Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03936 and BSU27160
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03936 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:23:06
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03936.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU27160___cypB.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03936-BSU27160___cypB.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03936-BSU27160___cypB.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03936
# 2: BSU27160___cypB
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 3165
# Identity: 2227/3165 (70.4%)
# Similarity: 2227/3165 (70.4%)
# Gaps: 897/3165 (28.3%)
# Score: 10971.0
#
#
#=======================================
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 1 ATGAAACAGGCAAGCGCAATACCTCAGCCCAAAACATACGGACCTTTAAA 50
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 51 AAATCTTCCGCATCTGGAAAAAGAACAGCTTTCTCAATCCTTATGGCGGA 100
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 101 TAGCTGATGAATTGGGACCGATTTTCCGTTTTGATTTTCCGGGAGTATCC 150
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 151 AGTGTTTTTGTGTCCGGCCACAATCTTGTGGCTGAAGTGTGTGATGAAAA 200
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 201 ACGCTTTGACAAGAACCTTGGCAAAGGCTTGCAAAAGGTGCGTGAGTTCG 250
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 251 GGGGAGATGGCTTATTTACAAGCTGGACGCACGAACCGAACTGGCAAAAA 300
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 301 GCCCACCGCATTTTGCTGCCGAGTTTTAGTCAAAAAGCGATGAAAGGCTA 350
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 351 TCATTCTATGATGCTGGATATCGCAACCCAGCTGATTCAAAAGTGGAGCC 400
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 401 GGTTAAACCCTAATGAAGAAATTGATGTAGCGGACGATATGACACGTCTG 450
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 451 ACGCTTGATACGATTGGGTTATGCGGGTTTAACTATCGATTCAACAGCTT 500
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 501 TTACCGTGATTCACAGCATCCGTTTATCACCAGTATGCTCCGTGCCTTAA 550
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 551 AAGAGGCGATGAATCAATCGAAAAGACTGGGCCTGCAAGATAAAATGATG 600
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 601 GTGAAAACGAAGCTGCAGTTCCAAAAGGATATAGAAGTCATGAACTCCCT 650
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 651 GGTTGATAGAATGATAGCGGAGCGAAAGGCGAATCCGGATGAAAACATTA 700
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 701 AGGATCTCTTGTCTCTCATGCTTTATGCCAAAGATCCAGTAACGGGTGAA 750
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 751 ACGCTGGATGACGAAAACATTCGATACCAAATCATCACATTTTTAATTGC 800
BSNT_03936 0 -------------------------------------------------- 0
BSU27160___cy 801 TGGACATGAGACAACAAGCGGGTTGCTATCCTTTGCGATTTATTGTCTGC 850
BSNT_03936 1 -----------------------------------------------GTG 3
|||
BSU27160___cy 851 TTACACATCCGGAAAAACTGAAAAAAGCTCAGGAGGAAGCGGATCGCGTG 900
