Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04149 and BSU28440
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04149 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:23:32
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04149___sdhA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU28440___sdhA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04149___sdhA-BSU28440___sdhA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04149___sdhA-BSU28440___sdhA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04149___sdhA
# 2: BSU28440___sdhA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1761
# Identity: 1744/1761 (99.0%)
# Similarity: 1744/1761 (99.0%)
# Gaps: 0/1761 ( 0.0%)
# Score: 8652.0
#
#
#=======================================
BSNT_04149___ 1 ATGAGTCAATCAAGCATTATCGTAGTCGGCGGGGGTCTTGCCGGCCTCAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1 ATGAGTCAATCAAGCATTATCGTAGTCGGCGGGGGTCTTGCCGGCCTCAT 50
BSNT_04149___ 51 GGCGACAATTAAAGCAGCGGAATCAGGAATGGCGGTTAAGCTGTTTTCCA 100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
BSU28440___sd 51 GGCGACAATTAAAGCAGCGGAATCAGGAATGGCGGTTAAATTGTTTTCCA 100
BSNT_04149___ 101 TCGTTCCTGTCAAACGTTCTCATTCGGTTTGTGCGCAAGGCGGCATAAAC 150
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 101 TCGTTCCTGTCAAACGTTCTCATTCAGTTTGTGCGCAAGGCGGCATAAAC 150
BSNT_04149___ 151 GGAGCGGTCAATACAAAAGGGGAAGGTGACTCTCCGTGGGAACATTTTGA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 151 GGAGCGGTCAATACAAAAGGGGAAGGTGACTCTCCGTGGGAACATTTTGA 200
BSNT_04149___ 201 TGACACGGTATACGGGGGAGACTTTCTTGCCAACCAGCCGCCGGTCAAGG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 201 TGACACGGTATACGGGGGAGACTTTCTTGCCAACCAGCCGCCGGTCAAGG 250
BSNT_04149___ 251 CGATGTGTGAAGCGGCGCCTTCGATCATCCACTTATTAGACCGGATGGGC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 251 CGATGTGTGAAGCGGCGCCTTCGATCATCCACTTATTAGACCGGATGGGC 300
BSNT_04149___ 301 GTCATGTTTAACCGGACGCCTGAAGGCCTGCTTGATTTCCGCCGATTCGG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 301 GTCATGTTTAACCGGACGCCTGAAGGCCTGCTTGATTTCCGCCGATTCGG 350
BSNT_04149___ 351 GGGTACACAGCACCACAGAACTGCTTATGCTGGTGCGACGACGGGACAGC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 351 GGGTACACAGCACCACAGAACTGCTTATGCTGGTGCGACGACGGGACAGC 400
BSNT_04149___ 401 AGCTGCTTTACGCACTGGACGAGCAAGTGCGCAGATACGAAGTTGCGGGT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 401 AGCTGCTTTACGCACTGGACGAGCAAGTGCGCAGATACGAAGTTGCGGGT 450
BSNT_04149___ 451 CTGGTCACAAAATACGAAGGTTGGGAATTCCTTGGCGCTGTTTTAGATGA 500
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 451 CTGGTCACAAAATACGAAGGCTGGGAATTCCTTGGCGCTGTTTTAGATGA 500
BSNT_04149___ 501 TGACAGAACCTGCCGCGGAATTGTTGCACAAAACCTGACAAACATGCAAA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 501 TGACAGAACCTGCCGCGGAATTGTTGCACAAAACCTGACAAACATGCAAA 550
BSNT_04149___ 551 TTGAATCTTTCCGTTCAGACGCTGTCATTATGGCGACGGGCGGACCGGGA 600
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 551 TTGAATCCTTCCGTTCAGACGCTGTCATTATGGCGACGGGCGGACCGGGA 600
BSNT_04149___ 601 ATCATCTTTGGAAAATCAACGAACTCCATGATTAATACAGGATCTGCTGC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 601 ATCATCTTTGGAAAATCAACGAACTCCATGATTAATACAGGATCTGCTGC 650
BSNT_04149___ 651 ATCAATCGTTTATCAGCAGGGAGCGTATTATGCAAACGGAGAATTCATTC 700
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 651 GTCAATCGTTTATCAGCAGGGAGCGTATTATGCAAACGGAGAATTCATTC 700
BSNT_04149___ 701 AAATCCACCCGACAGCCATACCGGGCGATGACAAATTAAGACTGATGAGT 750
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU28440___sd 701 AAATCCACCCGACAGCCATACCGGGCGATGACAAACTAAGACTGATGAGT 750
BSNT_04149___ 751 GAATCAGCGCGTGGTGAAGGCGGTCGCGTGTGGACATATAAAGACGGCAA 800
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 751 GAATCAGCGCGTGGTGAAGGCGGGCGCGTGTGGACATATAAAGACGGCAA 800
