Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_05348 and BSU35160

See Amino acid alignment / Visit BSNT_05348 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:26:07
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_05348___uvrA.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU35160___uvrA.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_05348___uvrA-BSU35160___uvrA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05348___uvrA-BSU35160___uvrA.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05348___uvrA
# 2: BSU35160___uvrA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2874
# Identity:    2841/2874 (98.9%)
# Similarity:  2841/2874 (98.9%)
# Gaps:           0/2874 ( 0.0%)
# Score: 14073.0
# 
#
#=======================================

BSNT_05348___      1 ATGGCTATGGATCGGATAGAGGTGAAGGGAGCCAGGGCGCATAACCTGAA     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv      1 ATGGCTATGGATCGGATAGAGGTGAAGGGAGCCAGGGCGCATAACCTGAA     50

BSNT_05348___     51 AAATATAGATGTGACGATTCCGAGAGATCAGCTTGTCGTTGTCACGGGTT    100
                     ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv     51 AAATATAGATGTAACGATTCCGAGAGATCAGCTTGTCGTTGTCACGGGTT    100

BSNT_05348___    101 TGTCCGGATCAGGTAAATCCTCCCTTGCCTTTGACACGATATATGCTGAA    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    101 TGTCCGGATCAGGTAAATCCTCCCTTGCCTTTGACACGATATATGCTGAA    150

BSNT_05348___    151 GGACAGAGACGGTATGTCGAGTCGCTGTCTGCCTATGCCCGCCAGTTTTT    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    151 GGACAGAGACGGTATGTCGAGTCGCTGTCTGCCTATGCCCGCCAGTTTTT    200

BSNT_05348___    201 AGGGCAAATGGATAAGCCGGATGTGGATGCAATTGAGGGGCTCTCTCCCG    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    201 AGGGCAAATGGATAAGCCGGATGTGGATGCAATTGAGGGGCTCTCTCCCG    250

BSNT_05348___    251 CCATCAGCATTGATCAGAAAACAACGAGCCGCAATCCGAGGTCTACTGTC    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    251 CCATCAGCATTGATCAGAAAACAACGAGCCGCAATCCGAGGTCTACTGTC    300

BSNT_05348___    301 GGTACGGTAACTGAGATTTATGATTATCTGCGTCTTTTATATGCGAGAGT    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    301 GGTACGGTAACTGAGATTTATGATTATCTGCGTCTTTTATATGCGAGAGT    350

BSNT_05348___    351 AGGGAAGCCTCATTGTCCGGAACACGGAATTGAGATTACATCCCAGACCA    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    351 AGGGAAGCCTCATTGTCCGGAACACGGAATTGAGATTACATCCCAGACCA    400

BSNT_05348___    401 TCGAGCAAATGGTGGACAGAATTCTGGAATACCCGGAACGGACGAAGCTT    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    401 TCGAGCAAATGGTGGACAGAATTCTGGAATACCCGGAACGGACGAAGCTT    450

BSNT_05348___    451 CAGGTGCTGGCGCCGATTGTATCGGGCCGAAAAGGCGCTCATGTCAAAGT    500
                     ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    451 CAGGTGCTGGCGCCGATTGTCTCGGGCCGAAAAGGCGCTCATGTCAAAGT    500

BSNT_05348___    501 GCTTGAACAGATTAGGAAACAAGGCTATGTCAGAGTCAGAATTGACGGCG    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    501 GCTTGAACAGATTAGGAAACAAGGCTATGTCAGAGTCAGAATTGACGGCG    550

BSNT_05348___    551 AGATGGCTGAGCTTTCCGACGATATCGAATTAGAAAAGAACAAGAAGCAT    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    551 AGATGGCTGAGCTTTCCGACGATATCGAATTAGAAAAGAACAAGAAGCAT    600

BSNT_05348___    601 TCCATTGAGGTAGTCATTGACCGGATTGTCGTGAAAGAAGGCGTGGCAGC    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    601 TCCATTGAGGTAGTCATTGACCGGATTGTCGTGAAAGAAGGCGTGGCAGC    650

BSNT_05348___    651 CCGGCTGTCAGATTCATTGGAAACGGCGCTTCGTTTAAGTGAAGGACGGG    700
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU35160___uv    651 CCGGCTGTCAGATTCATTGGAAACGGCGCTTCGTTTAGGTGAAGGACGGG    700

