Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04576 and BSU31130
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04576 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:24:23
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04576___yubD.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU31130___yubD.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04576___yubD-BSU31130___yubD.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04576___yubD-BSU31130___yubD.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04576___yubD
# 2: BSU31130___yubD
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1536
# Identity: 1508/1536 (98.2%)
# Similarity: 1508/1536 (98.2%)
# Gaps: 0/1536 ( 0.0%)
# Score: 7428.0
#
#
#=======================================
BSNT_04576___ 1 ATGAAGACAAAACACTATTGGGTGATTTCTTTGCTCGCCGTCTTAGCGGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1 ATGAAGACAAAACACTATTGGGTGATTTCTTTGCTCGCCGTCTTAGCGGT 50
BSNT_04576___ 51 CGGGCCGGGATTGATGTCTAACACGGCATTGTCGTCAGTTCAAGGCCTTG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 51 CGGGCCGGGATTGATGTCTAACACGGCATTGTCGTCAGTTCAAGGCCTTG 100
BSNT_04576___ 101 TTCAGAAAGCGGTTGGAACAAGTGTCTTCACATCAGTAAATCCGATATTG 150
||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 101 TTCAGAAAACGGTTGGAACAAGTGTCTTTACATCAGTAAATCCGATATTG 150
BSNT_04576___ 151 ATCGGCAATATGGCCTTTGCCTTGTTAGTTCCGGCAGGACCGCTGCTGAG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 151 ATCGGCAATATGGCCTTTGCCTTGTTAGTTCCGGCAGGACCGCTGCTGAG 200
BSNT_04576___ 201 GAAAAAATTCGGTGCGCGTCCCGTCTATCTGGCTTCATTACCTGTCTTTA 250
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 201 GAAAAAATTCGGTGCTCGTCCCGTCTATCTGGCTTCATTACCTGTCTTTA 250
BSNT_04576___ 251 TACTAGGCTCACTGCTCATCGCATGTTCAGGCGATATTGCATGGATGGCG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU31130___yu 251 TACTAGGCTCACTGCTCATCGCATGTTCAGGCGATATTGCATTGATGGCG 300
BSNT_04576___ 301 GCAGGGCGCTTTTTACAGGGGGCGGCAACAGGCGTCATGCTGATGATTAT 350
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 301 GCAGGGCGCTTTTTACAAGGGGCGGCAACAGGCGTCATGCTGATGATTAT 350
BSNT_04576___ 351 GATTCCAATGCTTGTACTGTCATTCCCGATTGAACGCAGGAACTATGCAC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 351 GATTCCAATGCTTGTACTGTCATTCCCGATTGAACGCAGGAACTATGCAC 400
BSNT_04576___ 401 TGCTTGTGCTGATCGGGGGATTCTATGGTTCTGTTATCATCGGCACAATC 450
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU31130___yu 401 TGCTTGTGCTGATCGGGGGATTCTATGGTTCTGTTATCATCGGTACAATC 450
BSNT_04576___ 451 CTCGGAACCATTGCAACAAGCTGCGGGCATTGGAGATGGCTGTTTTTCAT 500
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 451 CTGGGAACCATTGCAACAAGCTGCGGGCATTGGAGATGGCTGTTTTTCAT 500
BSNT_04576___ 501 CTTTGGCACCTTGTCCCTGATCGGTGTCGCGGTGAGCTATTTCTTTCTTC 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 501 CTTTGGCACCTTGTCCCTGATCGGTGTCGCGGTGAGCTATTTCTTTCTTC 550
BSNT_04576___ 551 ATGACGAGCATCACGGGGCGTCGGATCAAGAACAGCCGCTTGATCATGCG 600
||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||.||||
BSU31130___yu 551 ATGATGAGCATCACGGAGCGGCGGATCAAGAACAGCCGCTTGATCGTGCG 600
BSNT_04576___ 601 GAAATTCTTTTATCTGTTTTCCTTGCCGCAGCCTCAGCGGTTTCATTCAT 650
|.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 601 GGAATTCTTTTATCTGTCTTCCTTGCCGCAGCCTCAGCGGTTTCATTCAT 650
BSNT_04576___ 651 TTTTCTGCAAAAATGGGGGCTGTCATCGGGTTATGTATGGATTGGTTTCG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 651 TTTTCTGCAAAAATGGGGGCTGTCATCGGGTTATGTATGGATTGGTTTCG 700
