Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03924 and BSU27080
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03924 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:23:04
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03924___levR.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU27080___levR.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03924___levR-BSU27080___levR.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03924___levR-BSU27080___levR.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03924___levR
# 2: BSU27080___levR
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2808
# Identity: 2784/2808 (99.1%)
# Similarity: 2784/2808 (99.1%)
# Gaps: 0/2808 ( 0.0%)
# Score: 13824.0
#
#
#=======================================
BSNT_03924___ 1 GTGAGAAGAATAGATAAAATATACCATCAGCTCAAGCATAATTTTCATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1 GTGAGAAGAATAGATAAAATATACCATCAGCTCAAGCATAATTTTCATGA 50
BSNT_03924___ 51 TTCAACCTTAGATCATCTTTTAAAAATACAAGGGAATTCAGCAAAGGAGA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 51 TTCAACCTTAGATCATCTTTTAAAAATACAAGGGAATTCAGCAAAGGAGA 100
BSNT_03924___ 101 TTGCCGAGCAGCTGAAAATGGAGCGGTCCAATGTCAGCTTTGAATTGAAC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 101 TTGCCGAGCAGCTGAAAATGGAGCGGTCCAATGTCAGCTTTGAATTGAAC 150
BSNT_03924___ 151 AATCTCGTCCGGTCCAAAAAGGTCATCAAAATTAAAACGTTTCCTGTAAG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU27080___le 151 AATCTCGTCCGGTCCAAAAAGGTCATCAAAATTAAAACATTTCCTGTAAG 200
BSNT_03924___ 201 ATACATCCCAGTCGAGATAGCAGAAAAATTATTCAACAAGAAATGGGATA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 201 ATACATCCCAGTCGAGATAGCAGAAAAATTATTCAACAAGAAATGGGATA 250
BSNT_03924___ 251 CAGAGATGATGGAAGTGAAAGACCTTCAGGCGTTTTCCGGAAATTCAAAG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 251 CAGAGATGATGGAAGTGAAAGACCTTCAGGCGTTTTCCGGAAATTCAAAG 300
BSNT_03924___ 301 CAAAATCATCAACACATTTCCACGAATCCCCTAGAGCTTATGATAGGGGC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 301 CAAAATCATCAACACATTTCCACGAATCCCCTAGAGCTTATGATAGGGGC 350
BSNT_03924___ 351 AAAAGGGAGTTTGAAGAAAGCGATCTCCCAGGCAAAAGCAGCTGTCTTTT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 351 AAAAGGGAGTTTGAAGAAAGCGATCTCCCAGGCAAAAGCAGCTGTCTTTT 400
BSNT_03924___ 401 ATCCGCCGACCGGTCTGCATATGCTCCTCCTAGGGCCGACTGGTTCCGGT 450
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 401 ATCCGCCGAACGGTCTGCATATGCTCCTCCTAGGGCCGACTGGTTCCGGT 450
BSNT_03924___ 451 AAATCCCTTTTTGCGAACCGAATTTACCAGTTTGCCATTTACTCTGACAT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 451 AAATCCCTTTTTGCGAACCGAATTTACCAGTTTGCCATTTACTCTGACAT 500
BSNT_03924___ 501 ATTGAAGGCCGGCGCACCATTTATTACATTTAACTGTGCAGACTACTACA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 501 ATTGAAGGCCGGCGCACCATTTATTACATTTAACTGTGCAGACTACTACA 550
BSNT_03924___ 551 ACAATCCTCAATTATTGCTTTCTCAATTATTCGGACACAAAAAAGGTTCA 600