BSNT_03936 4 TTAACGGATGACACGCCTGAATATAAACAAATCCAGCAGCTCAAATACAC 53
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU27160___cy 901 TTAACGGATGACACGCCTGAATATAAACAAATCCAGCAGCTCAAATACAT 950
BSNT_03936 54 TCGGATGGTTTTAAATGAAACCCTCAGACTGTATCCAACAGCTCCGGCTT 103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 951 TCGGATGGTTTTAAATGAAACCCTCAGACTGTATCCAACAGCTCCGGCTT 1000
BSNT_03936 104 TTTCTCTATATGCGAAGGAGGATACTGTTCTAGGCGGGGAATATCCGATC 153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1001 TTTCTCTATATGCGAAGGAGGATACTGTTCTAGGCGGGGAATATCCGATC 1050
BSNT_03936 154 AGCAAAGGGCAGCCAGTCACTGTTTTAATTCCAAAACTGCACCGGGACCA 203
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU27160___cy 1051 AGCAAAGGGCAGCCAGTCACTGTTTTAATTCCAAAACTGCACCGGGATCA 1100
BSNT_03936 204 AAACGCTTGGGGGCCGGATGCGGAAGATTTCCGTCCGGAACGGTTTGAGG 253
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1101 AAACGCTTGGGGACCGGATGCGGAAGATTTCCGTCCGGAACGGTTTGAGG 1150
BSNT_03936 254 ATCCTTCAAGTATCCCTCACCATGCGTATAAGCCGTTTGGAAACGGACAG 303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1151 ATCCTTCAAGTATCCCTCACCATGCGTATAAGCCGTTTGGAAACGGACAG 1200
BSNT_03936 304 CGCGCTTGTATTGGCATGCAGTTTGCTCTTCAAGAAGCGACAATGGTTCT 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1201 CGCGCTTGTATTGGCATGCAGTTTGCTCTTCAAGAAGCGACAATGGTTCT 1250
BSNT_03936 354 CGGTCTTGTATTAAAGCATTTTGAATTGATTAACCATACTGGCTACGAAC 403
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1251 CGGTCTTGTATTAAAGCATTTTGAATTGATAAACCATACTGGCTACGAAC 1300
BSNT_03936 404 TAAAAATCAAAGAAGCATTAACGATCAAGCCGGATGATTTTAAAATTACT 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1301 TAAAAATCAAAGAAGCATTAACGATCAAGCCGGATGATTTTAAAATTACT 1350
BSNT_03936 454 GTGAAACCGCGGAAAACAGCGGCAATCAATGTACAGAGAAAAGAACAGGC 503
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1351 GTGAAACCGCGAAAAACAGCGGCAATCAATGTACAGAGAAAAGAACAGGC 1400
BSNT_03936 504 AGAAATCAAAGCAGAAACAAAGCCAAAAGAAACCAAACCTAAACACGGCA 553
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1401 AGACATCAAAGCAGAAACAAAGCCAAAAGAAACCAAACCTAAACACGGCA 1450
BSNT_03936 554 CACCTTTACTCGTTCTTTACGGTTCAAACCTTGGGACAGCTGAGGGAATA 603
||||||||||.|||||||..||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1451 CACCTTTACTTGTTCTTTTTGGTTCAAATCTTGGGACAGCTGAGGGAATA 1500
BSNT_03936 604 GCCGATGAATTGGCTTCTCAAGGCCGCCAGATGGGCTTTACAGCTGAAAC 653
||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1501 GCCGGTGAACTGGCTGCTCAAGGCCGCCAGATGGGCTTTACAGCTGAAAC 1550
BSNT_03936 654 GGCTCCGCTTGATGATTATATCGGCAAGCTCCCTGAAGAAGGGGCAGTCG 703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1551 GGCTCCGCTTGATGATTATATCGGCAAGCTCCCTGAAGAAGGGGCAGTCG 1600
BSNT_03936 704 TCATTGTAACGGCTTCTTATAATGGGTCGCCGCCTGATAATGCTGCCGGC 753
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
BSU27160___cy 1601 TCATTGTAACGGCTTCTTATAATGGGGCGCCGCCTGATAATGCTGCCGGA 1650
