Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_03950 and BSU27220

See Amino acid alignment / Visit BSNT_03950 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:23:07
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_03950___yrhE.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU27220___yrhE.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_03950___yrhE-BSU27220___yrhE.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03950___yrhE-BSU27220___yrhE.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03950___yrhE
# 2: BSU27220___yrhE
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2949
# Identity:    2901/2949 (98.4%)
# Similarity:  2901/2949 (98.4%)
# Gaps:           6/2949 ( 0.2%)
# Score: 14337.0
# 
#
#=======================================

BSNT_03950___      1 ATGAATATGATGGACGGTAAGTCGATCAGTGTCCGTGTAGACGGAACAGA     50
                           ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr      1 ------ATGATGGACGTTAAGTCGATCAGTGTCCGTGTAGACGGAACAGA     44

BSNT_03950___     51 AATTCAAGCACGAGCAGGGGCCACAATATTAGATATTTTAAATGAAAACG    100
                     |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr     45 AATTCAAGCACGAGCAGGGGCCACAATTTTAGATATTTTAAATGAAAACG     94

BSNT_03950___    101 GAATTGAGTACCCGCAGATTTGCCACGTACCAGAGGTTGACCCGATTCAA    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr     95 GAATTGAGTACCCGCAGATTTGCCACGTACCAGAGGTTGACCCGATTCAA    144

BSNT_03950___    151 ACTTGTGATACTTGCATAGTAGAGGCAAACGGCAAGCTGGTTCGTTCATG    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    145 ACTTGTGATACTTGCATAGTAGAGGCAAACGGCAAGCTGGTTCGTTCATG    194

BSNT_03950___    201 CGCGACGGTTGCAGAAAACGGGATGTCTATTGATCTATCAGGAAATCGAG    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
BSU27220___yr    195 CGCGACGGTTGCAGAAAACGGGATGTCTATTGATCTTTCAGGAAATCGAG    244

BSNT_03950___    251 TGAAAGAAGCGCAAACCGAAGCGATGGACCGCCTTCTTGAAAATCATTTG    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    245 TGAAAGAAGCGCAAACCGAAGCGATGGACCGCCTTCTTGAAAATCATTTG    294

BSNT_03950___    301 CTGTATTGTACAGTTTGCGATAACAACAATGGAAACTGTACGCTGCATAA    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    295 CTGTATTGTACAGTTTGCGATAACAACAATGGAAACTGTACGCTGCATAA    344

BSNT_03950___    351 TACAGCGGAAATGATGGGGATCGAGCATCAAAAATACCCATACACGCCAA    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    345 TACAGCGGAAATGATGGGGATCGAGCATCAAAAATACCCATACACGCCAA    394

BSNT_03950___    401 AAGAAGATCCTTCTTGCGCAGTTGATATGTCTCATCCTTTTTACCGCTAT    450
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    395 AAGAAGATCCTTCTTGCGCGGTTGATATGTCTCATCCTTTTTACCGCTAT    444

BSNT_03950___    451 GATCCAAACCAATGTATTGCCTGCGGCCAGTGTGTTGAGGTCTGTCAAAA    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    445 GATCCAAACCAATGTATTGCCTGCGGCCAGTGTGTTGAGGTCTGTCAAAA    494

BSNT_03950___    501 CCTTCAGGTAAATGAAACACTCTCAATCGACTGGGAACGCGAACGCCCTC    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    495 CCTTCAGGTAAATGAAACACTCTCAATCGACTGGGAACGCGAACGCCCTC    544

BSNT_03950___    551 GCGTCATTTGGGATGAGGGAGTTCCGATCAATGAATCTTCCTGTGTCAGC    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    545 GCGTCATTTGGGATGAGGGAGTTCCGATCAATGAATCTTCCTGTGTCAGC    594

BSNT_03950___    601 TGCGGTCAGTGTGTCACAGTATGTCCATGTAATGCACTGATGGAAAAATC    650
                     ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    595 TGCGGTCAGTGTGTAACAGTATGTCCATGTAATGCACTGATGGAAAAATC    644

BSNT_03950___    651 AATGCTCGGGCAGGCTGGCTTTATGACAGGGATTAAAGAGGACGTCATGG    700
                     ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU27220___yr    645 AATGCTCGGGCAGGCTGGTTTTATGACAGGCATTAAAGAGGACGTCATGG    694

