Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

Amino acid alignment: BSNT_00094 and BL00515

See DNA alignment / Visit BSNT_00094 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:21:45
# Commandline: needle
#    -asequence pep-align/BSNT_00094___mfd.1.5803.seq
#    -bsequence pep-align/BL00515___mfd.2.5803.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile pep-align/BSNT_00094___mfd-BL00515___mfd.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_00094___mfd-BL00515___mfd.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00094___mfd
# 2: BL00515___mfd
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1177
# Identity:    1004/1177 (85.3%)
# Similarity:  1099/1177 (93.4%)
# Gaps:           0/1177 ( 0.0%)
# Score: 5187.0
# 
#
#=======================================

BSNT_00094___      1 MDNIQTFIKESDDFKSIINGLHEGLKEQLLAGLSGSARSVFTSALANETN     50
                     |:|||::|.:|||||||:|||:|||||||||||||||||:||:||..||.
BL00515___mfd      1 MNNIQSYITKSDDFKSIVNGLNEGLKEQLLAGLSGSARSLFTAALTKETR     50

BSNT_00094___     51 KPIFLITHNLYQAQKVTDDLTSLLEDRSVLLYPVNELISSEIAVASPELR    100
                     :|:||||||||||||:|||||.|::|:.||||||||||||||||||||||
BL00515___mfd     51 RPVFLITHNLYQAQKITDDLTGLIKDQPVLLYPVNELISSEIAVASPELR    100

BSNT_00094___    101 AQRLDVINRLTNGEAPIVVAPVAAIRRMLPPVEVWKSSQMLIQVGHDIEP    150
                     :|||||:|||.:||.||||||.||:||||||||||::||:.|:.|.||:.
BL00515___mfd    101 SQRLDVLNRLASGETPIVVAPAAAVRRMLPPVEVWQNSQIHIETGRDIDT    150

BSNT_00094___    151 DQLASRLVEVGYERSDMVSAPGEFSIRGGIIDIYPLTSENPVRIELFDTE    200
                     :||..:||::||||:|||:|||||||||||||:|.||.||||||||||||
BL00515___mfd    151 EQLLQKLVQMGYERTDMVAAPGEFSIRGGIIDVYSLTEENPVRIELFDTE    200

BSNT_00094___    201 VDSIRSFNSDDQRSIETLTSINIGPAKELIIRPEEKARAMEKIDSGLAAS    250
                     |||||.||:|||||:||...:.||||||||:|.|::.||:|:||.|||.|
BL00515___mfd    201 VDSIRIFNTDDQRSLETRDEVTIGPAKELIVRDEDRQRALEQIDQGLANS    250

BSNT_00094___    251 LKKLKADKQKEILHANISHDKERLSEGQTDQELVKYLSYFYEKPASLLDY    300
                     |||||.|||||||..||:.|||||.||...||:|||||||||||||||||
BL00515___mfd    251 LKKLKLDKQKEILDQNIAEDKERLKEGHIGQEMVKYLSYFYEKPASLLDY    300

BSNT_00094___    301 TPDNTLLILDEVSRIHEMEEQLQKEEAEFITNLLEEGKILHDIRLSFSFQ    350
                     .|.||||||||:|||||||:||||||||:||:||||||||||..:||.|.
BL00515___mfd    301 FPKNTLLILDEISRIHEMEDQLQKEEAEWITSLLEEGKILHDTSMSFPFH    350

BSNT_00094___    351 KIVAEQKRPLLYYSLFLRHVHHTSPQNIVNVSGRQMQSFHGQMNVLAGEM    400
                     .::::|.||:||||||||||.|||||||||||.:||||||||||||..|:
BL00515___mfd    351 SLISKQSRPILYYSLFLRHVQHTSPQNIVNVSSKQMQSFHGQMNVLKNEI    400

BSNT_00094___    401 ERFKKSNFTVVFLGANKERTQKLSSVLADYDIEAAVTDSKKALVQGQVYI    450
                     ||||||.:|.||||.:|||.:||:|||:|||||||..|...||.|||:||
BL00515___mfd    401 ERFKKSKYTTVFLGDSKERVEKLASVLSDYDIEAAQADQDAALAQGQIYI    450

BSNT_00094___    451 MEGELQSGFELPLMKLAVITEEELFKNRVKKKPRKQKLTNAERIKSYSEL    500
                     |||.||||||||::||||||||||||.||||:.|||||||||||||||||
BL00515___mfd    451 MEGGLQSGFELPMIKLAVITEEELFKKRVKKQARKQKLTNAERIKSYSEL    500