BSNT_05348___    701 TTATGATCGATGTCATCGGTGAGGAAGAGCTGATGTTCAGCGAGCATCAT    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    701 TTATGATCGATGTCATCGGTGAGGAAGAGCTGATGTTCAGCGAGCATCAT    750

BSNT_05348___    751 GCCTGTCCGCACTGCGGATTTTCAATTGGTGAACTTGAGCCGCGTCTGTT    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU35160___uv    751 GCCTGTCCGCACTGCGGATTTTCAATTGGTGAGCTTGAGCCGCGTCTGTT    800

BSNT_05348___    801 TTCGTTTAACAGTCCGTTCGGGGCGTGTCCGACGTGTGACGGTCTCGGAA    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    801 TTCGTTTAACAGTCCGTTCGGGGCGTGTCCGACGTGTGACGGTCTCGGAA    850

BSNT_05348___    851 TGAAGCTTGAAGTGGATGCCGATCTTGTCATCCCCAATCAAGATTTGTCA    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    851 TGAAGCTTGAAGTGGATGCCGATCTTGTCATCCCCAATCAAGATTTGTCA    900

BSNT_05348___    901 TTGAAGGAGAATGCGGTCGCCCCTTGGACACCGATCAGCTCACAATATTA    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    901 TTGAAGGAGAATGCGGTCGCCCCTTGGACACCGATCAGCTCACAATATTA    950

BSNT_05348___    951 TCCTCAGCTGCTTGAGGCAGCCTGCACCCACTACGGGATTGATATGGATG   1000
                     ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv    951 TCCTCAGCTGCTTGAGGCAGTCTGCACCCACTACGGGATTGATATGGATG   1000

BSNT_05348___   1001 TGCCGGTCAAAGATTTGCCGAAGCATCAACTGGATAAAGTGCTGTACGGC   1050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1001 TGCCGGTCAAAGATTTGCCGAAGCATCAACTGGATAAAGTGCTGTACGGC   1050

BSNT_05348___   1051 AGCGGAGATGACCTGATTTATTTCAGATATGAAAATGATTTTGGACAAAT   1100
                     |||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1051 AGCGGGGATGACCTGATTTATTTCCGATATGAAAATGATTTTGGACAAAT   1100

BSNT_05348___   1101 CCGTGAAGGTGAAATTCAATTTGAAGGCGTATTGCGCAACATTGAAAGAC   1150
                     |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1101 CCGCGAAGGTGAAATTCAATTTGAAGGCGTATTGCGCAACATTGAAAGAC   1150

BSNT_05348___   1151 GCTATAAGGAGACAGGCTCTGATTTCATCCGTGAGCAGATGGAGCAGTAT   1200
                     |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
BSU35160___uv   1151 GCTATAAGGAGACAGGCTCCGATTTCATACGTGAGCAAATGGAGCAGTAT   1200

BSNT_05348___   1201 ATGTCTCAGAAGTCTTGTCCGACGTGCAAAGGCTATCGGTTAAAGAAAGA   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1201 ATGTCTCAGAAGTCTTGTCCGACGTGCAAAGGCTATCGGTTAAAGAAAGA   1250

BSNT_05348___   1251 GGCGCTTGCCGTACTGATTGACGGCCGCCACATCGGAAAAATTACCGAGC   1300
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
BSU35160___uv   1251 GGCGCTTGCCGTACTGATTGACGGCCGCCACATTGGGAAAATTACCGAGC   1300

BSNT_05348___   1301 TGTCTGTCGCCGACGCACTTGCCTTCTTTAAAAACCTTACCCTTTCTGAG   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||
BSU35160___uv   1301 TGTCTGTCGCCGACGCACTTGCCTTCTTTAAAGATCTTACCCTTTCTGAG   1350

BSNT_05348___   1351 AAGGATATGCAGATCGCCAATTTGATTTTGCGCGAAATTGTGGAGCGCTT   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1351 AAGGATATGCAGATCGCCAATTTGATTTTGCGCGAAATTGTGGAGCGCTT   1400

