Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_05726 and BSU37450
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_05726 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:26:51
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_05726___ywhK.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU37450___ywhK.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_05726___ywhK-BSU37450___ywhK.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05726___ywhK-BSU37450___ywhK.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05726___ywhK
# 2: BSU37450___ywhK
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1356
# Identity: 1295/1356 (95.5%)
# Similarity: 1295/1356 (95.5%)
# Gaps: 0/1356 ( 0.0%)
# Score: 6231.0
#
#
#=======================================
BSNT_05726___ 1 ATGAGAAAAAATAAGCTTTCCTTTAAAGAAAAAGCAGGAGCAGAACAAGA 50
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 1 ATGAGAAAAAACAAGCTTTCCTTTAAAGAAAAAGCAGGAGCAGAACAAGA 50
BSNT_05726___ 51 AGAGTGCTTATGTTTTTGTGAGGGAGAAGCAAGCCGAGAAGCCATGTTTC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 51 AGAGTGCTTATGTTTTTGTGAGGGAGAAGCAAGCCGAGAAGCCATGTTTC 100
BSNT_05726___ 101 AAGCGCCGATTGAGTTACCTGAAGGATTTGTCGTTGATCCGGCTGAAGCT 150
||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 101 AAGCACCGATTGAATTACCTGAAGGGTTTGTCGTTGATCCGGCTGAAGCT 150
BSNT_05726___ 151 GTTGCAAACGTGACGTGGAATGCAGACAGCCTTTCTTGTGTCAGTGACCG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 151 GTTGCAAACGTGACGTGGAATGCAGACAGCCTTTCTTGTGTCAGTGACCG 200
BSNT_05726___ 201 TTGCTTAATTCAAACGGGGCCAGAGCCTGATGAGGTCGGTGTTCAATTTG 250
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 201 TTGCTTAATTCAAACGGGGCCTGAGCCTGATGAGGTCGGTGTTCAATTTG 250
BSNT_05726___ 251 CAGTGCGCCTGCAGGGAACCGTTACGCTACTCGTCAGTGTCTCACCTGTG 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU37450___yw 251 CAGTGCGCCTGCAGGGAACCGTTACGCTACTCGTCAGTGTCTCACCTGTC 300
BSNT_05726___ 301 CGAAATCAATATGGACAAGGGGACGGGGCTGTTTCCGTCATTCACAATGC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 301 CGAAATCAATATGGACAAGGGGACGGGGCTGTTTCCGTCATTCACAATGC 350
BSNT_05726___ 351 AGAAATCGATCAAGTCGTCTATTATTCCGATGAACCGGATGATTGCCCGG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU37450___yw 351 AGAAATCGATCAAGTCGTCTATTATTCCGATGAATCGGATGATTGCCCGG 400
BSNT_05726___ 401 ATATCAGTGACATCACGATTGAGAACCTTGTTGTTGTTCCGCCGTTTTAC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 401 ATATCAGTGACATCACGATTGAGAACCTTGTTGTTGTTCCGCCGTTTTAC 450
BSNT_05726___ 451 GGTAGTCCTTTATCGGTGACGGGGACGATTGTGCTTGTACCGGAGCCGGA 500
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 451 GGCAGTCCTTTATCGGTGACGGGGACAATTGTGCTTGTACCGGAGCCGGA 500
BSNT_05726___ 501 ACCCGTCTACGCGTTTACAGCGAATCCAAATGATCAATCAGTTTCTGTGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 501 ACCCGTCTACGCGTTTACAGCGAATCCAAATGATCAATCAGTTTCTGTGA 550
BSNT_05726___ 551 TTGATACAAACACCCATACTGTTGTGACAACGATTGCTCTTCCGTACAAT 600
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 551 TTGATACAAACACCGATACTGTTGTGACAACGATTGCTCTTCCGTACAAT 600
BSNT_05726___ 601 CCGGCAGGTATTGAAATTACGCCAGATAAAAGCGCTGTGTTTGTCTTACA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 601 CCGGCAGGTATTGAAATTACGCCAGATAAAAGCGCTGTGTTTGTCTTACA 650
BSNT_05726___ 651 TCCCAACAATAATGTGATTTCTGTCATCGATTATGACACATTAACAGTGA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 651 TCCCAACAATAATGTGATTTCTGTCATCGATTATGACACATTAACAGTGA 700
BSNT_05726___ 701 CAGCAACTATATTGCTGGATCAGCCGCCTCGATTGATTAGATTTATCCCT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 701 CAGCAACTATATTGCTGGATCAGCCGCCTCGATTGATTAGATTTATCCCT 750
BSNT_05726___ 751 AATCATGAGTTTGCTTATGTTTTCACCGGTACTGCCATTTATGTGATTGG 800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
BSU37450___yw 751 AATCATGAGTTTGCTTATGTTTTCACCGGTACTGCGGTTTATGTGATTGG 800
BSNT_05726___ 801 AATTGATACGTTGACTGTTGAGAGGTCTATTCCTGTAGAAGGTTTTGATA 850
||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.|.||||.
