Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_05370 and BSU35300

See Amino acid alignment / Visit BSNT_05370 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:26:11
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_05370___secA.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU35300___secA.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_05370___secA-BSU35300___secA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05370___secA-BSU35300___secA.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05370___secA
# 2: BSU35300___secA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2526
# Identity:    2492/2526 (98.7%)
# Similarity:  2492/2526 (98.7%)
# Gaps:           0/2526 ( 0.0%)
# Score: 12324.0
# 
#
#=======================================

BSNT_05370___      1 ATGCTTGGAATTTTAAATAAAATGTTTGATCCAACAAAACGTACGCTGAA     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se      1 ATGCTTGGAATTTTAAATAAAATGTTTGATCCAACAAAACGTACGCTGAA     50

BSNT_05370___     51 TAGATACGAAAAAATTGCTAACGATATTGATGCGATTCGCGGAGACTATG    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se     51 TAGATACGAAAAAATTGCTAACGATATTGATGCGATTCGCGGAGACTATG    100

BSNT_05370___    101 AAAATCTCTCTGACGACGCGTTGAAACATAAAACAATTGAATTTAAAGAG    150
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    101 AAAATCTCTCTGACGACGCATTGAAACATAAAACAATTGAATTTAAAGAG    150

BSNT_05370___    151 CGTCTTGAAAAAGGGGCGACAACGGATGATCTTCTTGTTGAAGCTTTCGC    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    151 CGTCTTGAAAAAGGGGCGACAACGGATGATCTTCTTGTTGAAGCTTTCGC    200

BSNT_05370___    201 TGTTGTTCGAGAAGCTTCACGCCGCGTAACAGGTATGTTTCCGTTTAAAG    250
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU35300___se    201 TGTTGTTCGAGAAGCTTCACGCCGCGTAACAGGCATGTTTCCGTTTAAAG    250

BSNT_05370___    251 TCCAGCTCATGGGGGGCGTAGCGCTTCATGACGGAAATATCGCGGAAATG    300
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU35300___se    251 TCCAGCTCATGGGGGGCGTGGCGCTTCATGACGGAAATATAGCGGAAATG    300

BSNT_05370___    301 AAAACAGGGGAAGGGAAAACATTAACGTCTACTCTGCCTGTTTATTTAAA    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU35300___se    301 AAAACAGGGGAAGGGAAAACATTAACGTCTACCCTGCCTGTTTATTTAAA    350

BSNT_05370___    351 TGCGTTAACAGGTAAAGGCGTACACGTCGTGACTGTCAACGAATACTTGG    400
                     |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    351 TGCGTTAACCGGTAAAGGCGTACACGTCGTGACTGTCAACGAATACTTGG    400

BSNT_05370___    401 CAAGCCGTGACGCTGAACAAATGGGGAAAATTTTCGAGTTTCTCGGTCTG    450
                     ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU35300___se    401 CAAGCCGTGACGCTGAGCAAATGGGGAAAATTTTCGAGTTTCTCGGTTTG    450

BSNT_05370___    451 ACTGTCGGCTTGAATTTAAACTCAATGTCAAAAGACGAAAAACGGGAAGC    500
                     ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    451 ACTGTCGGTTTGAATTTAAACTCAATGTCAAAAGACGAAAAACGGGAAGC    500

BSNT_05370___    501 TTATGCAGCTGACATTACTTACTCTACAAACAATGAGCTTGGCTTCGACT    550
                     ||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
BSU35300___se    501 TTATGCCGCTGATATTACTTACTCCACAAACAACGAGCTTGGCTTCGACT    550

BSNT_05370___    551 ATTTGCGTGACAATATGGTTCTTTATAAAGAGCAGATGGTTCAGCGCCCG    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    551 ATTTGCGTGACAATATGGTTCTTTATAAAGAGCAGATGGTTCAGCGCCCG    600

BSNT_05370___    601 CTTCATTTTGCGGTAATAGATGAAGTTGACTCTATTTTAATTGATGAAGC    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    601 CTTCATTTTGCGGTAATAGATGAAGTTGACTCTATTTTAATTGATGAAGC    650

BSNT_05370___    651 GAGAACACCTCTTATCATTTCTGGACAAGCTGCCAAATCCACTAAGCTGT    700
                     .||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU35300___se    651 AAGAACACCGCTTATCATTTCTGGACAAGCTGCAAAATCCACTAAGCTGT    700

BSNT_05370___    701 ACGTACAGGCAAATGCTTTTGTCCGTACGTTAAAAGCGGAGAAGGATTAC    750
                     |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    701 ACGTACAGGCAAATGCTTTTGTCCGCACGTTAAAAGCGGAGAAGGATTAC    750

BSNT_05370___    751 ACGTACGATATCAAAACAAAAGCTGTACAGCTTACTGAAGAAGGAATGAC    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    751 ACGTACGATATCAAAACAAAAGCTGTACAGCTTACTGAAGAAGGAATGAC    800

