Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_05537 and BSU36280
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_05537 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:26:31
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_05537___ywqA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU36280___ywqA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_05537___ywqA-BSU36280___ywqA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05537___ywqA-BSU36280___ywqA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05537___ywqA
# 2: BSU36280___ywqA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2769
# Identity: 2726/2769 (98.4%)
# Similarity: 2726/2769 (98.4%)
# Gaps: 0/2769 ( 0.0%)
# Score: 13458.0
#
#
#=======================================
BSNT_05537___ 1 ATGGCGAGTCTTAAAGAAATTCTCATCCACGTCGAACAAATGGAAGATGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1 ATGGCGAGTCTTAAAGAAATTCTCATCCACGTCGAACAAATGGAAGATGG 50
BSNT_05537___ 51 GTCATTTACGCTCTCAGCCTTTGATGAGAATGAGCAGCCTCTTCCCTACA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 51 GTCATTTACGCTCTCAGCCTTTGATGAGAATGAGCAGCCTCTTCCCTACA 100
BSNT_05537___ 101 ACCATATGAAAAAGCATTTGTTCCAATGGCATGAATCCTCATTTTACGGA 150
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 101 GCCATATGAAAAAGCATTTGTTCCAATGGCATGAATCCTCATTTTACGGA 150
BSNT_05537___ 151 ACCTTTCTAGAGGATGTCAGCTTCATCGGGACGACTGCTGTCCTGCTATC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU36280___yw 151 ACCTTTCTAGAGGATGTCAGCTTCATCGGGACGACTGCTGTCCTTCTATC 200
BSNT_05537___ 201 TCCATGGATGACTGTAGAGCTTCTCGGCAAAAACTCGTTCAACTCATTCA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 201 TCCATGGATGACTGTAGAGCTTCTCGGCAAAAACTCGTTCAACTCATTCA 250
BSNT_05537___ 251 GCTCCGTGCAGCTTACAGAAGAAACAGAGCCGCTGATCGAGGCGGCCTCG 300
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
BSU36280___yw 251 GCTCCGTGCAGCTTACAGAAGAAACGGAGCCGCTGATCGAGGCGGCATCG 300
BSNT_05537___ 301 ACCATCTATGAATTTATCGCGGACGGCGATTTTCTGCCTGACTATGACGC 350
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU36280___yw 301 ACCATCTATGAATTTATCGCGGACGGCGATTTTATGCCTGACTATGACGC 350
BSNT_05537___ 351 ATGGACAAACGGTGTTTTTCGCTGGAAGGACCGCGATAATATACTGGAGG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU36280___yw 351 ATGGACAAACGGTGTTTTTCGCTGGAAGGACCGCGATAATATACTGGAAG 400
BSNT_05537___ 401 GCTTTACTGCGGAATGGTTTTCCGCTGCCGTACAGGATTACATCCAATAC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU36280___yw 401 GCTTTACTGCGGAATGGTTTTCCGCTGCCGTACAGGATTACATCCAGTAC 450
BSNT_05537___ 451 GACGATGAACTGCGGGAGAAATGGGAACATATCAAGGAGAAATCGCCTGC 500
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU36280___yw 451 GACGATGACCTGCGGGAGAAATGGGAACATATCAAGGAAAAATCGCCTGC 500
BSNT_05537___ 501 GGTTACGTCATTCCGCGGCCATTTTCTTGATGAAGAGGATTTTCTGGAAG 550
|||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 501 GGTTACGACATTCCGTGGCCATTTTCTTGATGAAGAGGATTTTCTGGAAG 550