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 551 ACAACCCTCAATTATTGCTTTCTCAATTATTCGGACACAAAAAAGGTTCA 600
BSNT_03924___ 601 TTTACAGGTGCTGCCGAGGATAAGGCGGGTTTAGTCGAACAGGCCAATGG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 601 TTTACAGGTGCTGCCGAGGATAAGGCGGGTTTAGTCGAACAGGCCAATGG 650
BSNT_03924___ 651 GGGCATTCTTTTTATGGATGAAATCCACCGTCTCCCTCCCGAGGGACAAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 651 GGGCATTCTTTTTATGGATGAAATCCACCGTCTCCCTCCCGAGGGACAAG 700
BSNT_03924___ 701 AAATGCTGTTTTATTTTATTGACAGCGGTTCTTATAACAGGCTTGGAGAA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 701 AAATGCTGTTTTATTTTATTGACAGCGGTTCTTATAACAGGCTTGGAGAA 750
BSNT_03924___ 751 TCTGAACATAAACGAACATCGAACGTATTGTTTATTTGTGCGACTACAGA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 751 TCTGAACATAAACGAACATCGAACGTATTGTTTATTTGTGCGACTACAGA 800
BSNT_03924___ 801 AAATCCGAGTTCTGCACTATTGAAAACGTTTTTGCGAAGAATCCCAATGA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 801 AAATCCGAGTTCTGCACTATTGAAAACGTTTTTGCGAAGAATCCCAATGA 850
BSNT_03924___ 851 CCATACATATTCCTTCGCTTGAAGAACGATCACTTAAAGAAAGAGTGGAT 900
||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
BSU27080___le 851 CCATTCATATTCCTTCGCTTGAAGAACGATCGCTTAATGAAAGAGTGGAT 900
BSNT_03924___ 901 CTGACGACGTTTTTATTAGGGAAAGAAGCAGAGCGAATTAAGAAGAATCT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 901 CTGACGACGTTTTTATTAGGGAAAGAAGCAGAGCGAATTAAGAAGAATCT 950
BSNT_03924___ 951 GAGTGTGCATATCGATGTCTATAATGCGCTTATTCACTCTGCGAAATTTG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 951 GAGTGTGCATATCGATGTCTATAATGCGCTTATTCACTCTGCGAAATTTG 1000
BSNT_03924___ 1001 GGAATGTCGGACAGCTGAAATCAAATGTCCAGTTAGTTTGCGCACACGGA 1050
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1001 GGAATGTCGGACAGCTGAAATCAAATGTTCAGTTAGTTTGCGCACACGGA 1050
BSNT_03924___ 1051 TTTTTGCATAACCTTGACAGAAATGAAGTTATTGAACTGACTGTTCGCGA 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1051 TTTTTGCATAACCTTGACAGAAATGAAGTTATTGAACTGACTGTTCGCGA 1100
BSNT_03924___ 1101 TCTGCCTGATGAAATCAAGCAAGAATGGATGTCCAGCAGCAAAAACATGC 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1101 TCTGCCTGATGAAATCAAGCAAGAATGGATGTCCAGCAGCAAAAACATGC 1150
BSNT_03924___ 1151 AAAGAAGCAAAGCCATTTCTGAATATGTCAATATTACAACGATTATCTCT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1151 AAAGAAGCAAAGCCATTTCTGAATATGTCAATATTACAACGATTATCTCT 1200
BSNT_03924___ 1201 CCGATTGTAGAAGATGAAACAACAAAAATTGACGAAGACCTCTCATTTAA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1201 CCGATTGTAGAAGATGAAACAACAAAAATTGACGAAGACCTCTCATTTAA 1250
BSNT_03924___ 1251 CTTATATCATTTGATTGAGGAAAAAGTGAAAACGCTTATGAAAGAAGGTT 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1251 CTTATATCATTTGATTGAGGAAAAAGTGAAAACGCTTATGAAAGAAGGTT 1300
BSNT_03924___ 1301 TATCCAAAAAGGATATTAACCAGTACATCTTGACTGATGTCCATTTGCAT 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1301 TATCCAAAAAGGATATTAACCAGTACATCTTGACTGATGTCCATTTGCAT 1350
