Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04377 and BSU30050
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04377 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:24:02
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04377___ytgP.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU30050___ytgP.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04377___ytgP-BSU30050___ytgP.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04377___ytgP-BSU30050___ytgP.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04377___ytgP
# 2: BSU30050___ytgP
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1635
# Identity: 1618/1635 (99.0%)
# Similarity: 1618/1635 (99.0%)
# Gaps: 0/1635 ( 0.0%)
# Score: 8022.0
#
#
#=======================================
BSNT_04377___ 1 ATGTCAAGCAAACTGTTAAGAGGCACGTTTGTATTAACGCTCGGTACATA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1 ATGTCAAGCAAACTGTTAAGAGGCACGTTTGTATTAACGCTCGGTACATA 50
BSNT_04377___ 51 TATATCGCGGATTCTGGGGATGGTCTATTTAATTCCCTTCAGCATTATGG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 51 TATATCGCGGATTCTGGGGATGGTCTATTTAATTCCCTTCAGCATTATGG 100
BSNT_04377___ 101 TCGGGGCGACAGGCGGTGCATTATTTCAATACGGATACAACCAATACACT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 101 TCGGGGCGACAGGCGGTGCATTATTTCAATACGGATACAACCAATACACT 150
BSNT_04377___ 151 TTATTTTTGAATATTGCTACGATGGGCTTTCCGGCCGCTGTTTCTAAATT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 151 TTATTTTTGAATATTGCTACGATGGGCTTTCCGGCCGCTGTTTCTAAATT 200
BSNT_04377___ 201 TGTTTCCAAATATAATTCAAAAGGGGATTATGAGACAAGCAGGAAAATGC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 201 TGTTTCCAAATATAATTCAAAAGGGGATTATGAGACAAGCAGGAAAATGC 250
BSNT_04377___ 251 TCAAGGCGGGCATGTCGGTTATGCTCGTCACAGGAATGATAGCCTTTTTC 300
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 251 TCAAGGCGGGCATGTCGGTTATGCTAGTCACAGGAATGATAGCCTTTTTC 300
BSNT_04377___ 301 ATTCTGTATCTATCGGCTCCGATGTTTGCGGAAATATCGCTGGGAGGCAA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 301 ATTCTGTATCTATCGGCTCCGATGTTTGCGGAAATATCGCTGGGAGGCAA 350
BSNT_04377___ 351 GGATAATAACGGCTTGACAATTGATCATGTCGTTTATGTCATCCGCATGG 400
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 351 GGATAATAACGGCCTGACAATTGATCATGTCGTTTATGTCATCCGCATGG 400
BSNT_04377___ 401 TCAGCTTAGCGCTTTTGGTCGTACCGATTATGAGCCTTGTCCGCGGATTC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 401 TCAGCTTAGCGCTTTTGGTCGTACCGATTATGAGCCTTGTCCGCGGATTC 450
BSNT_04377___ 451 TTTCAAGGGCACCAAATGATGGGTCCGACAGCTGTTTCCCAAGTCGTTGA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 451 TTTCAAGGGCACCAAATGATGGGTCCGACAGCTGTTTCCCAAGTCGTTGA 500
BSNT_04377___ 501 ACAGATTGTCCGCATCATCTTTCTATTGAGTGCGACATTCTTGATTTTGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 501 ACAGATTGTCCGCATCATCTTTCTATTGAGTGCGACATTCTTGATTTTGA 550
BSNT_04377___ 551 AGGTTTTCAACGGCGGCCTTGTCATCGCTGTGGGCTATGCAACCTTCGCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 551 AGGTTTTCAACGGCGGCCTTGTCATCGCTGTGGGCTATGCAACCTTCGCA 600
BSNT_04377___ 601 GCGCTGATCGGTGCCTTCGGGGGGCTGGTCGTGCTTTATATTTATTGGAA 650
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 601 GCGCTGATCGGTGCCTTCGGAGGGCTGGTCGTGCTTTATATTTATTGGAA 650
BSNT_04377___ 651 CAAACGGAAGGGCAGCCTGCTGGCGATGATGCCGAATACGGGTCCGACAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 651 CAAACGGAAGGGCAGCCTGCTGGCGATGATGCCGAATACGGGTCCGACAG 700
BSNT_04377___ 701 CAAACCTAAGCTACAAAAAAATGTTTTTCGAGCTGTTCAGCTATGCTGCT 750
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 701 CAAACCTAAGCTACAAGAAAATGTTTTTCGAGCTGTTCAGCTATGCTGCT 750