BSNT_05537___ 551 GCATTGGCTGGATTGACGACCAATCTCCATTTACTGTCGGCTTGCGCTTA 600
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 551 GCATTGGCTGGATTGACGATCAATCTCCATTTACTGTCGGCTTGCGCTTA 600
BSNT_05537___ 601 AATGAACCGGACTTTGACGGAGACGATTGGAAAATTGAGATGTTTTTACG 650
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
BSU36280___yw 601 AATGAACCGGACTTTGACGGAGACGAATGGAAGATCGAGATGTTTTTACG 650
BSNT_05537___ 651 TGATAAAAAGAGCGGTGCTGTAGAATTTTTTGACAGGCTGAAGAGCCTCA 700
.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||
BSU36280___yw 651 CGATAAAAAGAGCGGTGCTGTAGAATTCTTTGACGGACTGAAGAGCCTCA 700
BSNT_05537___ 701 AAAAATCGTGGCAGGCATACAGCGATAAAATCGCGCGTGAGCAGGACCGC 750
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 701 AAAAATCGTGGCAGGCGTACAGCGATAAAATCGCGCGTGAGCAGGACCGC 750
BSNT_05537___ 751 TTTCACAGAACGGTTCCGTGGCTGTCATTTGATTCCGGGACAACGCTGAT 800
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 751 TTTCACAGAACGGTTCCGTGGCTGTCGTTTGATTCCGGGACAACGCTGAT 800
BSNT_05537___ 801 CTCGGAGGAAGAAGCCTGGATCTTCCTGTCAGAAGCAAGTGAGACGCTTG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 801 CTCGGAGGAAGAAGCCTGGATCTTCCTGTCAGAAGCAAGTGAGACGCTTG 850
BSNT_05537___ 851 TCGATATGGGGGTAGAAATCCTCCTGCCGTCCTGGTGGCAGATTGTCAGA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 851 TCGATATGGGGGTAGAAATCCTCCTGCCGTCCTGGTGGCAGATTGTCAGA 900
BSNT_05537___ 901 GACAGCAACATGATGCTGAAAGCAAAGGTGTCTTCCTCCCCGCGTGGAGA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
BSU36280___yw 901 GACAGCAACATGATGCTGAAAGCAAAGGTGTCTTCCTCCCCGCGCGGCGA 950
BSNT_05537___ 951 GTCATTTGTCGGCATGAATGCACTGCTTGATTTCAACTGGCGGTTTGCGA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 951 GTCATTTGTCGGCATGAATGCACTGCTTGATTTCAACTGGCGGTTTGCGA 1000
BSNT_05537___ 1001 CAAATGGAATTGAACTGACTGAGGATGAATTTAATGAGCTTGTCGCCAGC 1050
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1001 CAAATGGAATTGAACTGACTGAGGCTGAATTTAATGAGCTTGTCGCCAGC 1050
BSNT_05537___ 1051 AACAGGCGCCTTGTTAATATCCGCGGGCAATGGGTTAAAATCGATCCGCA 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1051 AACAGGCGCCTTGTTAATATCCGCGGGCAATGGGTTAAAATCGATCCGCA 1100
BSNT_05537___ 1101 GTTTATCAAACAGATGAAACGCCTGATGGAAAAAGCAGAATCAGAGGGAC 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1101 GTTTATCAAACAGATGAAACGCCTGATGGAAAAAGCAGAATCAGAGGGAC 1150
BSNT_05537___ 1151 TCCACATGTCTGATATTCTGGCGCGCGAGCTAATGGATCAGCAGGATGGC 1200
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1151 TCCACATGTCTGATATTCTGGCGCGGGAGCTAATGGATCAGCAGGATGGC 1200
BSNT_05537___ 1201 GGACTTGAGGATTCGGATCTGATTGATACATCCGCTTTCGCCGGCATTCA 1250
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||
BSU36280___yw 1201 GGACTTGAGGATTCGGACCTGATTGATACATCTGCTTTTGCCGGCATTCA 1250
BSNT_05537___ 1251 GTTTGATCTGTCTAAACAGCTCAGGTCACTGATTCGAAAGCTCACTGCCG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1251 GTTTGATCTGTCTAAACAGCTCAGGTCACTGATTCGAAAGCTCACTGCCG 1300
