Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_04263 and BSU29180

See Amino acid alignment / Visit BSNT_04263 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:23:47
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_04263___pyk.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU29180___pyk.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_04263___pyk-BSU29180___pyk.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04263___pyk-BSU29180___pyk.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04263___pyk
# 2: BSU29180___pyk
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1758
# Identity:    1747/1758 (99.4%)
# Similarity:  1747/1758 (99.4%)
# Gaps:           0/1758 ( 0.0%)
# Score: 8691.0
# 
#
#=======================================

BSNT_04263___      1 ATGAGAAAAACTAAAATTGTTTGTACCATCGGTCCGGCAAGTGAAAGTAT     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py      1 ATGAGAAAAACTAAAATTGTTTGTACCATCGGTCCGGCAAGTGAAAGTAT     50

BSNT_04263___     51 TGAAATGCTTACGAAATTAATGGAGTCAGGAATGAACGTGGCTCGATTAA    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py     51 TGAAATGCTTACGAAATTAATGGAGTCAGGAATGAACGTGGCTCGATTAA    100

BSNT_04263___    101 ACTTTTCTCACGGAGATTTTGAGGAACACGGTGCAAGAATTAAAAATATC    150
                     |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    101 ACTTTTCTCACGGAGATTTTGAGGAGCACGGTGCAAGAATTAAAAATATC    150

BSNT_04263___    151 CGCGAAGCAAGTAAAAAACTTGGCAAGAACGTTGGAATTCTGCTTGATAC    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    151 CGCGAAGCAAGTAAAAAACTTGGCAAGAACGTTGGAATTCTGCTTGATAC    200

BSNT_04263___    201 AAAAGGTCCTGAAATCCGCACACATACAATGGAAAACGGCGGTATTGAGC    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    201 AAAAGGTCCTGAAATCCGCACACATACAATGGAAAACGGCGGTATTGAGC    250

BSNT_04263___    251 TTGAAACAGGCAAAGAGCTCATTATTTCAATGGACGAGGTTGTAGGAACA    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    251 TTGAAACAGGCAAAGAGCTCATTATTTCAATGGACGAGGTTGTAGGAACA    300

BSNT_04263___    301 ACAGATAAAATTTCAGTGACATATGAAGGTTTAGTCCATGACGTTGAACA    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    301 ACAGATAAAATTTCAGTGACATATGAAGGTTTAGTCCATGACGTTGAACA    350

BSNT_04263___    351 AGGTTCAACGATTCTGTTAGATGACGGCCTTATCGGTCTTGAGGTACTTG    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    351 AGGTTCAACGATTCTGTTAGATGACGGCCTTATCGGTCTTGAGGTACTTG    400

BSNT_04263___    401 ATGTAGATGCCGCTAAACGCGAAATCAAAACAAAAGTATTAAACAACGGA    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    401 ATGTAGATGCCGCTAAACGCGAAATCAAAACAAAAGTATTAAACAACGGA    450

BSNT_04263___    451 ACACTCAAAAATAAAAAAGGTGTTAACGTACCGGGCGTAAGTGTCAATCT    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    451 ACACTCAAAAATAAAAAAGGTGTTAACGTACCGGGCGTAAGTGTCAATCT    500

BSNT_04263___    501 TCCGGGTATTACTGAAAAGGATGCGCGAGACATCGTTTTCGGTATTGAGC    550
                     ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    501 TCCGGGGATTACTGAAAAGGATGCGCGAGACATCGTTTTCGGTATTGAGC    550

BSNT_04263___    551 AAGGAGTAGACTTCATCGCACCATCTTTCATTCGACGTTCTACGGATGTG    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    551 AAGGAGTAGACTTCATCGCACCATCTTTCATTCGACGTTCTACGGATGTG    600

BSNT_04263___    601 CTCGAAATCCGTGAGCTTCTTGAAGAGCACAACGCTCAGGAAATTCAAAT    650
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU29180___py    601 CTCGAAATCCGTGAGCTTCTTGAAGAGCACAACGCTCAGGATATTCAAAT    650

BSNT_04263___    651 CATCCCTAAAATCGAAAACCAAGAGGGCGTTGACAACATCGATGCGATTC    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    651 CATCCCTAAAATCGAAAACCAAGAGGGCGTTGACAACATCGATGCGATTC    700

BSNT_04263___    701 TCGAAGTGTCTGACGGCTTAATGGTTGCACGCGGAGACTTAGGTGTGGAA    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    701 TCGAAGTGTCTGACGGCTTAATGGTTGCACGCGGAGACTTAGGTGTGGAA    750

BSNT_04263___    751 ATTCCAGCTGAAGAAGTGCCGCTTGTGCAAAAAGAACTGATCAAAAAATG    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    751 ATTCCAGCTGAAGAAGTGCCGCTTGTGCAAAAAGAACTGATCAAAAAATG    800

BSNT_04263___    801 CAACGCGCTGGGCAAACCTGTTATTACAGCAACACAAATGCTTGACAGCA    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU29180___py    801 CAACGCGCTGGGCAAACCTGTTATTACAGCGACACAAATGCTTGACAGCA    850