BSNT_05348___   1401 AAGCTTTCTGGACAAAGTCGGCCTCGATTACCTGACATTGAGCAGGGCAG   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1401 AAGCTTTCTGGACAAAGTCGGCCTCGATTACCTGACATTGAGCAGGGCAG   1450

BSNT_05348___   1451 CGGGTACATTGTCCGGGGGAGAGGCGCAGCGCATCAGGCTGGCGACTCAA   1500
                     ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1451 CGGGTACATTGTCCGGAGGAGAGGCGCAGCGCATCAGGCTGGCGACTCAA   1500

BSNT_05348___   1501 ATTGGCTCGCGCTTATCCGGTGTGCTTTATATTTTAGATGAGCCGTCTAT   1550
                     |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1501 ATTGGCTCGCGTTTATCCGGTGTGCTTTATATTTTAGATGAGCCGTCTAT   1550

BSNT_05348___   1551 CGGTCTGCATCAGCGTGATAACGACCGCTTGATCAGCGCTCTGAAAAATA   1600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1551 CGGTCTGCATCAGCGTGATAACGACCGCTTGATCAGCGCTCTGAAAAATA   1600

BSNT_05348___   1601 TGAGAGACCTCGGGAACACGCTGATTGTTGTCGAACATGATGAGGACACG   1650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1601 TGAGAGACCTCGGGAACACGCTGATTGTTGTCGAACATGATGAGGACACG   1650

BSNT_05348___   1651 ATGATGGCAGCAGATTATTTAATAGATATTGGACCGGGAGCCGGTATTCA   1700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU35160___uv   1651 ATGATGGCAGCAGATTATTTAATAGATATTGGACCGGGAGCCGGCATTCA   1700

BSNT_05348___   1701 CGGCGGACAGGTGATATCTGCGGGTACGCCGGAAGAAGTGATGGAAGATC   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1701 CGGCGGACAGGTGATATCTGCGGGTACGCCGGAAGAAGTGATGGAAGATC   1750

BSNT_05348___   1751 CAAACTCATTAACGGGCAGCTATTTATCAGGGGAAAAGTTTATCCCATTG   1800
                     ||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU35160___uv   1751 CAAATTCATTAACGGGCAGCTATTTATCAGGGAAAAAGTTTATCCCATTG   1800

BSNT_05348___   1801 CCTCCTGAAAGAAGAAAGCCGGACGGACGTTACATTGAAATTAAAGGTGC   1850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1801 CCTCCTGAAAGAAGAAAGCCGGACGGACGTTACATTGAAATTAAAGGTGC   1850

BSNT_05348___   1851 TTCAGAAAACAACTTGAAAAAAGTGAATGCCAAGTTCCCGCTTGGGACGT   1900
                     .||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1851 ATCAGAAAACAACCTGAAAAAAGTGAATGCCAAGTTCCCGCTTGGGACGT   1900

BSNT_05348___   1901 TTACAGCAGTTACAGGTGTTTCCGGTTCAGGGAAGAGTACACTCGTTAAT   1950
                     |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1901 TTACAGCAGTTACAGGTGTTTCCGGTTCAGGAAAGAGTACACTCGTTAAT   1950

BSNT_05348___   1951 GAAATTTTGCATAAGGCGCTGGCGCAAAAGCTTCATAAAGCGAAAGCGAA   2000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   1951 GAAATTTTGCATAAGGCGCTGGCGCAAAAGCTTCATAAAGCGAAAGCGAA   2000

BSNT_05348___   2001 GCCCGGCAGCCATAAAGAGATTAAAGGTTTGGATCATTTAGACAAAGTCA   2050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU35160___uv   2001 GCCCGGCAGCCATAAAGAGATTAAAGGTTTGGATCATTTAGATAAAGTCA   2050

BSNT_05348___   2051 TTGACATTGACCAGGCGCCAATTGGAAGAACGCCGAGATCCAACCCTGCG   2100
                     ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2051 TTGACATTGACCAGGCGCCAATCGGAAGAACGCCGAGATCCAACCCTGCG   2100

BSNT_05348___   2101 ACATACACCGGTGTATTTGATGACATTCGTGATGTATTCGCGCAGACAAA   2150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2101 ACATACACCGGTGTATTTGATGACATTCGTGATGTATTCGCGCAGACAAA   2150

