Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_04642 and BSU31520

See Amino acid alignment / Visit BSNT_04642 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:24:31
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_04642___dcuS.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU31520___yufL.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_04642___dcuS-BSU31520___yufL.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04642___dcuS-BSU31520___yufL.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04642___dcuS
# 2: BSU31520___yufL
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1602
# Identity:    1596/1602 (99.6%)
# Similarity:  1596/1602 (99.6%)
# Gaps:           0/1602 ( 0.0%)
# Score: 7956.0
# 
#
#=======================================

BSNT_04642___      1 ATGAAAAAAACATTAAAACTGCAAACCAGACTCACCATATTTGTTTGTAT     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu      1 ATGAAAAAAACATTAAAACTGCAAACCAGACTCACCATATTTGTTTGTAT     50

BSNT_04642___     51 CGTTGTATTAATCGCATTGCTCATTACGTTTTTTACAGTCGGTGCCCAAA    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu     51 CGTTGTATTAATCGCATTGCTCATTACGTTTTTTACAGTCGGTGCCCAAA    100

BSNT_04642___    101 CCACCAAACGAATTAGAGATCAGGAAAAGGCCACTGCGCTGCAGACTGCT    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    101 CCACCAAACGAATTAGAGATCAGGAAAAGGCCACTGCGCTGCAGACTGCT    150

BSNT_04642___    151 GAAATGGTAGCTGAGGCGCCGATGACAGCCGCTGCTTTAGAAAGCGGAAA    200
                     ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    151 GAAATGGTAGCTGAAGCGCCGATGACAGCCGCTGCTTTAGAAAGCGGAAA    200

BSNT_04642___    201 AAAACAAAAGGAACTGCAGAGCTACACAAAGCGGGTTCAGAAAATTACCG    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    201 AAAACAAAAGGAACTGCAGAGCTACACAAAGCGGGTTCAGAAAATTACCG    250

BSNT_04642___    251 GCACGGAATTTGTTGTCGTCATGGATATGAACGGTATCCGCAAAACTCAT    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    251 GCACGGAATTTGTTGTCGTCATGGATATGAACGGTATCCGCAAAACTCAT    300

BSNT_04642___    301 CCTGACCCGAGCAAAATCGGAAAAAAATTCAGAGGCGGTGATGAGTCCGA    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    301 CCTGACCCGAGCAAAATCGGAAAAAAATTCAGAGGCGGTGATGAGTCCGA    350

BSNT_04642___    351 GGTATTAAAAGGGCATGTCCATATCAGCACAGCCTCTGGCACGCTCGGGA    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    351 GGTATTAAAAGGGCATGTCCATATCAGCACAGCCTCTGGCACGCTCGGGA    400

BSNT_04642___    401 AATCGCAGAGAGCGTTCGTCCCTGTCTACGCGGAGAATGGAAAACAGGTC    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    401 AATCGCAGAGAGCGTTCGTCCCTGTCTACGCGGAGAATGGAAAACAGGTC    450

BSNT_04642___    451 GGTGCAGTCGCGGTCGGCATCACCGTAAATGAAATTGATGAAGTGATCAG    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    451 GGTGCAGTCGCGGTCGGCATCACCGTAAATGAAATTGATGAAGTGATCAG    500

BSNT_04642___    501 CCATAGCTTACGGCCGCTTTACTTTATTATTTGCGTCAGCATCTTCGTCG    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    501 CCATAGCTTACGGCCGCTTTACTTTATTATTTGCGTCAGCATCTTCGTCG    550

BSNT_04642___    551 GTGTGATCGGAGCCGTTATCGTCGCCCGTACAGTGAAAAATATCATGTAC    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    551 GTGTGATCGGAGCCGTTATCGTCGCCCGTACAGTGAAAAATATCATGTAC    600

BSNT_04642___    601 GGACTTGAACCTTATGAAATTGCGACTCTGCTTGAAGAACGGAGCGCGAT    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    601 GGACTTGAACCTTATGAAATTGCGACTCTGCTTGAAGAACGGAGCGCGAT    650

BSNT_04642___    651 GCTGGAATCGACGAAGGAAGGAATACTCGCTGTCGATGAACATGGCAAAA    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    651 GCTGGAATCGACGAAGGAAGGAATACTCGCTGTCGATGAACATGGCAAAA    700

BSNT_04642___    701 TTAAACTTGCCAACGCGGAAGCAAAACACCTATTCGTCAAAATGGGCATC    750
                     |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    701 TTAAACTTGCCAACGCGGAAGCAAAACGCCTATTCGTCAAAATGGGCATC    750