BSNT_03950___    701 AACCGATGATTGACCTCGTGAAAAATGTTGAACCGGGGTATGGCAGCATT    750
                     |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    695 AACCGATGATTGATCTCGTGAAAAATGTTGAACCGGGGTATGGCAGCATT    744

BSNT_03950___    751 TTTGCCATTTCTGAAGTCGAAGCGGCAATGCGTGAAACGAGAACGAAAAA    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    745 TTTGCCATTTCTGAAGTCGAAGCGGCAATGCGTGAAACGAGAACGAAAAA    794

BSNT_03950___    801 AACGAAAACTGTATGTACGTTCTGCGGTGTCGGGTGTTCATTTGAAGTAT    850
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU27220___yr    795 AACGAAAACTGTATGTACGTTCTGCGGTGTCGGATGTTCATTTGAAGTAT    844

BSNT_03950___    851 GGACAAAAGGACGGGATATTTTAAAGATCCAGCCTGTTTCTGATGCTCCG    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    845 GGACAAAAGGACGGGATATTTTAAAGATCCAGCCTGTTTCTGATGCTCCG    894

BSNT_03950___    901 GTTAACGCGATTTCCACATGTGTCAAAGGGAAATTCGGCTGGGATTTCGT    950
                     ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU27220___yr    895 GTTAACGCAATTTCCACATGTGTCAAAGGGAAATTCGGCTGGGATTTTGT    944

BSNT_03950___    951 CAATTCTGAGGAGCGAATCACAAAGCCTTTAATCCGTAAAAATGGAGCCT   1000
                     ||||||..|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU27220___yr    945 CAATTCAAAAGAGCGGATCACAAAGCCTTTAATCCGTAAAAACGGAGCCT    994

BSNT_03950___   1001 TTGTGGAATCTTCTTGGGAAGAGGCCCTCGATCTTGTCGCAAGCAGATTA   1050
                     ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr    995 TTGTGGAATCTTCTTGGGAAGAAGCCCTCGATCTTGTCGCAAGCAGATTA   1044

BSNT_03950___   1051 GGATCAATTAAAGAGCAGTACGGTAAAGGCTCTGTCGGGTTTATTTCTTC   1100
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU27220___yr   1045 GGATCAATTAAAGAGCAGTACGGTAAAGGCTCTGTAGGGTTTATTTCTTC   1094

BSNT_03950___   1101 TTCTAAAATTACGAATGAAGAAAACTACGTCATTCAAAAGCTAGCGCGTC   1150
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU27220___yr   1095 TTCTAAAATTACGAATGAAGAAAACTACGTCATTCAAAAACTAGCGCGTC   1144

BSNT_03950___   1151 AGGTATTTGAAACAAACAATGTCGATAACTGCTCACGCTACTGCCAGTCT   1200
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1145 AGGTATTTGAAACAAACAACGTCGATAACTGCTCACGCTACTGCCAGTCT   1194

BSNT_03950___   1201 CCTGCTACAGACGGATTGTTCCGCACTGTCGGCATGGGCGGTGACGCTGG   1250
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU27220___yr   1195 CCTGCTACAGACGGATTGTTCCGCACTGTCGGCATGGGCGGTGACGCCGG   1244

BSNT_03950___   1251 CACGATTAAAGATATTGCCAAAGCCGGTCTCGTCATCATCGTCGGCGCCA   1300
                     ||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||
BSU27220___yr   1245 CACGATTAAAGATATTGCCAAAGCAGGCCTGGTCATCATTGTCGGTGCCA   1294

BSNT_03950___   1301 ATCCGGCGGAAGGACACCCGGTGCTCGCAACACGCGTCAAACGGGCGCAC   1350
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU27220___yr   1295 ATCCGGCGGAAGGACACCCAGTGCTCGCAACACGCGTCAAACGGGCACAC   1344

BSNT_03950___   1351 AAGCTTCACGGTCAAAAACTGATTGTTGCCGACCTGCGTAAAAATGAGAT   1400
                     |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1345 AAGCTCCACGGTCAAAAACTGATTGTTGCTGACCTGCGTAAAAATGAGAT   1394

BSNT_03950___   1401 GGCCGAGCGATCTGATCTGTTCATCAGCCCTAAACAAGGCACAGACCAAG   1450
                     |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1395 GGCTGAGCGATCTGATCTGTTCATCAGCCCTAAACAAGGCACAGACCAAG   1444