BSNT_05348___   2151 TGAAGCGAAGGTCCGCGGCTATAAAAAAGGCCGTTTCAGCTTCAACGTGA   2200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2151 TGAAGCGAAGGTCCGCGGCTATAAAAAAGGCCGTTTCAGCTTCAACGTGA   2200

BSNT_05348___   2201 AGGGCGGACGATGTGAAGCCTGCCGCGGAGACGGGATTATTAAAATTGAA   2250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2201 AGGGCGGACGATGTGAAGCCTGCCGCGGAGACGGGATTATTAAAATTGAA   2250

BSNT_05348___   2251 ATGCACTTCCTTCCTGACGTATACGTTCCATGCGAGGTGTGTCACGGCAA   2300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2251 ATGCACTTCCTTCCTGACGTATACGTTCCATGCGAGGTGTGTCACGGCAA   2300

BSNT_05348___   2301 ACGCTATAACCGTGAAACGCTTGAAGTGACGTACAAAGGAAAAAGCATCT   2350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2301 ACGCTATAACCGTGAAACGCTTGAAGTGACGTACAAAGGAAAAAGCATCT   2350

BSNT_05348___   2351 CTGATGTGCTTGATATGACGGTTGAAGATGCTCTTCCTTTCTTTGAAAAT   2400
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU35160___uv   2351 CTGATGTGCTTGATATGACGGTTGAAGATGCTCTTTCTTTCTTTGAAAAT   2400

BSNT_05348___   2401 ATCCCGAAAATCAAACGCAAGCTCCAAACCCTTTATGATGTTGGTTTAGG   2450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2401 ATCCCGAAAATCAAACGCAAGCTCCAAACCCTTTATGATGTTGGTTTAGG   2450

BSNT_05348___   2451 TTATATTACGCTCGGCCAGCCGGCGACGACCTTGTCAGGCGGAGAAGCGC   2500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2451 TTATATTACGCTCGGCCAGCCGGCGACGACCTTGTCAGGCGGAGAAGCGC   2500

BSNT_05348___   2501 AGCGCGTGAAGCTCGCGTCAGAGCTGCACAAACGCTCGACCGGACGCACG   2550
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
BSU35160___uv   2501 AGCGCGTGAAGCTCGCGTCAGAGCTGCACAAACGCTCAACCGGACGTACG   2550

BSNT_05348___   2551 CTCTACATTTTAGATGAGCCGACGACAGGTTTGCATGTCGACGATATCGC   2600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2551 CTCTACATTTTAGATGAGCCGACGACAGGTTTGCATGTCGACGATATCGC   2600

BSNT_05348___   2601 CAGGCTTCTTGTCGTGCTGCAACGGTTGGTAGACAACGGAGACACTGTAC   2650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2601 CAGGCTTCTTGTCGTGCTGCAACGGTTGGTAGACAACGGAGACACTGTAC   2650

BSNT_05348___   2651 TGGTTATTGAGCACAACCTTGATATCATTAAGACGGCCGATTACATTGTG   2700
                     ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2651 TGGTTATTGAGCACAATCTTGATATCATTAAGACGGCCGATTACATTGTG   2700

BSNT_05348___   2701 GATTTGGGCCCGGAAGGCGGAGCCGGGGGCGGAACCATTGTCGCGTCTGG   2750
                     ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2701 GATTTGGGCCCGGAAGGCGGAGCCGGAGGCGGAACCATTGTCGCGTCTGG   2750

BSNT_05348___   2751 AACGCCTGAGGAAATCACTGAAGTTGAAGAATCGTATACAGGCCGTTATT   2800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2751 AACGCCTGAGGAAATCACTGAAGTTGAAGAATCGTATACAGGCCGTTATT   2800

BSNT_05348___   2801 TGAAGCCTGTTATCGAACGTGACAAAGCACGCATGAAATCGCTCTTGAAA   2850
                     |.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2801 TAAAGCCTGTTATCGAACGTGACAAAACACGCATGAAATCGCTCTTGAAA   2850

BSNT_05348___   2851 GCGAAAGAAACAGCTACATCTTAA   2874
                     ||.|||||||||||||||||||||
BSU35160___uv   2851 GCAAAAGAAACAGCTACATCTTAA   2874


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.