BSNT_05537___ 1301 CGGAAAACCTGCCGGAGCACGAAGTCAGTCCTTCTTTCAAAGGAACGCTC 1350
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1301 CGGAAAACCTGCCGGAGCACAAAGTCAGTCCTTCTTTCAAAGGAACGCTC 1350
BSNT_05537___ 1351 CGCCCTTATCAGAAATACGGCATGAACTGGCTGCTGTTTCTGCGGGAAAG 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1351 CGCCCTTATCAGAAATACGGCATGAACTGGCTGCTGTTTCTGCGGGAAAG 1400
BSNT_05537___ 1401 CGGTTTTGGCGCCTGTCTGGCTGACGATATGGGGCTTGGGAAAACGATTC 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1401 CGGTTTTGGCGCCTGTCTGGCTGACGATATGGGGCTTGGGAAAACGATTC 1450
BSNT_05537___ 1451 AAATGATCGCCTATTTCCTTCACGTGAAGGAAAGCGGCCGGCAAAAAACG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU36280___yw 1451 AAATGATCGCCTATTTCCTTCACGTGAAGGAAAGCGGCCGACAAAAAACG 1500
BSNT_05537___ 1501 CCTCATTTGATTATTGCGCCGACATCCGTACTTGGCAACTGGCAGCGGGA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1501 CCTCATTTGATTATTGCGCCGACATCCGTACTTGGCAACTGGCAGCGGGA 1550
BSNT_05537___ 1551 GCTTCAAACCTTTGCCCCTGATCTGTCTGTCGCGCTCCATTATGGGCCGC 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1551 GCTTCAAACCTTTGCCCCTGATCTGTCTGTCGCGCTCCATTATGGGCCGC 1600
BSNT_05537___ 1601 GTCGGCCAAAGGGGGATGATTTCGCCGCGCATTATGAAAACGCAGACGTG 1650
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1601 GCCGGCCAAAGGGTGATGATTTCGCCGCGCATTATGAAAACGCAGACGTG 1650
BSNT_05537___ 1651 GTGCTCACTTCATACGGTCTGTCACATGCAGATACTGAAGAGCTTTCTTC 1700
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1651 GTGCTCACTTCATACGGTCTGTCACATGCCGATACTGAAGAGCTTTCTTC 1700
BSNT_05537___ 1701 TGTGACATGGAACACGATCTGCCTTGATGAAGCGCAAAATATTAAAAACG 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1701 TGTGACATGGAACACGATCTGCCTTGATGAAGCGCAAAATATTAAAAACG 1750
BSNT_05537___ 1751 CGCATACGAAGCAATCACGCGCAATCAGGAAGCTGAAGGGGCTTCACCAT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1751 CGCATACGAAGCAATCACGCGCAATCAGGAAGCTGAAGGGGCTTCACCAT 1800
BSNT_05537___ 1801 ATCGCGCTGAGCGGCACGCCGATGGAAAACCGGCTGACTGAGCTGTGGTC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU36280___yw 1801 ATCGCGCTGAGCGGCACGCCGATGGAAAACCGACTGACTGAGCTGTGGTC 1850
BSNT_05537___ 1851 CATTTTTGACTTCATGAATAAAGGCTATCTCGGCAGTTTGACCGGCTTCC 1900
.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1851 TATTTTTGACTTCATGAATAAAGGCTACCTCGGCAGTTTGACCGGCTTCC 1900
BSNT_05537___ 1901 ATAAACGCTATGTGCTGCCGATCGAAAAAGACCGGGACGAAAAGAGAATC 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1901 ATAAACGCTATGTGCTGCCGATCGAAAAAGACCGGGACGAAAAGAGAATC 1950
BSNT_05537___ 1951 GGACAGCTTCAGCAATTAATCCGGCCATTCCTTCTCCGCCGGACGAAACG 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 1951 GGACAGCTTCAGCAATTAATCCGGCCATTCCTTCTCCGCCGGACGAAACG 2000
BSNT_05537___ 2001 GGATGAAGAGGTCGCGCTTAATCTTCCTGAGAAGCTGGAAGAAAAAGAAT 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2001 GGATGAAGAGGTCGCGCTTAATCTTCCTGAGAAGCTGGAAGAAAAAGAAT 2050