BSNT_03924___ 1351 GTCAGAAGTTTTTTTCATCATCAAGCTTTTCAAAAAGACAACCTGCTGAC 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1351 GTCAGAAGTTTTTTTCATCATCAAGCTTTTCAAAAAGACAACCTGCTGAC 1400
BSNT_03924___ 1401 ATTCGTTGAAGATGATGTGATTCAAATGACAAAACAGTTAAAAGAAATAG 1450
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1401 ATTCGTTGAAGACGATGTGATTCAAATGACAAAACAGTTAAAAGAAATAG 1450
BSNT_03924___ 1451 CTGAACATGAGCTGGATTGCACATTTGACCGTAAGTTTATTTATTTCTTG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1451 CTGAACATGAGCTGGATTGCACATTTGACCGTAAGTTTATTTATTTCTTG 1500
BSNT_03924___ 1501 AGTATGCATATTGACGCATTTTTAAAGCGAGGAAAGCAAATTGATGTTTT 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1501 AGTATGCATATTGACGCATTTTTAAAGCGAGGAAAGCAAATTGATGTTTT 1550
BSNT_03924___ 1551 GAATACACAGGAGACAGATGAAATTCGTGATACCCATGTGAAAGAATATC 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1551 GAATACACAGGAGACAGATGAAATTCGTGATACCCATGTGAAAGAATATC 1600
BSNT_03924___ 1601 GGGTGGCGATGATTTTTAAAGATAAAATTCAGGAATATTTTAAAGTGGCT 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1601 GGGTGGCGATGATTTTTAAAGATAAAATTCAGGAATATTTTAAAGTGGCT 1650
BSNT_03924___ 1651 ATTCCTGAAATAGAAGTCATCTACTTAACGATGTTAATTCATTCCATCAA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1651 ATTCCTGAAATAGAAGTCATCTACTTAACGATGTTAATTCATTCCATCAA 1700
BSNT_03924___ 1701 ATCGTTAAAGGAGAACAAAAGAGTCGGTATTATCGTGGCTGCTCATGGAA 1750
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU27080___le 1701 ATCGTTAAAGGAGAACAAAAGAGTCGGTATTATCGTGGCAGCTCATGGAA 1750
BSNT_03924___ 1751 ACAGCACGGCGAGTTCAATGGTTGAAGTCGCGACAGAACTGCTGGGGAGT 1800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU27080___le 1751 ACAGCACGGCGAGTTCAATGGTTGAAGTCGCGACAGAACTGCTAGGGAGT 1800
BSNT_03924___ 1801 ACGCCGATTGCAGCAGTTGACATGCCGCTTACTGTTTCACCTTCGGACAT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1801 ACGCCGATTGCAGCAGTTGACATGCCGCTTACTGTTTCACCTTCGGACAT 1850
BSNT_03924___ 1851 TCTTGAATGCGTAGCAGAAAAAATGAAACAGGTTGATGAAGGCGAAGGTG 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU27080___le 1851 TCTTGAATGCGTAGCAGAAAAAATGAAACAGGTTGATGAAGGTGAAGGTG 1900
BSNT_03924___ 1901 TTTTAATGCTGGTAGATATGGGGTCGCTTGCAATGCTGGAAAGCAGGCTG 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1901 TTTTAATGCTGGTAGATATGGGGTCGCTTGCAATGCTGGAAAGCAGGCTG 1950
BSNT_03924___ 1951 GAGGAAAAGACAGGCATCTCTATTAAAACGATCAGCAATGTTACGACTTC 2000
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 1951 GAGGAAAAGACAGGCATTTCTATTAAAACGATCAGCAATGTTACGACTTC 2000
BSNT_03924___ 2001 AATGGTGCTGGATGCTGTCAGAAAGGTCAACTATTTGAATTTAAATTTGC 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2001 AATGGTGCTGGATGCTGTCAGAAAGGTCAACTATTTGAATTTAAATTTGC 2050
BSNT_03924___ 2051 ATGCGATCTATCAATCGGTCACGAAGGATTTTATCGAGTTGTGGGAGCGT 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2051 ATGCGATCTATCAATCGGTCACGAAGGATTTTATCGAGTTGTGGGAGCGT 2100