BSNT_04149___ 801 ACCTTGGTATTTCCTGGAGGAAAAATATCCGGCATACGGAAACCTGGTGC 850
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 801 ACCATGGTATTTCCTGGAGGAAAAATATCCGGCATACGGAAACCTGGTGC 850
BSNT_04149___ 851 CGCGTGATATTGCGACACGCGAAATATTTGATGTGTGTGTGAACCAGAAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 851 CGCGTGATATTGCGACACGCGAAATATTTGATGTGTGTGTGAACCAGAAG 900
BSNT_04149___ 901 CTCGGCATTAACGGTGAAAACATGGTATATCTCGATCTGTCTCATAAAGA 950
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 901 CTCGGTATTAACGGTGAAAACATGGTATATCTCGATCTGTCTCATAAAGA 950
BSNT_04149___ 951 TCCGAAAGAGCTTGATATTAAGCTTGGCGGCATCATTGAGATTTACGAGA 1000
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU28440___sd 951 TCCGAAAGAGCTTGATATTAAGCTTGGCGGCATCATTGAGATTTATGAGA 1000
BSNT_04149___ 1001 AATTCATGGGAGACGACCCGCGTAAGCTTCCAATGAAAATCTTCCCGGCG 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1001 AATTCATGGGAGACGACCCGCGTAAGCTTCCAATGAAAATCTTCCCGGCG 1050
BSNT_04149___ 1051 GTCCATTATTCTATGGGCGGTTTATGGGTGGATTACGATCAAATGACAAA 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1051 GTCCATTATTCTATGGGCGGTTTATGGGTGGATTACGATCAAATGACAAA 1100
BSNT_04149___ 1101 CATCCCTGGACTGTTTGCGGCTGGGGAATGTGATTATTCTATGCACGGCG 1150
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1101 TATCCCTGGACTGTTTGCGGCTGGGGAATGTGATTATTCTATGCACGGCG 1150
BSNT_04149___ 1151 GCAACCGCTTGGGAGCGAACTCCTTGCTGTCTGCGATTTACGGAGGCATG 1200
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1151 GCAACCGCTTGGGAGCGAACTCCCTGCTGTCTGCGATTTACGGAGGCATG 1200
BSNT_04149___ 1201 GTGGCCGGACCGAATGCGGTGAAATATGTAAACGGCTTAGAATCTTCAGC 1250
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1201 GTGGCCGGTCCGAATGCGGTGAAATATGTAAACGGCTTAGAATCTTCAGC 1250
BSNT_04149___ 1251 GGAAGACATGTCTTCATCTTTATTCGACGCTCACGTTAAGAAAGAAGAAG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1251 GGAAGACATGTCTTCATCTTTATTCGACGCTCACGTTAAGAAAGAAGAAG 1300
BSNT_04149___ 1301 AAAAATGGGCTGACATTATGAGTATGGACGGAACCGAAAATGCCTATGTT 1350
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1301 AAAAATGGGCTGATATTATGAGTATGGACGGAACCGAAAATGCCTATGTT 1350
BSNT_04149___ 1351 CTTCACAAAGAGCTCGGTGAGTGGATGACGGCGAACGTAACGGTTGTCCG 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1351 CTTCACAAAGAGCTCGGTGAGTGGATGACGGCGAACGTAACGGTTGTCCG 1400
BSNT_04149___ 1401 CCATAATGACAAGCTTTTGAAAACGGATGACAAAATTCAGGAGTTAATGG 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1401 CCATAATGACAAGCTTTTGAAAACGGATGACAAAATTCAGGAGTTAATGG 1450
BSNT_04149___ 1451 AGCGCTTCAAAAAGATCAACATCAATGACACGACAAAATGGAGCAACCAG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1451 AGCGCTTCAAAAAGATCAACATCAATGACACGACAAAATGGAGCAACCAG 1500
BSNT_04149___ 1501 GGAGCGATGTTCACACGCCAGTTCTCAAACATGCTTCAGCTTGCTAGGGT 1550
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
BSU28440___sd 1501 GGAGCGATGTTCACACGCCAGTTCTCGAACATGCTTCAGCTTGCGAGGGT 1550
BSNT_04149___ 1551 GATTACCCTTGGCGCATACAACCGTAATGAAAGCCGGGGCGCCCATTATA 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1551 GATTACCCTTGGCGCATACAACCGTAATGAAAGCCGGGGCGCCCATTATA 1600
BSNT_04149___ 1601 AACCGGATTATCCTGAACGTAATGATGATGAATGGCTCAAAACAACAATG 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1601 AACCGGATTATCCTGAACGTAATGATGATGAATGGCTCAAAACAACAATG 1650
BSNT_04149___ 1651 GCTAAACATGTAAGCCCGTATGAAGCGCCGGAATTTGAGTATCAGGATGT 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1651 GCTAAACATGTAAGCCCGTATGAAGCGCCGGAATTTGAGTATCAGGATGT 1700
BSNT_04149___ 1701 CGATGTATCACTGATAACGCCTCGGAAACGGGATTACTCGAAGAAGAAGG 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28440___sd 1701 CGATGTATCACTGATAACGCCTCGGAAACGGGATTACTCGAAGAAGAAGG 1750
BSNT_04149___ 1751 TGGCGAAATAA 1761
|||||||||||
BSU28440___sd 1751 TGGCGAAATAA 1761
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.