BSNT_05537___ 2051 TTATCCCGCTGTCAGCCGAGCAGGCATCCCTTTATGAGCAGCTCGTCAAA 2100
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2051 TTATCCCTCTGTCAGCCGAGCAGGCATCCCTTTATGAGCAGCTCGTCAAA 2100
BSNT_05537___ 2101 GACACTTTTGACCATATGACATCCCTGACCGGCATGCAGCGAAAAGCGCT 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2101 GACACTTTTGACCATATGACATCCCTGACCGGCATGCAGCGAAAAGCGCT 2150
BSNT_05537___ 2151 GATCCTCAGCATGCTTGGACGGCTCAAGCAAATATGCGATCATCCCGCGC 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2151 GATCCTCAGCATGCTTGGACGGCTCAAGCAAATATGCGATCATCCCGCGC 2200
BSNT_05537___ 2201 TTTATTTAAAGGAAGAGCAAACCGAGCTGCTGGCCGGCAGATCAGTCAAG 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2201 TTTATTTAAAGGAAGAGCAAACCGAGCTGCTGGCCGGCAGATCAGTCAAG 2250
BSNT_05537___ 2251 CTCGAAAAATTGCTGGAACTGATGACAGCGATTCGCGCCCAAAACGAAAG 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU36280___yw 2251 CTCGAAAAATTGCTGGAACTGATGACAGCGATCCGCGCCCAAAACGAAAG 2300
BSNT_05537___ 2301 CTGCCTGATTTTCACGCAATACATTCAGATGGGGAACATGATGAAGCGGC 2350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2301 CTGCCTGATTTTCACGCAATACATTCAGATGGGGAACATGATGAAGCGGC 2350
BSNT_05537___ 2351 TGCTTGAAAAAACGTTCGGGGAACCTGTGCAATTTTTAAATGGGAGTCTC 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2351 TGCTTGAAAAAACGTTCGGGGAACCTGTGCAATTTTTAAATGGGAGTCTC 2400
BSNT_05537___ 2401 TCCAAGCAAGAGCGGGATACACTCGTTGAGAAATTTCAAAGGAAAGAATA 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2401 TCCAAGCAAGAGCGGGATACACTCGTTGAGAAATTTCAAAGGAAAGAATA 2450
BSNT_05537___ 2451 TCCGACACTGATTCTTTCACTCAAAGCTGGAGGCACCGGACTTAATTTGA 2500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2451 TCCGACACTGATTCTTTCACTCAAAGCTGGAGGCACCGGACTTAATTTGA 2500
BSNT_05537___ 2501 CCGCCGCCAATCACGTCATCCATTATGACAGATGGTGGAACCCGGCGGTT 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2501 CCGCCGCCAATCACGTCATCCATTATGACAGATGGTGGAACCCGGCGGTT 2550
BSNT_05537___ 2551 GAAAATCAAGCGACTGACCGTGCATACCGCATAGGCCAGGAGCGCTTTGT 2600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2551 GAAAATCAAGCGACTGACCGTGCATACCGCATAGGCCAGGAGCGCTTTGT 2600
BSNT_05537___ 2601 CCACGTTCATAAAATGATTACGACGGGAACAATCGAGGAAAAAATTGATG 2650
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
BSU36280___yw 2601 CCACGTTCATAAAATGATTACGACAGGAACAATCGAAGAAAAAATTGATG 2650
BSNT_05537___ 2651 TCATGCTTGAATCCAAGCAAACCCTGAACGATCAAATTATCCAAAGTGAA 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU36280___yw 2651 TCATGCTTGAATCCAAGCAAACCCTGAACGATCAAATTATCCAAAGTGAA 2700
BSNT_05537___ 2701 AACTGGATTACCGAGCTTTCCACACAGGAGCTTGAAGAACTGTTTACATT 2750
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||
BSU36280___yw 2701 AACTGGATTACCGAGCTTTCCACACAGGAGCTCGAAGAATTGTTTACATT 2750
BSNT_05537___ 2751 AAGCGCAACAGCGCAATAA 2769
||||||.||||||||||||
BSU36280___yw 2751 AAGCGCTACAGCGCAATAA 2769
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.