BSU37450___yw 801 AATTGATACGTTAACTGTGGATAGGTCGATTCCTGTGGAAGGATATGATG 850
BSNT_05726___ 851 TTGCAATTGACCCCAATGGGTTGTTCGCCTATGTTCTTAATTTTGGGTTA 900
|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||
BSU37450___yw 851 TTGCAATCGATCCCAATGGGTTATTCGCCTATGTTCTGAATTTTGGAATA 900
BSNT_05726___ 901 GTGCAAAAAGTGGACTTATCTACCGGTGAAGTCTTAGGAACGATTGAACG 950
|||||||||||||||.||.||||||||||||||..||||||.||||||||
BSU37450___yw 901 GTGCAAAAAGTGGACCTAACTACCGGTGAAGTCACAGGAACAATTGAACG 950
BSNT_05726___ 951 AGAGCTTATCGTATCATCCATAGAAACAGATTCTACGGAGCGGTATGCGT 1000
||||||||||||||||.|||||||||||.|||...|||||||||||||.|
BSU37450___yw 951 AGAGCTTATCGTATCAACCATAGAAACAAATTGGCCGGAGCGGTATGCCT 1000
BSNT_05726___ 1001 ATGTATTAGAACAAGAATTCTTATTCAATTATTTGACGGTTATTGATTTA 1050
||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 1001 ATGTATTAGAACAAGAATTCTTTTTTAATTATTTGACGGTTATTGATTTA 1050
BSNT_05726___ 1051 AATACGTTTACGATCAGGGATACCCAAGAGCTGGAGCCTGACGGGCTATA 1100
|||||||||||.|||||....|||||||||||||||..|||.|||..|||
BSU37450___yw 1051 AATACGTTTACCATCAGCAGCACCCAAGAGCTGGAGTATGAAGGGGAATA 1100
BSNT_05726___ 1101 TGTAATGTTTACGAGTGGATCAGAGGTGTATTTACATGACAGCTTCACTG 1150
|..||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||
BSU37450___yw 1101 TCGAATGTTTACGAGTGGAGCAGAGGTGTATTTATATGACGGCTTCACTG 1150
BSNT_05726___ 1151 GCAATTTATATTCTGTCAGTCCGAATGGAGCAGGTGTAATTGGAAATCTT 1200
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||.||
BSU37450___yw 1151 GCAATTTATATTCTGTCAGTCCAAATGGAGCAGGCGTTATAGGAAATGTT 1200
BSNT_05726___ 1201 CCGCAATCAGCAACAGACTATGCGTTTACCCCGAATGGCGATTTTCTGTA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 1201 CCGCAATCAGCAACAGACTATGCGTTTACCCCGAATGGCGATTTTCTGTA 1250
BSNT_05726___ 1251 TACAACTCGTTTTATAGAGCAGAGCATCATTGTTTACAACACAGATGATT 1300
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 1251 TGCAACTCGTTTTATAGAGCAGAGCATCATTGTTTACAACACAGATGATT 1300
BSNT_05726___ 1301 ATTCTGTGGAAACTGTGATATCTCTTGGGGTTTCACCGGGTGCCATTACG 1350
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37450___yw 1301 ATTCTGAGGAAACTGTGATATCTCTTGGGGTTTCACCGGGTGCCATTACG 1350
BSNT_05726___ 1351 ATTTAA 1356
||||||
BSU37450___yw 1351 ATTTAA 1356
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.