Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
Amino acid alignment: BSNT_00094 and RBAM_000640
See
DNA alignment /
Visit
BSNT_00094 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:21:52
# Commandline: needle
# -asequence pep-align/BSNT_00094___mfd.1.9828.seq
# -bsequence pep-align/RBAM_000640___mfd.2.9828.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile pep-align/BSNT_00094___mfd-RBAM_000640___mfd.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_00094___mfd-RBAM_000640___mfd.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00094___mfd
# 2: RBAM_000640___mfd
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1177
# Identity: 1076/1177 (91.4%)
# Similarity: 1138/1177 (96.7%)
# Gaps: 0/1177 ( 0.0%)
# Score: 5519.0
#
#
#=======================================
BSNT_00094___ 1 MDNIQTFIKESDDFKSIINGLHEGLKEQLLAGLSGSARSVFTSALANETN 50
|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||.||.
RBAM_000640__ 1 MDNIQTFIKESDDFKSIVNGLHEGLKEQLLAGLSGSARSVFTSALAQETK 50
BSNT_00094___ 51 KPIFLITHNLYQAQKVTDDLTSLLEDRSVLLYPVNELISSEIAVASPELR 100
:|||.||||||||||||:|||:||.|:||.||||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 51 RPIFFITHNLYQAQKVTEDLTALLGDQSVFLYPVNELISSEIAVASPELR 100
BSNT_00094___ 101 AQRLDVINRLTNGEAPIVVAPVAAIRRMLPPVEVWKSSQMLIQVGHDIEP 150
||||||||||||||||:|||||||:||||||.|:|||||::|.:|.:|||
RBAM_000640__ 101 AQRLDVINRLTNGEAPVVVAPVAAVRRMLPPKELWKSSQLVISLGDEIEP 150
BSNT_00094___ 151 DQLASRLVEVGYERSDMVSAPGEFSIRGGIIDIYPLTSENPVRIELFDTE 200
|||::||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
RBAM_000640__ 151 DQLSARLVEVGYERSDMVSAPGEFSIRGGIIDIYPLTSEHPVRIELFDTE 200
BSNT_00094___ 201 VDSIRSFNSDDQRSIETLTSINIGPAKELIIRPEEKARAMEKIDSGLAAS 250
||||||||||||||||||..:.||||||||||.||||||||::|.|||.|
RBAM_000640__ 201 VDSIRSFNSDDQRSIETLKHVAIGPAKELIIRAEEKARAMERLDKGLADS 250
BSNT_00094___ 251 LKKLKADKQKEILHANISHDKERLSEGQTDQELVKYLSYFYEKPASLLDY 300
|||||.|||||:||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 251 LKKLKQDKQKEMLHINISHDKERLSTGQTDQELVKYLSYFYEKPASLLDY 300
BSNT_00094___ 301 TPDNTLLILDEVSRIHEMEEQLQKEEAEFITNLLEEGKILHDIRLSFSFQ 350
||.:|||:|||||||||||:|||||||||:|:|||||||||||.||||||
RBAM_000640__ 301 TPADTLLLLDEVSRIHEMEDQLQKEEAEFMTSLLEEGKILHDIHLSFSFQ 350
BSNT_00094___ 351 KIVAEQKRPLLYYSLFLRHVHHTSPQNIVNVSGRQMQSFHGQMNVLAGEM 400
::::|::||.:|||||||||.||||||||||:.|||||||||||||||||
RBAM_000640__ 351 ELMSEKRRPAIYYSLFLRHVQHTSPQNIVNVTSRQMQSFHGQMNVLAGEM 400
BSNT_00094___ 401 ERFKKSNFTVVFLGANKERTQKLSSVLADYDIEAAVTDSKKALVQGQVYI 450
|||||||||||||||||:||.:|:||||||:||||.|||.|||||||||:
RBAM_000640__ 401 ERFKKSNFTVVFLGANKDRTDRLASVLADYEIEAAKTDSSKALVQGQVYV 450
BSNT_00094___ 451 MEGELQSGFELPLMKLAVITEEELFKNRVKKKPRKQKLTNAERIKSYSEL 500
||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 451 MEGELQSGFELPLMKLAVITEEELFKNRIKKKPRKQKLTNAERIKSYSEL 500
