTAG 250
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU26630___yr 201 CGTTAACAAAATTTTGAAAGATGTTGAAGAACTGGAGCAAGTCTTTCTAG 250
BSNT_03872___ 251 ATACTGAAATACCATCTGGAATATTAAAAATCGGTACAGTGGAAACAGTG 300
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 251 ATACTGAAATACCGTCTGGAATATTAAAAATCGGTACAGTGGAAACAGTG 300
BSNT_03872___ 301 AGGATACTGCCGACCATCATAGCTTCCTATTATAAAAAGTATCCTAATGT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 301 AGGATACTGCCGACCATCATAGCTTCCTATTATAAAAAGTATCCTAATGT 350
BSNT_03872___ 351 GGATTTATCATTGCAGGCTGGTCTAACAGAGGAACTTATTAAAAAGGTCA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 351 GGATTTATCATTGCAGGCTGGTCTAACAGAGGAACTTATTAAAAAGGTCA 400
BSNT_03872___ 401 TGAATCACGAATTAGACGGAGCTTTTATTTCAGGCCCTTTGAAACATTCT 450
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU26630___yr 401 TGAATCACGAATTAGACGGAGCTTTTATTTCAGGCCCCTTGAAACATTCT 450
BSNT_03872___ 451 ATTCTGGAACAGTATGATGTTTATACTGAAAAACTTACTCTTGTAACCAG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 451 ATTCTGGAACAGTATGATGTTTATACTGAAAAACTTACTCTTGTAACCAG 500
BSNT_03872___ 501 TAACAAAACGTTTAATATAGAGGATTTTTCAACGACTCCGATTCTTGTTT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 501 TAACAAAACGTTTAATATAGAGGATTTTTCAACGACTCCGATTCTTGTTT 550
BSNT_03872___ 551 TTAACCAGGGGTGCGGGTATCGGTCTAGGCTTGAACAATGGCTCAAAGAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 551 TTAACCAGGGGTGCGGGTATCGGTCTAGGCTTGAACAATGGCTCAAAGAT 600
BSNT_03872___ 601 GAAGGTGTGCTCCCAAACAGAATGATGGAATTTAACATCCTAGAGACAAT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 601 GAAGGTGTGCTCCCAAACAGAATGATGGAATTTAACATCCTAGAGACAAT 650
BSNT_03872___ 651 CTTAAATAGTGTTGCACTTGGACTCGGTATAACAGTGGTACCGGAATCTG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 651 CTTAAATAGTGTTGCACTTGGACTCGGTATAACAGTGGTACCGGAATCTG 700
BSNT_03872___ 701 CTGTTATGCATCTAGCTGCACAAGGTAAGGTTTATTGTCACCCATTACCT 750
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||
BSU26630___yr 701 CTGTTATGCATCTAGCTGTACAAGGTAAGGTTTATTGCCACCCATTGCCT 750
BSNT_03872___ 751 GAGAAAGATAGCTGTATCTCAACAATCTTTATACGCCATAAAGATGCGTA 800
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 751 GAGAAAGACAGCTGTATCTCAACAATTTTTATACGCCATAAAGATGCGTA 800
BSNT_03872___ 801 CCTGACAAATTCAATGCGCAGCCTCCTTAAGACCATTGTTGAACATAAAA 850
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU26630___yr 801 CCTGACAAATTCAATGCGCAGCCTCCTAAAGACCATTGTTGAACATAAAA 850
BSNT_03872___ 851 ATATGAGTATGTCTTAA 867
|||||||||||.|||||
BSU26630___yr 851 ATATGAGTATGGCTTAA 867
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.