BSNT_04263___    851 TGCAGCGCAACCCGCGTCCGACTCGTGCGGAAGCAAGTGACGTTGCAAAC    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    851 TGCAGCGCAACCCGCGTCCGACTCGTGCGGAAGCAAGTGACGTTGCAAAC    900

BSNT_04263___    901 GCGATCTTCGACGGAACAGATGCGATCATGCTTTCTGGTGAAACTGCTGC    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    901 GCGATCTTCGACGGAACAGATGCGATCATGCTTTCTGGTGAAACTGCTGC    950

BSNT_04263___    951 CGGAAGTTATCCGGTTGAAGCAGTTCAAACAATGCATAACATCGCGTCCC   1000
                     |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py    951 CGGAAGTTACCCGGTTGAAGCAGTTCAAACAATGCATAACATCGCGTCCC   1000

BSNT_04263___   1001 GTTCTGAAGAAGCGTTAAATTATAAAGAAATTCTCTCAAAACGCAGAGAT   1050
                     |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU29180___py   1001 GTTCTGAAGAAGCATTAAATTATAAAGAAATTCTCTCAAAACGCAGAGAC   1050

BSNT_04263___   1051 CAAGTTGGCATGACAATTACAGACGCAATTGGACAATCTGTCGCACATAC   1100
                     |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1051 CAAGTGGGCATGACAATTACAGACGCAATTGGACAATCTGTCGCACATAC   1100

BSNT_04263___   1101 GGCGATTAACCTGAATGCTGCTGCGATCGTAACGCCGACAGAAAGCGGCC   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1101 GGCGATTAACCTGAATGCTGCTGCGATCGTAACGCCGACAGAAAGCGGCC   1150

BSNT_04263___   1151 ATACAGCACGTATGATTGCAAAATACCGTCCGCAGGCTCCGATTGTTGCG   1200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1151 ATACAGCACGTATGATTGCAAAATACCGTCCGCAGGCTCCGATTGTTGCG   1200

BSNT_04263___   1201 GTTACTGTAAATGACTCTATTTCCAGAAAGCTTGCCCTCGTATCTGGCGT   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1201 GTTACTGTAAATGACTCTATTTCCAGAAAGCTTGCCCTCGTATCTGGCGT   1250

BSNT_04263___   1251 ATTCGCGGAAAGCGGCCAAAATGCGAGCTCAACAGATGAGATGCTTGAGG   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1251 ATTCGCGGAAAGCGGCCAAAATGCGAGCTCAACAGATGAGATGCTTGAGG   1300

BSNT_04263___   1301 ATGCTGTCCAAAAATCATTGAACAGCGGAATTGTAAAACACGGCGATCTT   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1301 ATGCTGTCCAAAAATCATTGAACAGCGGAATTGTAAAACACGGCGATCTT   1350

BSNT_04263___   1351 ATCGTTATTACAGCAGGCACTGTCGGTGAGTCCGGCACTACGAACTTAAT   1400
                     ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1351 ATCGTTATTACAGCTGGCACTGTCGGTGAGTCCGGCACTACGAACTTAAT   1400

BSNT_04263___   1401 GAAGGTTCATACTGTCGGCGATATCGTCGCTAAAGGCCAAGGCATTGGAC   1450
                     |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1401 GAAGGTTCATACTGTCGGCGATATCATCGCTAAAGGCCAAGGCATTGGAC   1450

BSNT_04263___   1451 GCAAATCAGCTTACGGTCCGGTTGTCGTTGCACAAAATGCAAAAGAAGCT   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1451 GCAAATCAGCTTACGGTCCGGTTGTCGTTGCACAAAATGCAAAAGAAGCT   1500

BSNT_04263___   1501 GAGCAAAAAATGACTGACGGTGCGGTACTTGTTACCAAAAGCACTGACCG   1550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1501 GAGCAAAAAATGACTGACGGTGCGGTACTTGTTACCAAAAGCACTGACCG   1550

BSNT_04263___   1551 TGATATGATTGCATCCCTTGAAAAAGCGTCTGCTCTTATTACAGAAGAAG   1600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1551 TGATATGATTGCATCCCTTGAAAAAGCGTCTGCTCTTATTACAGAAGAAG   1600

BSNT_04263___   1601 GCGGTTTGACTAGCCATGCGGCGGTAGTCGGATTAAGCCTTGGCATCCCG   1650
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1601 GCGGTTTGACTAGCCATGCTGCGGTAGTCGGATTAAGCCTTGGCATCCCG   1650

BSNT_04263___   1651 GTTATCGTGGGTCTGGAAAATGCGACATCTATTTTGACAGATGGCCAGGA   1700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1651 GTTATCGTGGGTCTGGAAAATGCGACATCTATTTTGACAGATGGCCAGGA   1700

BSNT_04263___   1701 TATTACAGTTGACGCTTCCAGAGGCGCAGTCTATCAAGGCCGTGCGAGCG   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py   1701 TATTACAGTTGACGCTTCCAGAGGCGCAGTCTATCAAGGCCGTGCGAGCG   1750

BSNT_04263___   1751 TTCTTTAA   1758
                     ||||||||
BSU29180___py   1751 TTCTTTAA   1758


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.