BSNT_04642___    751 AACACAAATCCCATTGATCAGGATGTAGATGACATCTTGCCGAAAAGCCG    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    751 AACACAAATCCCATTGATCAGGATGTAGATGACATCTTGCCGAAAAGCCG    800

BSNT_04642___    801 CTTGAAAAAGGTCATTGAGACAAAAAAACCTCTTCAAGACAGAGACGTCC    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    801 CTTGAAAAAGGTCATTGAGACAAAAAAACCTCTTCAAGACAGAGACGTCC    850

BSNT_04642___    851 GCATTAACGGACTGGAGCTTGTGTTTAATGAAGTTCCTATCCAGCTGAAA    900
                     ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    851 GCATTAACGGGCTGGAGCTTGTGTTTAATGAAGTTCCTATCCAGCTGAAA    900

BSNT_04642___    901 GGACAAACTGTCGGAGCGATTGCAACATTCCGCGACAAGACCGAGGTAAA    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    901 GGACAAACTGTCGGAGCGATTGCAACATTCCGCGACAAGACCGAGGTAAA    950

BSNT_04642___    951 ACATTTAGCTGAACAGCTTTCCGGTGTTAAAATGTATGCAAACGCACTGA   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu    951 ACATTTAGCTGAACAGCTTTCCGGTGTTAAAATGTATGCAAACGCACTGA   1000

BSNT_04642___   1001 GAGCGCAGTCTCATGAATTTATGAACAAACTGCATGTGATATTAGGTCTC   1050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1001 GAGCGCAGTCTCATGAATTTATGAACAAACTGCATGTGATATTAGGTCTC   1050

BSNT_04642___   1051 GTCCAGCTGAAAGAGTATGATGATCTTGGAGATTATATTAAAGATATAGC   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1051 GTCCAGCTGAAAGAGTATGATGATCTTGGAGATTATATTAAAGATATAGC   1100

BSNT_04642___   1101 CATACAGCAAAAATCAGAAACAAGTGAAATTATAAATGATGTCAAAAGCT   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1101 CATACAGCAAAAATCAGAAACAAGTGAAATTATAAATGATGTCAAAAGCT   1150

BSNT_04642___   1151 CCGTACTGGCCGGTTTTCTGCTCGGAAAGCAAAGCTTTATACGTGAGCAG   1200
                     ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1151 CCGTACTGGCCGGTTTTCTGCTTGGAAAGCAAAGCTTTATACGTGAGCAG   1200

BSNT_04642___   1201 GGCGCAAATCTTGATATTGAATGCAACGGTGTCATCCCGAACGCGGCAGA   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1201 GGCGCAAATCTTGATATTGAATGCAACGGTGTCATCCCGAACGCGGCAGA   1250

BSNT_04642___   1251 CCCTTCTGTCATCCATGAACTTATTACAATCATCGGAAATCTCATCAACA   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1251 CCCTTCTGTCATCCATGAACTTATTACAATCATCGGAAATCTCATCAACA   1300

BSNT_04642___   1301 ATGGCTTAGACGCCGTTGCGGATATGCCGAAAAAACAAATCACCATGTCC   1350
                     ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1301 ATGGCTTAGATGCCGTTGCCGATATGCCGAAAAAACAAATCACCATGTCC   1350

BSNT_04642___   1351 ATGCGCTTCCATAACAGCATACTTGATATTGAAATTACCGATACTGGAGC   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1351 ATGCGCTTCCATAACAGCATACTTGATATTGAAATTACCGATACTGGAGC   1400

BSNT_04642___   1401 AGGCATGTCTGAAGAAGACCAAGCCAAAGTATTTGAACAAGGCTATTCAA   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1401 AGGCATGTCTGAAGAAGACCAAGCCAAAGTATTTGAACAAGGCTATTCAA   1450

BSNT_04642___   1451 CAAAGGGCAAAAACCGGGGATTCGGCCTTTATTTCACACAGCAAAGCATC   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1451 CAAAGGGCAAAAACCGGGGATTCGGCCTTTATTTCACACAGCAAAGCATC   1500

BSNT_04642___   1501 GAAAATTTAAAAGGCCAAATGATCCTCACAAGCGAAAAGAATGAAGGAAC   1550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1501 GAAAATTTAAAAGGCCAAATGATCCTCACAAGCGAAAAGAATGAAGGAAC   1550

BSNT_04642___   1551 GACATTCAGTATTCGCATCCCGTACGAACCGAAGGAGGAAAATCATGATT   1600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu   1551 GACATTCAGTATTCGCATCCCGTACGAACCGAAGGAGGAAAATCATGATT   1600

BSNT_04642___   1601 AA   1602
                     ||
BSU31520___yu   1601 AA   1602


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.