BSNT_03950___   1451 TCTGGCTGATGGCTGTTACGAAATATATGATCGACCAAGGCTGGCACGAT   1500
                     |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1445 TTTGGCTGATGGCTGTTACGAAATATATGATCGACCAAGGCTGGCACGAT   1494

BSNT_03950___   1501 CAGGCGTTTATTGATGAGAATGTTAATTACTTTGAAGATTATAAAGAAAC   1550
                     ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1495 CAGGCGTTTATTGATGAGAACGTCAATTACTTTGAAGATTATAAAGAAAC   1544

BSNT_03950___   1551 TCTTAAAACGTATACGCTTGATTATGCAGAACGCATCACAGGCCTTTCAA   1600
                     .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1545 CCTTAAAACGTATACGCTTGATTATGCAGAACGCATCACAGGCCTTTCAA   1594

BSNT_03950___   1601 AAGAAAACATCATTCAAATTGCTGAAATGATCCGTGATGCTGACGGTACT   1650
                     |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
BSU27220___yr   1595 AAGAAAACATCATTCAAATTGCTGAAATGATTCGTGATGCTGACGGCACT   1644

BSNT_03950___   1651 TGTGTCCTTTGGGGAATGGGTGTCACACAAAATACAGGCGGTTCTGATAC   1700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1645 TGTGTCCTTTGGGGAATGGGTGTCACACAAAATACAGGCGGTTCTGATAC   1694

BSNT_03950___   1701 ATCAGCAGCCATTTCAAACCTGCTTCTCGCTACGGGCAACTATCGCCGTC   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1695 ATCAGCAGCCATTTCAAACCTGCTTCTCGCTACGGGCAACTATCGCCGTC   1744

BSNT_03950___   1751 CAGGTGCCGGCGCTTATCCTCTGCGCGGACACAATAACGTGCAAGGCGCA   1800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1745 CAGGTGCCGGCGCTTATCCTCTGCGCGGACACAATAACGTGCAAGGCGCA   1794

BSNT_03950___   1801 TGTGATATGGGAACATTGCCTGGCTGGCTGCCGGGATATCAGCATATTAC   1850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1795 TGTGATATGGGAACATTGCCTGGCTGGCTGCCGGGATATCAGCATATTAC   1844

BSNT_03950___   1851 AGATGACAAGGCCCGCGCTAAATTTGAAGAGGCATATGGTGTCGAGATTG   1900
                     |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1845 AGATGACAAAGCACGCGCTAAATTTGAAGAGGCATATGGTGTCGAGATTG   1894

BSNT_03950___   1901 ATGGAAAGCCTGGTTTAGATAATATTCAAATGCTTCATGCCATTGAAGAA   1950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1895 ATGGAAAGCCTGGTTTAGATAATATTCAAATGCTTCATGCCATTGAAGAA   1944

BSNT_03950___   1951 GGAAAAATGAAAGCTATGTATCTTGTCGGTGAGGATATGGCACTGGTCGA   2000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1945 GGAAAAATGAAAGCTATGTATCTTGTCGGTGAGGATATGGCACTGGTCGA   1994

BSNT_03950___   2001 TTCAAACGCGAACCATGTGCATGATATTTTATCAAGCCTTGATTTCTTCG   2050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   1995 TTCAAACGCGAACCATGTGCATGATATTTTATCAAGCCTTGATTTCTTCG   2044

BSNT_03950___   2051 TGGTACAGGACATCTTCCTGTCAAGAACAGCTCAATATGCTGATGTCGTC   2100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2045 TGGTACAGGACATCTTCCTGTCAAGAACAGCTCAATATGCTGATGTCGTC   2094

BSNT_03950___   2101 TTGCCGGCCACTCCTTCACTTGAAAAAGACGGAACATTTACCAACACAGA   2150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2095 TTGCCGGCCACTCCTTCACTTGAAAAAGACGGAACATTTACCAACACAGA   2144

BSNT_03950___   2151 ACGCCGTGTCCAGCGATTGTATCAGGCGCTTCCGACGCTTGGTGACGCAA   2200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2145 ACGCCGTGTCCAGCGATTGTATCAGGCGCTTCCGACGCTTGGTGACGCAA   2194