BSNT_05370___    801 GAAGGCGGAAAAAGCGTTCGGCATCGATAACCTCTTTGATGTGAAGCATG    850
                     |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    801 GAAGGCGGAAAAAGCATTCGGCATCGATAACCTCTTTGATGTGAAGCATG    850

BSNT_05370___    851 TCGCGCTCAACCACCATATCAACCAGGCCTTAAAAGCTCACGTTGCGATG    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    851 TCGCGCTCAACCACCATATCAACCAGGCCTTAAAAGCTCACGTTGCGATG    900

BSNT_05370___    901 CAAAAGGACGTTGACTATGTAGTGGAAGACGGACAGGTTGTTATTGTTGA    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    901 CAAAAGGACGTTGACTATGTAGTGGAAGACGGACAGGTTGTTATTGTTGA    950

BSNT_05370___    951 TTCCTTCACGGGACGTCTGATGAAAGGCCGCCGCTACAGTGAGGGGCTTC   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se    951 TTCCTTCACGGGACGTCTGATGAAAGGCCGCCGCTACAGTGAGGGGCTTC   1000

BSNT_05370___   1001 ACCAAGCGATTGAAGCGAAGGAAGGGCTTGAGATTCAAAACGAAAGCATG   1050
                     ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1001 ACCAAGCGATTGAAGCAAAGGAAGGGCTTGAGATTCAAAACGAAAGCATG   1050

BSNT_05370___   1051 ACCTTGGCGACGATTACGTTCCAAAACTACTTCCGAATGTACCAAAAACT   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU35300___se   1051 ACCTTGGCGACGATTACGTTCCAAAACTACTTCCGAATGTACGAAAAACT   1100

BSNT_05370___   1101 TGCCGGTATGACGGGTACAGCTAAGACAGAGGAAGAAGAATTCCGCAACA   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1101 TGCCGGTATGACGGGTACAGCTAAGACAGAGGAAGAAGAATTCCGCAACA   1150

BSNT_05370___   1151 TCTACAACATGCAGGTTGTCACGATCCCTACCAACAGGCCTGTTGTCCGT   1200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1151 TCTACAACATGCAGGTTGTCACGATCCCTACCAACAGGCCTGTTGTCCGT   1200

BSNT_05370___   1201 GATGACCGTCCTGATTTAATTTACCGCACGATGGAAGGAAAGTTTAAGGC   1250
                     ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1201 GATGACCGCCCGGATTTAATTTACCGCACGATGGAAGGAAAGTTTAAGGC   1250

BSNT_05370___   1251 AGTTGCGGAGGATGTCGCACAGCGTTACATGACGGGACAGCCTGTTCTAG   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1251 AGTTGCGGAGGATGTCGCACAGCGTTACATGACGGGACAGCCTGTTCTAG   1300

BSNT_05370___   1301 TCGGTACGGTTGCCGTTGAAACATCTGAATTGATTTCTAAGCTGCTTAAA   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1301 TCGGTACGGTTGCCGTTGAAACATCTGAATTGATTTCTAAGCTGCTTAAA   1350

BSNT_05370___   1351 AACAAAGGAATTCCGCATCAAGTGTTAAATGCCAAAAACCATGAACGTGA   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1351 AACAAAGGAATTCCGCATCAAGTGTTAAATGCCAAAAACCATGAACGTGA   1400

BSNT_05370___   1401 AGCGCAGATCATTGAAGAGGCCGGCCAAAAAGGCGCAGTTACGATTGCGA   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1401 AGCGCAGATCATTGAAGAGGCCGGCCAAAAAGGCGCAGTTACGATTGCGA   1450

BSNT_05370___   1451 CTAACATGGCGGGGCGCGGAACGGACATTAAGCTTGGCGAAGGTGTAAAA   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1451 CTAACATGGCGGGGCGCGGAACGGACATTAAGCTTGGCGAAGGTGTAAAA   1500

BSNT_05370___   1501 GAGCTTGGCGGACTCGCTGTTGTCGGAACAGAACGACATGAATCACGCCG   1550
                     |||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1501 GAGCTTGGCGGGCTCGCTGTAGTCGGAACAGAACGACATGAATCACGCCG   1550

BSNT_05370___   1551 GATTGACAATCAGCTTCGAGGTCGTTCCGGACGTCAGGGAGACCCGGGGA   1600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1551 GATTGACAATCAGCTTCGAGGTCGTTCCGGACGTCAGGGAGACCCGGGGA   1600

BSNT_05370___   1601 TTACTCAATTTTATCTTTCTATGGAAGATGAATTGATGCGCAGATTCGGA   1650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1601 TTACTCAATTTTATCTTTCTATGGAAGATGAATTGATGCGCAGATTCGGA   1650

BSNT_05370___   1651 GCTGAGCGGACAATGGCGATGCTGGACCGCTTCGGCATGGACGACTCTAC   1700
                     |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1651 GCTGAGCGGACAATGGCGATGCTTGACCGCTTCGGCATGGACGACTCTAC   1700