BSNT_00094___ 501 QIGDYVVHINHGIGKYLGIETLEINGIHKDYLNIHYQGSDKLYVPVEQID 550
|:||||||:|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 501 QVGDYVVHVNHGIGKYLGIETLEIKGIHKDYLNIHYQGSDKLYVPVEQID 550
BSNT_00094___ 551 QVQKYVGSEGKEPKLYKLGGSEWKRVKKKVETSVQDIADDLIKLYAEREA 600
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 551 QVQKYVGSEGKEPKLYKLGGSEWKRVKKKVENSVQDIADDLIKLYAEREA 600
BSNT_00094___ 601 SKGYAFSPDHEMQREFESAFPYQETEDQLRSIHEIKKDMERERPMDRLLC 650
||||||||||||||:|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
RBAM_000640__ 601 SKGYAFSPDHEMQRQFESAFPYQETEDQLRSIQEIKKDMERERPMDRLLC 650
BSNT_00094___ 651 GDVGYGKTEVAIRAAFKAIGDGKQVALLVPTTILAQQHYETIKERFQDYP 700
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||
RBAM_000640__ 651 GDVGYGKTEVAIRAAFKAIADGKQVALLVPTTILAQQHYETIMERFQDYP 700
BSNT_00094___ 701 INIGLLSRFRTRKEANETIKGLKNGTVDIVIGTHRLLSKDVVYKDLGLLI 750
||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 701 INIGLLSRFRTRKESNETIKGLKNGTVDIVIGTHRLLSKDVVYKDLGLLI 750
BSNT_00094___ 751 IDEEQRFGVTHKEKIKQIKANVDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIE 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 751 IDEEQRFGVTHKEKIKQIKANVDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIE 800
BSNT_00094___ 801 TPPENRFPVQTYVVEYNGALVREAIERELARGGQVYFLYNRVEDIERKAD 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
RBAM_000640__ 801 TPPENRFPVQTYVVEYNGALVREAIERELARGGQVYFLYNRVDDIERKAD 850
BSNT_00094___ 851 EISMLVPDAKVAYAHGKMTENELETVMLSFLEGESDVLVSTTIIETGVDI 900
||||||||||||||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 851 EISMLVPDAKVAYAHGKMTENELESVMLNFLEGESDVLVSTTIIETGVDI 900
BSNT_00094___ 901 PNVNTLIVFDADKMGLSQLYQLRGRVGRSNRVAYAYFTYRRDKVLTEVAE 950
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 901 PNVNTLIVFDGDKMGLSQLYQLRGRVGRSNRVAYAYFTYRRDKVLTEVAE 950
BSNT_00094___ 951 KRLQAIKEFTELGSGFKIAMRDLTIRGAGNLLGAQQHGFIDSVGFDLYSQ 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RBAM_000640__ 951 KRLQAIKEFTELGSGFKIAMRDLTIRGAGNLLGAQQHGFIDSVGFDLYSQ 1000
BSNT_00094___ 1001 MLKEAIEERKGDTAKTEQFETEIDVELDAYIPETYIQDGKQKIDMYKRFR 1050
||||||||||||..|:||||||||:||||||||.||||||||||||||||
RBAM_000640__ 1001 MLKEAIEERKGDIPKSEQFETEIDIELDAYIPENYIQDGKQKIDMYKRFR 1050
BSNT_00094___ 1051 SVATIEEKNELQDEMIDRFGNYPKEVEYLFTVAEMKVYARQERVELIKQD 1100
|:||||||||||||:|||||:||||||:||||||||||.:.|||||||||
RBAM_000640__ 1051 SIATIEEKNELQDEIIDRFGSYPKEVEWLFTVAEMKVYGKYERVELIKQD 1100
BSNT_00094___ 1101 KDAVRLTISEEASAEIDGQKLFELGNQYGRQIGLGMEGKKLKISIQTKGR 1150
|||:|.||||||||:|||||||||||:|||||||||||||||||:|||||
RBAM_000640__ 1101 KDAIRFTISEEASAQIDGQKLFELGNKYGRQIGLGMEGKKLKISVQTKGR 1150
BSNT_00094___ 1151 SADEWLDTVLGMLKGLKDVKKQTISST 1177
..:|||:|||||||||:||||:||:|:
RBAM_000640__ 1151 KTEEWLETVLGMLKGLQDVKKETIASS 1177
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.