BSNT_03950___   2201 AACCGGACTGGTGGATTATTCAAGAGGTGGCAAACCGTTTAGGAGCGAAT   2250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2195 AACCGGACTGGTGGATTATTCAAGAGGTGGCAAACCGTTTAGGAGCGAAT   2244

BSNT_03950___   2251 TGGAATTACAGCCATCCAAGTGACATTTTCTCTGAAATGGCGAGTCTTTC   2300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2245 TGGAATTACAGCCATCCAAGTGACATTTTCTCTGAAATGGCGAGTCTTTC   2294

BSNT_03950___   2301 TCCTCTGTTTGCCAAAGCAAGCTATGAGGTGCTTGAAGGCTGGAACAGCT   2350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2295 TCCTCTGTTTGCCAAAGCAAGCTATGAGGTGCTTGAAGGCTGGAACAGCT   2344

BSNT_03950___   2351 TCCTATGGGGCAGCTTCACAGGTGAAAGCACACCGCTTCTGTATGAAGAC   2400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2345 TCCTATGGGGCAGCTTCACAGGTGAAAGCACACCGCTTCTGTATGAAGAC   2394

BSNT_03950___   2401 GGATTTAATTTCCCTGACAAAAAAGCCCGCTTTGCCCTTTCTGATTGGAC   2450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2395 GGATTTAATTTCCCTGACAAAAAAGCCCGCTTTGCCCTTTCTGATTGGAC   2444

BSNT_03950___   2451 CGAGCCAGCGGCATTTCCGGAGGAATATGACCTTCATATCAATAACGGCC   2500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2445 CGAGCCAGCGGCATTTCCGGAGGAATATGACCTTCATATCAATAACGGCC   2494

BSNT_03950___   2501 GGATGCTGGAGCATTTCCACGAAGGAAACATGACAAATAAATCGAAAGGC   2550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2495 GGATGCTGGAGCATTTCCACGAAGGAAACATGACAAATAAATCGAAAGGC   2544

BSNT_03950___   2551 ATCCAAGCGAAAGTGCCAAATGTATTCGTTGAGATCTCACCTGAGCTTGC   2600
                     |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2545 ATCCAAGCGAAAGTGCCGAATGTATTCGTTGAGATCTCACCTGAGCTTGC   2594

BSNT_03950___   2601 ACAAGAGCGAGGTGTTTGTGACGGTTCGCTTGTACGGCTCGTTTCTCCGT   2650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2595 ACAAGAGCGAGGTGTTTGTGACGGTTCGCTTGTACGGCTCGTTTCTCCGT   2644

BSNT_03950___   2651 TCGGAGCAGTCAAATTGAACGCGCTGATCACAGACCGGGTACGGAAAAAT   2700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2645 TCGGAGCAGTCAAATTGAACGCGCTGATCACAGACCGGGTACGGAAAAAT   2694

BSNT_03950___   2701 GAACTCTATTTGCCAATGAACTCGACAGACAAGGAGTCAGCAATTAACTT   2750
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU27220___yr   2695 GAACTCTATTTGCCAATGAACTCGACAGACAAGGAGTCAGCGATTAACTT   2744

BSNT_03950___   2751 CTTGACGGGCCCTGCAGCTGATAAACGGACGAACACGCCTGCTTATAAAC   2800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2745 CTTGACGGGCCCTGCAGCTGATAAACGGACGAACACGCCTGCTTATAAAC   2794

BSNT_03950___   2801 AGACAAAGGTCCGCATGGAAGTGCTTGGCGGCTGTGAAACAGCGCCGCTT   2850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2795 AGACAAAGGTCCGCATGGAAGTGCTTGGCGGCTGTGAAACAGCGCCGCTT   2844

BSNT_03950___   2851 CCAAAAACAAATCCGCGCAACAAAAAACGGCATCCGCAAAACGGAGTCGA   2900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr   2845 CCAAAAACAAATCCGCGCAACAAAAAACGGCATCCGCAAAACGGAGTCGA   2894

BSNT_03950___   2901 AGCAGAAAGAAAATGGAACCGCCCTGGCTATGTCCATCTGACTGATTAA   2949
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU27220___yr   2895 AGCAGAAAGAAAATGGAACCGCCCTGGCTATGTACATCTGACTGATTAA   2943


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.