BSNT_05370___   1701 TCCAATCCAAAGCAAAATGGTATCTCGCGCGGTTGAATCGTCTCAAAAAC   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1701 TCCAATCCAAAGCAAAATGGTATCTCGCGCGGTTGAATCGTCTCAAAAAC   1750

BSNT_05370___   1751 GAGTCGAAGGCAATAACTTCGATTCTCGTAAACAGCTTCTGCAATATGAT   1800
                     |.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1751 GCGTCGAAGGCAATAACTTCGATTCGCGTAAACAGCTTCTGCAATATGAT   1800

BSNT_05370___   1801 GATGTTCTCCGCCAGCAGCGTGAGGTCATTTATAAGCAGCGCTTTGAAGT   1850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1801 GATGTTCTCCGCCAGCAGCGTGAGGTCATTTATAAGCAGCGCTTTGAAGT   1850

BSNT_05370___   1851 CATTGACTCTGAAAACCTGCGTGAAATCGTTGAAAATATGATCAAGTCTT   1900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1851 CATTGACTCTGAAAACCTGCGTGAAATCGTTGAAAATATGATCAAGTCTT   1900

BSNT_05370___   1901 CTCTCGAACGCGCAATTGCAGCCTATACGCCAAGAGAAGAGCTTCCTGAG   1950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1901 CTCTCGAACGCGCAATTGCAGCCTATACGCCAAGAGAAGAGCTTCCTGAG   1950

BSNT_05370___   1951 GAGTGGAAGCTTGACGGTCTAGTTGATCTTATCAACACAACTTATCTTGA   2000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   1951 GAGTGGAAGCTTGACGGTCTAGTTGATCTTATCAACACAACTTATCTTGA   2000

BSNT_05370___   2001 TGAAGGTGCGCTTGAGAAGAGCGATATCTTCGGGAAAGAACCGGATGAAA   2050
                     |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU35300___se   2001 TGAAGGTGCACTTGAGAAGAGCGATATCTTCGGCAAAGAACCGGATGAAA   2050

BSNT_05370___   2051 TGCTTGAGCTCATTATGGATCGCATCATCACAAAATATAATGAGAAGGAA   2100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   2051 TGCTTGAGCTCATTATGGATCGCATCATCACAAAATATAATGAGAAGGAA   2100

BSNT_05370___   2101 GAGCAATTCGGCAAAGAGCAAATGCGCGAATTCGAAAAAGTTATCGTTCT   2150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   2101 GAGCAATTCGGCAAAGAGCAAATGCGCGAATTCGAAAAAGTTATCGTTCT   2150

BSNT_05370___   2151 TCGTGCCGTTGATTCTAAATGGATGGATCATATTGATGCGATGGATCAGC   2200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   2151 TCGTGCCGTTGATTCTAAATGGATGGATCATATTGATGCGATGGATCAGC   2200

BSNT_05370___   2201 TTCGCCAAGGGATTCACCTTCGTGCTTACGCGCAGACGAACCCTCTTCGT   2250
                     |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU35300___se   2201 TCCGCCAAGGGATTCACCTTCGTGCTTACGCGCAGACGAACCCGCTTCGT   2250

BSNT_05370___   2251 GAGTATCAAATGGAAGGTTTTGCGATGTTTGAGCATATGATTGAATCAAT   2300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   2251 GAGTATCAAATGGAAGGTTTTGCGATGTTTGAGCATATGATTGAATCAAT   2300

BSNT_05370___   2301 TGAGGACGAGGTCGCAAAATTTGTGATGAAAGCTGAGATTGAAAACAATC   2350
                     |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   2301 TGAGGACGAAGTCGCAAAATTTGTGATGAAAGCTGAGATTGAAAACAATC   2350

BSNT_05370___   2351 TGGAGCGTGAAGAGGTTGTACAAGGCCAAACAACAGCTCATCAGCCGCAA   2400
                     |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   2351 TGGAGCGTGAAGAGGTTGTACAAGGTCAAACAACAGCTCATCAGCCGCAA   2400

BSNT_05370___   2401 GAAGGCGACGATAACAAAAAAGCAAAGAAAGCACCGGTTCGCAAAGTGGT   2450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   2401 GAAGGCGACGATAACAAAAAAGCAAAGAAAGCACCGGTTCGCAAAGTGGT   2450

BSNT_05370___   2451 TGATATCGGCCGAAATGCCCCATGCCACTGCGGAAGCGGGAAAAAATATA   2500
                     |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   2451 TGATATCGGACGAAATGCCCCATGCCACTGCGGAAGCGGGAAAAAATATA   2500

BSNT_05370___   2501 AAAATTGCTGCGGCCGTACTGAATAG   2526
                     ||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se   2501 AAAATTGCTGCGGCCGTACTGAATAG   2526


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.