Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
Amino acid alignment: BSNT_00209 and RBAM_001330
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Orthologue table
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# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:00
# Commandline: needle
# -asequence pep-align/BSNT_00209___rpoC.1.9828.seq
# -bsequence pep-align/RBAM_001330___rpoC.2.9828.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile pep-align/BSNT_00209___rpoC-RBAM_001330___rpoC.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_00209___rpoC-RBAM_001330___rpoC.aln
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#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00209___rpoC
# 2: RBAM_001330___rpoC
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1199
# Identity: 1179/1199 (98.3%)
# Similarity: 1193/1199 (99.5%)
# Gaps: 0/1199 ( 0.0%)
# Score: 6046.0
#
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BSNT_00209___ 1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER 50
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RBAM_001330__ 1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER 50
BSNT_00209___ 51 IFGPTKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP 100
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RBAM_001330__ 51 IFGPTKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP 100
BSNT_00209___ 101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLL 150
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RBAM_001330__ 101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLL 150
BSNT_00209___ 151 SEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLVKEVDMLKEELKTSQG 200
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RBAM_001330__ 151 SEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAINKLLQDIDLVKEVDMLKEELKTSQG 200
BSNT_00209___ 201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA 250
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RBAM_001330__ 201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA 250
BSNT_00209___ 251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR 300
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RBAM_001330__ 251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR 300
BSNT_00209___ 301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHL 350
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RBAM_001330__ 301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHL 350
BSNT_00209___ 351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV 400
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RBAM_001330__ 351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV 400
BSNT_00209___ 401 LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF 450
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RBAM_001330__ 401 LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF 450
BSNT_00209___ 451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY 500
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RBAM_001330__ 451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY 500
BSNT_00209___ 501 YLTLERAGAVGEGMVFKNTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFT 550
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RBAM_001330__ 501 YLTLERAGAVGEGMVFKNTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFT 550
BSNT_00209___ 551 EEQRSKLLITTVGKLVFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLEKGA 600
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RBAM_001330__ 551 EEQRSKLLITTVGKLVFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLDKGA 600
BSNT_00209___ 601 DVKAVIAQQPINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKY 650
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RBAM_001330__ 601 DVKAVIAEQPINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFRY 650
BSNT_00209___ 651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQSKVDNVMKQFRRGLITEEERYER 700
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RBAM_001330__ 651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQSKVDNVLKQFRRGLITEEERYER 700
BSNT_00209___ 701 VISIWSAAKDVIQGKLMKSLDELNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL 750
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RBAM_001330__ 701 VISIWSSAKDVIQGKLMKSLDEVNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL 750
BSNT_00209___ 751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL 800
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RBAM_001330__ 751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL 800
BSNT_00209___ 801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKPLKEGTETIERLEERLIGRFARK 850
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RBAM_001330__ 801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKPLKEGTEIIERLEERLIGRFARK 850
BSNT_00209___ 851 QVKHPETGEVLVNENELIDEDKALEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTPHGVCK 900
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RBAM_001330__ 851 QIKHPETGAVLINENELIDEDKALEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTPHGVCK 900
BSNT_00209___ 901 RCYGRNLATGSDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT 950
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RBAM_001330__ 901 RCYGRNLATGTDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT 950
BSNT_00209___ 951 QGLPRIQELFEARNPKGQATITEIDGTVVEINEVRDKQQEIVVQGAVETR 1000
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RBAM_001330__ 951 QGLPRIQELFEARNPKGQATISEIDGTIAEINEVRDKQQEIVVQGAVETR 1000
BSNT_00209___ 1001 SYTAPYNSRLKVAEGDKIIRGQVLTEGSIDPKELLKVTDLTTVQEYLLHE 1050
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RBAM_001330__ 1001 SYTAPYNSRLKVAEGDQITRGQVLTEGSIDPKELLKVTDLTTVQEYLLHE 1050
BSNT_00209___ 1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTDVLPGTLLDIHQFT 1100
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RBAM_001330__ 1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTDVLPGTLLDIHQFT 1100
BSNT_00209___ 1101 EANKKVLLEGNRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA 1150
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RBAM_001330__ 1101 EANKKVLLEGNRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA 1150
BSNT_00209___ 1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMMKYRKVKPVSNVQPTDDMVPVE 1199
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RBAM_001330__ 1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMMNYRKVKPVSNVQPTEDMVPAE 1199
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