BSNT_03936 754 TTTGTAGAGTGGCTGAAAGAGCTTGAGGAAGGCCAATTGAAAGGTGTTTC 803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1651 TTTGTAGAGTGGCTGAAAGAGCTTGAGGAAGGCCAATTGAAAGGTGTTTC 1700
BSNT_03936 804 CTATGCGGTATTCGGCTGCGGGAACCGGAGCTGGGCCAGCACGTATCAGC 853
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1701 CTATGCGGTATTCGGCTGCGGAAACCGGAGCTGGGCCAGCACGTATCAGC 1750
BSNT_03936 854 GGATTCCCCGCCTGATTGATGACATGATGAAAGCAAAGGGGGCATCGCGT 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1751 GGATTCCCCGCCTGATTGATGACATGATGAAAGCAAAGGGGGCATCGCGT 1800
BSNT_03936 904 TTAACAGAGATTGGGGAAGGTGACGCCGCCGATGATTTTGAAAGCCATCG 953
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU27160___cy 1801 TTAACAGCGATTGGGGAAGGTGACGCCGCCGATGATTTTGAAAGCCACCG 1850
BSNT_03936 954 CGAGTCTTGGGAAAACCGCTTCTGGAAGGAAACGATGGACGCATTTGATA 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1851 CGAGTCTTGGGAAAACCGCTTCTGGAAGGAAACGATGGACGCATTTGATA 1900
BSNT_03936 1004 TTAACGAAATAGCCCAGAAAGAAGACAGGCCTTCATTATCGATTGCTTTT 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU27160___cy 1901 TTAACGAAATAGCCCAGAAAGAAGACAGGCCTTCATTATCGATTACTTTT 1950
BSNT_03936 1054 CTCAGTGAAGCGACGGAAACGCCGGTTGCTAAAGCATATGGCGCGTTTGA 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 1951 CTCAGTGAAGCGACGGAAACGCCGGTTGCTAAAGCATATGGCGCGTTTGA 2000
BSNT_03936 1104 AGGGGTTGTGTTAGAGAATCGAGAACTCCAGACAGCTGACAGCACGCGTT 1153
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU27160___cy 2001 AGGGATTGTGTTAGAGAATCGAGAACTCCAGACAGCTGCCAGCACGCGTT 2050
BSNT_03936 1154 CAACCTGCCATATTGAATTGGAAATTCCGGCTGGTAAAACATATAAAGAA 1203
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2051 CAACCCGCCATATTGAATTGGAAATTCCGGCTGGTAAAACATATAAAGAA 2100
BSNT_03936 1204 GGCGATCATATCGGAATCCTGCCGAAGAACAGCAGGGAGCTTGTTCAGCG 1253
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2101 GGCGATCATATCGGAATCCTGCCAAAGAACAGCAGGGAGCTTGTTCAGCG 2150
BSNT_03936 1254 GGTTCTCAGCCGATTCGGTTTGCAGTCCAATCATGTGATAAAAGTAAGCG 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2151 GGTTCTCAGCCGATTCGGTTTGCAGTCCAATCATGTGATAAAAGTAAGCG 2200
BSNT_03936 1304 GAAGCGCTCATATGGCTCATCTGCCGATGGATCGGCCGATCAAAGTTGCG 1353
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|
BSU27160___cy 2201 GAAGCGCTCATATGGCTCATCTGCCGATGGATCGGCCAATCAAAGTAGTG 2250
BSNT_03936 1354 GATTTATTGTCGTCCTATGTAGAGCTGCAGGAACCGGCATCAAGGCTTCA 1403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2251 GATTTATTGTCGTCCTATGTAGAGCTGCAGGAACCGGCATCAAGGCTTCA 2300
BSNT_03936 1404 GCTTCGGGAGCTGGCCTCTTATACAGTTTGTCCGCCGCATCAAAAAGAGC 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2301 GCTTCGGGAGCTGGCCTCTTATACAGTTTGTCCGCCGCATCAAAAAGAGC 2350
BSNT_03936 1454 TGGAACAGCTCGTTTCAGATGATGGCATTTACAAAGAGCAGGTACTTGCA 1503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2351 TGGAACAGCTCGTTTCAGATGATGGCATTTACAAAGAGCAGGTACTTGCA 2400
BSNT_03936 1504 AAACGTCTTACCATGCTTGATTTTTTAGAGGATTATCCTGCTTGCGAAAT 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2401 AAACGTCTTACCATGCTTGATTTTTTAGAGGATTATCCTGCTTGCGAAAT 2450