BSNT_00094___    501 QIGDYVVHINHGIGKYLGIETLEINGIHKDYLNIHYQGSDKLYVPVEQID    550
                     ||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
BL00515___mfd    501 QIGDYVVHVNHGIGKYLGIETLEINGIHKDYLNIHYQGSDKLYVPVDQID    550

BSNT_00094___    551 QVQKYVGSEGKEPKLYKLGGSEWKRVKKKVETSVQDIADDLIKLYAEREA    600
                     |||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
BL00515___mfd    551 QVQKYVGSEGKEPKLYKLGGSEWKRVKKKVESSVQDIADDLIKLYAEREA    600

BSNT_00094___    601 SKGYAFSPDHEMQREFESAFPYQETEDQLRSIHEIKKDMERERPMDRLLC    650
                     |||||||||||||||||:||||||||||||||||||:|||:|||||||||
BL00515___mfd    601 SKGYAFSPDHEMQREFEAAFPYQETEDQLRSIHEIKRDMEKERPMDRLLC    650

BSNT_00094___    651 GDVGYGKTEVAIRAAFKAIGDGKQVALLVPTTILAQQHYETIKERFQDYP    700
                     |||||||||||||||||||.||||||:|||||||||||||||.|||||||
BL00515___mfd    651 GDVGYGKTEVAIRAAFKAIADGKQVAILVPTTILAQQHYETILERFQDYP    700

BSNT_00094___    701 INIGLLSRFRTRKEANETIKGLKNGTVDIVIGTHRLLSKDVVYKDLGLLI    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL00515___mfd    701 INIGLLSRFRTRKEANETIKGLKNGTVDIVIGTHRLLSKDVVYKDLGLLI    750

BSNT_00094___    751 IDEEQRFGVTHKEKIKQIKANVDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIE    800
                     ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
BL00515___mfd    751 IDEEQRFGVTHKEKIKRIKANVDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIE    800

BSNT_00094___    801 TPPENRFPVQTYVVEYNGALVREAIERELARGGQVYFLYNRVEDIERKAD    850
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
BL00515___mfd    801 TPPENRFPVQTYVVEYNGALVREAIERELARGGQVYFLYNRVEDIERKAE    850

BSNT_00094___    851 EISMLVPDAKVAYAHGKMTENELETVMLSFLEGESDVLVSTTIIETGVDI    900
                     |||||||||||.||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||||
BL00515___mfd    851 EISMLVPDAKVTYAHGKMTENELESVMLNFLEGESDVLVSTTIIETGVDI    900

BSNT_00094___    901 PNVNTLIVFDADKMGLSQLYQLRGRVGRSNRVAYAYFTYRRDKVLTEVAE    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
BL00515___mfd    901 PNVNTLIVFDADKMGLSQLYQLRGRVGRSNRVAYAYFTYRKDKVLTEVAE    950

BSNT_00094___    951 KRLQAIKEFTELGSGFKIAMRDLTIRGAGNLLGAQQHGFIDSVGFDLYSQ   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL00515___mfd    951 KRLQAIKEFTELGSGFKIAMRDLTIRGAGNLLGAQQHGFIDSVGFDLYSQ   1000

BSNT_00094___   1001 MLKEAIEERKGDTAKTEQFETEIDVELDAYIPETYIQDGKQKIDMYKRFR   1050
                     |||||||.||||..:.|:||.|||:|||||||:||:.|||||||||||||
BL00515___mfd   1001 MLKEAIEARKGDAPQAEKFEPEIDLELDAYIPQTYVTDGKQKIDMYKRFR   1050

BSNT_00094___   1051 SVATIEEKNELQDEMIDRFGNYPKEVEYLFTVAEMKVYARQERVELIKQD   1100
                     :::|||||:|||||||||||.|||||||||.:||.||||.:|||||||||
BL00515___mfd   1051 AISTIEEKSELQDEMIDRFGEYPKEVEYLFAIAEAKVYAIKERVELIKQD   1100

BSNT_00094___   1101 KDAVRLTISEEASAEIDGQKLFELGNQYGRQIGLGMEGKKLKISIQTKGR   1150
                     ||||||||.|:||||||||||||||::|||||||||||||||||||.|.|
BL00515___mfd   1101 KDAVRLTIDEKASAEIDGQKLFELGSKYGRQIGLGMEGKKLKISIQVKNR   1150

BSNT_00094___   1151 SADEWLDTVLGMLKGLKDVKKQTISST   1177
                     ..:|||:|:|.:||||::||||||:|:
BL00515___mfd   1151 KPEEWLETLLDILKGLQNVKKQTIASS   1177


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.