BSNT_04377___ 751 CCGTACGTTTTTGTCGGACTAGCCATCCCTTTGTATAACTATATTGATAC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 751 CCGTACGTTTTTGTCGGACTAGCCATCCCTTTGTATAACTATATTGATAC 800
BSNT_04377___ 801 AAATACGTTTAACAAAGCGATGATTGAAGCCGGTCATCAAGCCATCAGCC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 801 AAATACGTTTAACAAAGCGATGATTGAAGCCGGTCATCAAGCCATCAGCC 850
BSNT_04377___ 851 AGGACATGCTTGCGATTCTAACCCTGTATGTTCAGAAGCTCGTGATGATC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 851 AGGACATGCTTGCGATTCTAACCCTGTATGTTCAGAAGCTCGTGATGATC 900
BSNT_04377___ 901 CCGGTTTCCCTAGCAACTGCTTTCGGACTGACATTAATTCCAACGATTAC 950
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 901 CCGGTTTCCCTAGCAACTGCTTTTGGACTGACATTAATTCCAACGATTAC 950
BSNT_04377___ 951 TGAATCGTTTACAAGCGGAAACTATAAGCTGTTAAATCAGCAGATTAATC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 951 TGAATCGTTTACAAGCGGAAACTATAAGCTGTTAAATCAGCAGATTAATC 1000
BSNT_04377___ 1001 AAACGATGCAGACGATCCTGTTTTTAATTATTCCGGCTGTTGTCGGGATC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1001 AAACGATGCAGACGATCCTGTTTTTAATTATTCCGGCTGTTGTCGGGATC 1050
BSNT_04377___ 1051 TCTCTATTGTCAGGACCGACGTATACGTTCTTTTACGGGTCAGAGAGCCT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1051 TCTCTATTGTCAGGACCGACGTATACGTTCTTTTACGGGTCAGAGAGCCT 1100
BSNT_04377___ 1101 TCACCCTGAACTGGGGGCAAACATTTTGCTATGGTATTCGCCAGTCGCGA 1150
|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
BSU30050___yt 1101 TCATCCTGAACTGGGGGCAAACATTTTGCTTTGGTATTCGCCTGTCGCAA 1150
BSNT_04377___ 1151 TTTTGTTCTCTTTGTTTACAGTCAACGCAGCCATTCTGCAGGGCATCAAT 1200
||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1151 TTCTGTTCTCTTTGTTTACAGTCAACGCAGCTATTCTGCAGGGCATCAAT 1200
BSNT_04377___ 1201 AAGCAAAAATTTGCGGTTGTCAGCCTTGTGATCGGTGTCGTGATCAAGCT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1201 AAGCAAAAATTTGCGGTTGTCAGCCTTGTGATCGGTGTCGTGATCAAGCT 1250
BSNT_04377___ 1251 TGTGCTGAATGTTCCGCTGATCAAGCTGATGCAGGCTGACGGAGCGATTT 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1251 TGTGCTGAATGTTCCGCTGATCAAGCTGATGCAGGCTGACGGAGCGATTT 1300
BSNT_04377___ 1301 TAGCGACGGCGCTTGGATATATCGCTTCCCTTTTATATGGGTTTATCATG 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1301 TAGCGACGGCGCTTGGATATATCGCTTCCCTTTTATATGGGTTTATCATG 1350
BSNT_04377___ 1351 ATTAAGCGCCATGCAGGCTATTCGTATAAGATACTAGTTAAACGAACTGT 1400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU30050___yt 1351 ATTAAGCGCCATGCAGGCTATTCGTATAAGATACTTGTTAAACGAACTGT 1400
BSNT_04377___ 1401 TTTGATGCTTGTATTATCAGCCATTATGGGTATTGCCGTGAAAATCGTGC 1450
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1401 TTTGATGCTGGTCTTATCAGCCATTATGGGTATTGCCGTGAAAATCGTGC 1450
BSNT_04377___ 1451 AGTGGGTATTAGGCTTCTTTATTTCCTATCAGGATGGCCAGCTGCAAGCT 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU30050___yt 1451 AGTGGGTATTAGGCTTCTTTATTTCCTATCAGGATGGCCAGATGCAAGCT 1500
BSNT_04377___ 1501 GCGATTGTTGTGGTGATCGCGGCCGCTGTTGGCGGAGCTGTCTACCTGTA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1501 GCGATTGTTGTGGTGATCGCGGCCGCTGTTGGCGGAGCTGTCTACCTGTA 1550
BSNT_04377___ 1551 TTGCGGCTACCGATTAGGATTTTTACAGAAAATTTTAGGCCGCCGTTTGC 1600
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1551 TTGCGGCTACCGATTAGGATTTTTGCAGAAAATTTTAGGCCGCCGTTTGC 1600
BSNT_04377___ 1601 CAGGTTTCTTAAGGAAAGGCAGACATGCAGGCTGA 1635
||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU30050___yt 1601 CAGGTTTCTTTAGGAAAGGCAGACATGCAGGCTGA 1635
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.