BSNT_03924___ 2101 CAGCCAGCGGCACCCGGCAAAAAGAAGGCATTGGTATCCATCTGCACCAC 2150
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU27080___le 2101 CAGCCAGCGGCATCCGGCAAAAAGAAGGCATTGGTATCCATCTGCACGAC 2150
BSNT_03924___ 2151 GGGGAGCGGGACGGCCAAAAAGCTGGAAGACATTCTAACCACGATCGTAA 2200
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2151 GGGTAGCGGAACGGCCAAAAAGCTGGAAGACATTCTAACCACGATCGTAA 2200
BSNT_03924___ 2201 ACAAGGCCTCCGATACACCGATTCACATATTGACCGTATCATCGATTAAG 2250
||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2201 ACAAGGCCTCCGATACCCCCATTCACATATTGACCGTATCATCGATTAAG 2250
BSNT_03924___ 2251 CTGGCCAACAGCATAAAAGAAATCGAAAAAGAGTATGAAATCCTTGCGAC 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2251 CTGGCCAACAGCATAAAAGAAATCGAAAAAGAGTATGAAATCCTTGCGAC 2300
BSNT_03924___ 2301 AGTCGGAACGAAAGACCCTAAAATCAATGCTCCGCATGTATCTTTAGAAG 2350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2301 AGTCGGAACGAAAGACCCTAAAATCAATGCTCCGCATGTATCTTTAGAAG 2350
BSNT_03924___ 2351 TGTTAATTGAAGGGGAGGGAGAGAAGCTGATTCAACAGGCGATTACAAAA 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2351 TGTTAATTGAAGGGGAGGGAGAGAAGCTGATTCAACAGGCGATTACAAAA 2400
BSNT_03924___ 2401 GGAAGCATCCCCTTGAGCAATGGATTGAACGAAGCAAATATGATTGTCAG 2450
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU27080___le 2401 GGAAGCATCTCCTTGAGCAATGGATTGAACGAAGCAAATATTATTGTCAG 2450
BSNT_03924___ 2451 GGAGCTTTGCGAGGATAGCCTGAAAAAATACCTTGTCTTCTTGAATCCCC 2500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2451 GGAGCTTTGCGAGGATAGCCTGAAAAAATACCTTGTCTTCTTGAATCCCC 2500
BSNT_03924___ 2501 ATCATGTGATCGAAATGTTATTGGAGTGGCTGCAAACCGTTCAAGATGAG 2550
|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU27080___le 2501 ACCATGTGATCGACATGTTATTGGAGTGGCTGCAAACCGTTCAGGATGAG 2550
BSNT_03924___ 2551 CTGGGGGTCATTTTCAATAATGCGGTTTTGATCAAAGTCATTATGCACAC 2600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2551 CTGGGGGTCATTTTCAATAATGCGGTTTTGATCAAAGTCATTATGCACAC 2600
BSNT_03924___ 2601 GGCTTTCGCCTTTGAAAGGGTAATTAAGCAAAATCCGATCGCTTTCTCAG 2650
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU27080___le 2601 GGCTTTCGCCTTTGAAAGGGTAATTAAGCAGAATCCGATCGCTTTCTCAG 2650
BSNT_03924___ 2651 AGGAAGAAGAGATCAATGATCAGCTGAAGGAAATGGTGTACGTGACAGAG 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2651 AGGAAGAAGAGATCAATGATCAGCTGAAGGAAATGGTGTACGTGACAGAG 2700
BSNT_03924___ 2701 CGAACATTAGCCCCTTATGAAGAAAAGCTCGGACTTCGCATAAGTGATGA 2750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2701 CGAACATTAGCCCCTTATGAAGAAAAGCTCGGACTTCGCATAAGTGATGA 2750
BSNT_03924___ 2751 TGAAAAATTATTTATAGCCGCCATATTTGCTGAAGAAGTGCATGGCCAGC 2800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27080___le 2751 TGAAAAATTATTTATAGCCGCCATATTTGCTGAAGAAGTGCATGGCCAGC 2800
BSNT_03924___ 2801 TGTTTTAA 2808
||||||||
BSU27080___le 2801 TGTTTTAA 2808
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.