BSNT_03936 1554 GCCGTTTGAACGGTTTTTAGCACTTTTGCCATCACTAAAACCGAGATACT 1603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2451 GCCGTTTGAACGGTTTTTAGCACTTTTGCCATCACTAAAACCGAGATACT 2500
BSNT_03936 1604 ATTCCATTTCAAGCTCACCGAAAGTTCATGCAAATATCGTGAGCATGACG 1653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2501 ATTCCATTTCAAGCTCACCGAAAGTTCATGCAAATATCGTGAGCATGACG 2550
BSNT_03936 1654 GTAGGAGTTGTGAAAGCCTCAGCATGGAGCGGCCGAGGTGAATACCGGGG 1703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2551 GTAGGAGTTGTGAAAGCCTCAGCATGGAGCGGCCGAGGTGAATACCGGGG 2600
BSNT_03936 1704 TGTCGCCTCTAATTATTTAGCAGAGTTGAATACAGGTGATGCAGCAGCCT 1753
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
BSU27160___cy 2601 TGTCGCCTCTAATTATTTAGCAGAATTGAATACAGGTGATGCAGCAGCTT 2650
BSNT_03936 1754 GCTTCATTCGTACGCCGCAGTCCGGATTCCAGATGCCGGATGAGCCTGAA 1803
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.||||||
BSU27160___cy 2651 GCTTCATTCGTACGCCGCAGTCCGGATTTCAGATGCCGAATGATCCTGAA 2700
BSNT_03936 1804 ACGCCTATGATTATGGTCGGGCCGGGCACAGGAATTGCGCCATTCAGGGG 1853
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU27160___cy 2701 ACGCCTATGATTATGGTCGGGCCGGGCACAGGAATTGCGCCATTCAGAGG 2750
BSNT_03936 1854 CTTTATTCAGGCAAGATCGGTTTTGAAGAAGGAAGGAAGCACCCTTGGTG 1903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2751 CTTTATTCAGGCAAGATCGGTTTTGAAGAAGGAAGGAAGCACCCTTGGTG 2800
BSNT_03936 1904 AAGCACTTTTATACTTCGGCTGCCGCCGCCCGGACCATGACGACCTTTAC 1953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2801 AAGCACTTTTATACTTCGGCTGCCGCCGCCCGGACCATGACGACCTTTAC 2850
BSNT_03936 1954 AGAGAAGAGCTGGATCAAGCGGAACAGGAAGGTTTGGTCACAATCCGCCG 2003
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2851 AGAGAAGAGCTGGATCAAGCGGAACAGGACGGTTTGGTCACAATCCGCCG 2900
BSNT_03936 2004 ATGCTACTCGCGCGTCAAAAACGAACCAAAAGAATATGTCCAGCACTTGC 2053
||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU27160___cy 2901 ATGCTACTCGCGCGTCGAAAACGAACCAAAAGGATATGTCCAGCACTTGC 2950
BSNT_03936 2054 TCAAGCAAGATACGCAGAAATTGATGACACTCATTGAAAAAGGGGCTCAT 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 2951 TCAAGCAAGATACGCAGAAATTGATGACACTCATTGAAAAAGGGGCTCAT 3000
BSNT_03936 2104 ATTTACGTATGCGGTGATGGATCACAAATGGCTCCTGATGTAGAGAAGAC 2153
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..||
BSU27160___cy 3001 ATTTACGTATGCGGTGATGGATCGCAAATGGCTCCTGATGTAGAGAGAAC 3050
BSNT_03936 2154 TTTGCGATTGGCGTATGAAGCTGAAAAAGGAGCAAGTCAGGAAGAATCAG 2203
||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 3051 TTTGCGATTGGCATATGAAGCTGAAAAAGCAGCAAGTCAGGAAGAATCAG 3100
BSNT_03936 2204 CTGAATGGCTGCAAAAGCTGCAAGATCAAAGACGTTATGTGAAAGACGTT 2253
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27160___cy 3101 CTGTATGGCTGCAAAAGCTGCAAGATCAAAGACGTTATGTGAAAGACGTT 3150
BSNT_03936 2254 TGGACAGGAATGTAA 2268
|||||||||||||||
BSU27160___cy 3151 TGGACAGGAATGTAA 3165
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.