BSNT_04576___ 701 GGGTGACGTTATGTTTGCTCATTGGTCTATTGATTGTGGAATATAAAGTG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 701 GGGTGACGTTATGTTTGCTCATTGGTCTATTGATTGTGGAATATAAAGTG 750
BSNT_04576___ 751 AAAAACCCATTCATATCTATTAAACTGATGCTGCTGCCAAAACCGGTGCT 800
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 751 AAAAACCCCTTCATATCTATTAAACTGATGCTGCTGCCAAAACCGGTGCT 800
BSNT_04576___ 801 TGGCTTATTGATCATAGCTGCAGGGACGATAACGGTAGCTGTCAGCCTGT 850
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU31130___yu 801 CGGCTTATTGATCATAGCTGCAGGGACGATAACGGTAGCTGTCAGCCTTT 850
BSNT_04576___ 851 CTGCTTTTCAAGGCTTGCTCCGTCAAATGTATGATATTTCTCAGGAGCAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 851 CTGCTTTTCAAGGCTTGCTCCGTCAAATGTATGATATTTCTCAGGAGCAT 900
BSNT_04576___ 901 CTCATTCTTTTACACTTGACTCTTTTAATCGGAGTGGCGATCGCGGCCAT 950
||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 901 CTCATTCTTTTAAGCTTGACTCTTTTAATCGGAGTGGCGATCGCGGCCAT 950
BSNT_04576___ 951 TTTGAGCGCTCTGTTTTATGATAAAGTCGGACCAGGGATGCTCGGTATTA 1000
|||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 951 TTTGAGCGCTCTGTTATACGATAAAGTCGGACCAGGGATGCTCGGTATTA 1000
BSNT_04576___ 1001 TCGGCGGACTCATTCTCGTCTTTGTGAATTTTCAATGGCTGCATATGCAG 1050
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU31130___yu 1001 TCGGCGGACTCATTCTCGTTTTTGTGAATTTTCAATGGCTGCATATACAG 1050
BSNT_04576___ 1051 GATCGATCATCTCTTTATATGTTCGCGGCACTGTTTATCATGCTTGCAGC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1051 GATCGATCATCTCTTTATATGTTCGCGGCACTGTTTATCATGCTTGCAGC 1100
BSNT_04576___ 1101 GGGAACAGGCCTGACAGTCGCCGCAGGGCTGATGGGAGCTGCCATGGGAG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1101 GGGAACAGGCCTGACAGTCGCCGCAGGGCTGATGGGAGCTGCCATGGGAG 1150
BSNT_04576___ 1151 GCCCGCTGCCTGATTTGGTCAAGAGAATGACAGCTGTTCAGTTTTTAAGA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1151 GCCCGCTGCCTGATTTGGTCAAGAGAATGACAGCTGTTCAGTTTTTAAGA 1200
BSNT_04576___ 1201 TTGTTTGTCTATATGGGAGTTCCTATTCTCATCGGCTTTTTCACGAAAAA 1250
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1201 TTGTTTGTCTATATGGGAGTTCCCATTCTCATCGGCTTTTTCACGAAAAA 1250
BSNT_04576___ 1251 AGATGCTGCCAGACAAAGCGGTTCGGTACAGGATTCTATGATGACTGCTT 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1251 AGATGCTGCCAGACAAAGCGGTTCGGTACAGGATTCTATGATGACTGCTT 1300
BSNT_04576___ 1301 ATCATGATCTCTTCTTCATTTCTTTTATCCTTAGCGTGCTGCTCGTCTGC 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1301 ATCATGATCTCTTCTTCATTTCTTTTATCCTTAGCGTGCTGCTCGTCTGC 1350
BSNT_04576___ 1351 CTGTCATTTTGTATGAATGCCACTGGAATGGGGCACAAGCTGGCACATAA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1351 CTGTCATTTTGTATGAATGCCACTGGAATGGGGCACAAGCTGGCACATAA 1400
BSNT_04576___ 1401 ACCACATGATAAAGCGAAAACAGCTTCGGAAAAACCGGCCGTTTCAGCAG 1450
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.
BSU31130___yu 1401 ACCACATGATAAAGCGAAAACAGCTCCGGAAAAACCGGCCGTCTCAGCAC 1450
BSNT_04576___ 1451 AAGGTTTGTCGAAGGCAACTGTCAAATCTTATAAAGTAATAAATGATACG 1500
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1451 AAGGTTTGTCGAAGGCAACTGTCAAATCATATAAAGTAATAAATGATACG 1500
BSNT_04576___ 1501 GAATATCGTAATGCACTCAGAAATTTACAAAAATAG 1536
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU31130___yu 1501 GAATATCGGAATGCACTCAGAAATTTACAAAAATAG 1536
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.